巴东木莲DNA的提取及SRAP-PCR反应体系的正交优化

研究确定了提取巴东木莲基因组DNA的方法,采用正交试验设计法对影响SRAP-PCR反应的引物浓度、Taq DNA聚合酶的用量、Mg2+和dNTPs浓度及PCR扩增程序中的退火温度及循环次数进行了比较、优化,同时对DNA模板浓度进行了筛选。结果表明,Mg2+、dNTPs、Taq酶及引物的不同水平均对PCR反应结果有显著的影响。建立了巴东木莲20μL SRAP-PCR的反应体系为1×buffer、Mg2+浓度为2.0 mmol·L-1、dNTPs浓度为0.25 mmol·L-1、引物浓度为0.45μmol·L-1、Taq酶为0.5 U和模板DNA 40ng。适宜的扩增程序为94℃预变性1 min,94℃变性1 min,33℃复性1 min,72℃延伸1 min,10个循环;94℃变性1 min,55℃复性1 min,72℃延伸1 min,30个循环;最后72℃延伸5min。试验表明,该体系重复性好、稳定性强。