首个沃斯古菌门古菌病毒基因组的发现

古菌作为细菌和真核生物之外的第三大生命域,广泛分布于陆生、水生甚至肠道等环境中。迄今为止,有关其病毒的研究依然十分薄弱。通过深度分析滴水湖宏病毒组数据,并结合tRNA基因匹配的方法,对其中的古菌病毒进行了探索。结果表明,发现了一条沃斯古菌门(Candidatu sWoesearchaeota)古菌病毒基因组序列,长度为23340bp,其tRNA基因序列与宿主的具有100%的一致性,将之命名为Candidatus Woesearchaeota Phage DSL-JZ1,简称DSL-JZ1。基因组注释结果显示,DSL-JZ1除了编码多个沃斯古菌的同源蛋白,还包括尾钉蛋白(tail spikeprotein)、尾丝蛋白(tailfiberprotein)以及裂解酶等有尾病毒目病毒结构和毒力基因。基因组共享基因网络分析证明,DSL-JZ1与目前已知的所有古菌病毒间,包括头尾结构的古菌病毒,缺乏明显的亲缘性。结果揭示DSL-JZ1代表着一个全新的、感染沃斯古菌门古菌的、具有头尾结构的、源自我国淡水湖泊的水生古菌病毒。

岩溶环境古菌的研究进展

岩溶环境是一类具有特殊水文和水质特征的环境,蕴含着丰富的水资源同时具有重要的生态功能。微生物对岩溶环境水质具有重要的影响,然而作为地球微生物群体重要组成的古菌,相关研究报道十分有限。本文综述了近20年有关岩溶环境古菌的研究论文,总结了已报道的岩溶环境中古菌的群落组成和数量分布特征,探讨了当前岩溶环境古菌研究的现状和存在的问题,并对将来岩溶环境古菌的研究方向进行了展望。