氟虫腈与斑马鱼GABAA及果蝇RDL受体作用的差异性研究

采用同源建模的方法构建了斑马鱼γ-氨基丁酸A型（GABAA）受体和果蝇RDL（resistance to dieldrin）受体跨膜区的三维结构，研究了氟虫腈在两个受体中作用位点的差异；采用分子对接和分子动力学方法，探讨了氟虫腈与斑马鱼GABAA受体和果蝇RDL受体的结合模式，并比较了氟虫腈与两个受体作用的差异性。结果表明：斑马鱼 GABAA受体和氟虫腈作用位点的结构与果蝇RDL受体和氟虫腈作用位点的结构存在一定的差异，果蝇 RDL 受体中的 Ala301对应斑马鱼GABAA受体α1亚基中的Val284和γ2亚基中的Ser306，氨基酸构象的差异较大；氟虫腈与斑马鱼GABAA受体的结合位点靠近胞内区一端，而与果蝇RDL受体的结合位点则位于受体第二跨膜区的Ala301～Leu308区域内。复合物分子动力学模拟结果表明，在模拟过程中，两个受体与氟虫腈复合物体系的势能可很快达到平衡状态。斑马鱼GABAA受体与氟虫腈之间形成4个氢键，其中概率大于60％的氢键有2个；而尽管果蝇RDL受体与氟虫腈形成了6个氢键，但只有1个氢键的概率大于50％，其复合物结合的稳定性比前者低。