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基于通路扰动相似性建模的抗类风湿关节炎药对分子协同组合发现及机制分析
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作者 孙继佳 王睿瑞 +2 位作者 张磊 刘保成 吕爱平 《世界科学技术-中医药现代化》 CSCD 北大核心 2021年第6期2023-2035,共13页
目的类风湿关节炎(Rheumatoid Arthritis,RA)是一种发生在滑膜关节及其他器官系统的慢性进行性自身免疫性疾病,中医药治疗类风湿关节炎历史悠久,积累了丰富的临床应用经验,药对是中医临床遣药组方常用的配伍形式,如何从分子机制角度深... 目的类风湿关节炎(Rheumatoid Arthritis,RA)是一种发生在滑膜关节及其他器官系统的慢性进行性自身免疫性疾病,中医药治疗类风湿关节炎历史悠久,积累了丰富的临床应用经验,药对是中医临床遣药组方常用的配伍形式,如何从分子机制角度深入探索和发现药对中的不同成分之间的协同组合机制,目前还没有较为有效的定量研究方法。方法通过GEO差异基因分析筛选RA关键基因,并整合已知RA疾病相关靶点信息,利用STRING构建RA疾病PPI网络;选取两种经典药对:独活-桑寄生、黄柏-苍术,使用TCMID、ETCM数据库收集并整理两种药对的主要化学成分,预测并识别出药对中所有成分作用的潜在RA靶点;同时,提出基于通络扰动相似性的建模方法,挖掘药对中具有协同治疗作用的中药小分子组合,并对所作用靶点集进行GO功能注释与KEGG通路富集分析。结果通过GEO差异基因分析及TTD、DrugBank数据库收集与整理,共得到555个与RA相关的靶点基因;通过靶点预测与识别,获得独活-桑寄生药对53个成分及其作用的52个潜在RA靶点,黄柏-苍术药对得到32个成分及28个靶点;利用基于通路扰动相似性的计算方法,发现了独活-桑寄生中15对、黄柏-苍术中17对具有协同性的小分子组合。结论本文提出的基于通路扰动相似性的计算方法,能够阐明有效中药成分在治疗RA中存在的通路协同组合特征,从一个全新角度揭示了中药药对配伍的内在机制和规律,为后续深入研究打下扎实的基础。 展开更多
关键词 类风湿关节炎 中药药对 差异基因分析 PPI网络 分子指纹 GO功能 KEGG通路富集
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基于网络药理学研究活血调脂方对糖尿病性脂肪肝糖脂代谢的作用 被引量:2
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作者 周涛涛 徐定昌 +3 位作者 平菁 张春枚 孙继佳 王雨秾 《中成药》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期1993-1999,共7页
目的 基于网络药理学分析活血调脂方对糖尿病性脂肪肝的通路调节机制,并通过体外实验对关键通路进行验证。方法 收集活血调脂方的化学成分并通过SwissADME筛选出有效成分,对有效成分进行靶点预测;从DisGeNET、DrugBank、OMIM、TTD获得... 目的 基于网络药理学分析活血调脂方对糖尿病性脂肪肝的通路调节机制,并通过体外实验对关键通路进行验证。方法 收集活血调脂方的化学成分并通过SwissADME筛选出有效成分,对有效成分进行靶点预测;从DisGeNET、DrugBank、OMIM、TTD获得与糖尿病性脂肪肝有关的疾病基因;构建有效成分-靶点-疾病网络图,对靶点基因进行GO功能和KEGG富集分析,并对关键成分和靶点进行分子对接验证。基于靶点基因在通路中的分布,用活血调脂方干预HepG2细胞疾病模型进行体外验证。结果 KEGG富集得到的非酒精性脂肪性肝病、胰岛素抵抗、PPAR信号通路与疾病关系最密切。分子对接显示关键成分和靶点结合稳固。体外实验显示,与模型组比较,活血调脂方能增加细胞葡萄糖消耗(P<0.05),改善胰岛素敏感性(P<0.05),降低TG水平(P<0.05),减少脂质沉积,降低p-IRS-1、SREBP-1C、SOCS-3蛋白表达(P<0.05),升高p-Akt、p-GSK-3β、Adiponectin、PPARγ蛋白表达(P<0.05)。结论 活血调脂方通过IRS-1/AKT/GSK-3β信号通路改善胰岛素信号传导,并且通过下调SREBP-1C、SOCS-3蛋白表达,上调Adiponectin、PPARγ蛋白表达调节糖脂代谢和改善胰岛素抵抗,进而达到治疗糖尿病性脂肪肝的作用。 展开更多
关键词 活血调脂方 糖尿病性脂肪肝 网络药理学 糖脂代谢 胰岛素抵抗 IRS-1/AKT/GSK-3β信号通路
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公立中医医疗机构评价指标体系构建与云模型评价研究
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作者 张安 刘艺 +7 位作者 赵琨 梁万年 张静 王岗 刘跃华 刘昭 张帆 孙继佳 《中华医院管理杂志》 CSCD 北大核心 2023年第7期515-522,共8页
目的实现我国公立中医医疗机构高质量发展,探讨设计具备可行性和适宜性的评价指标体系,并进行云模型评价。方法运用德尔菲法与层次分析法构建公立中医医疗机构评价指标体系及计算指标权重,然后运用云模型理论对指标体系进行综合评价。... 目的实现我国公立中医医疗机构高质量发展,探讨设计具备可行性和适宜性的评价指标体系,并进行云模型评价。方法运用德尔菲法与层次分析法构建公立中医医疗机构评价指标体系及计算指标权重,然后运用云模型理论对指标体系进行综合评价。结果构建的中医医疗机构指标体系由含5个一级指标12个二级指标的"外部治理"模块和包含9个一级指标62个二级指标的"内部管理"模块构成。该指标体系的云模型为(4.608,1.022,0.151),云图等级在"很好"范围内。结论本研究构建的指标体系相对客观、科学、合理,在保证评价结果准确性和可信性的同时也增加了评价信息,对促进公立中医医疗机构高质量发展具有一定的指导意义。 展开更多
关键词 医院 公立 云模型 德尔菲法 层次分析法
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