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唾液菌群微生物与宿主血脂水平的关联分析
被引量:
2
1
作者
赵芬
晋巧巧
+3 位作者
苑克勇
侯秀秀
黄正蔚
马瑞
《上海交通大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第4期442-447,共6页
目的·分析唾液菌群微生物与宿主血脂水平的相关性。方法·采集114名45~60岁志愿者的唾液菌群样本,提取总DNA,随后应用多聚酶链式反应进行16S rDNA V3-V4区扩增。扩增所得产物经Illumina MiSeq PE300平台测序后,将所得序列进行...
目的·分析唾液菌群微生物与宿主血脂水平的相关性。方法·采集114名45~60岁志愿者的唾液菌群样本,提取总DNA,随后应用多聚酶链式反应进行16S rDNA V3-V4区扩增。扩增所得产物经Illumina MiSeq PE300平台测序后,将所得序列进行操作分类单元(operational taxonomic units,OTUs)聚类、物种注释并将唾液菌群中丰度前50的属与宿主血脂水平作Spearman相关分析,P<0.05记为差异有统计学意义。结果·114名志愿者的唾液菌群样本测序所得平均序列数为(41084±4740)条,聚类所得OTUs数为1153,共注释到23个门、43个纲、89个目、147个科和317个属。门水平和属水平的物种聚类热图示114个唾液菌群样本具有相似的物种组成丰度模式。Spearman相关分析结果显示,在唾液菌群微生物丰度前50的属中,Neisseria spp.的丰度与宿主血清总胆固醇(total cholesterol,TCH)、三酰甘油(triacylglycerol,TAG)和低密度脂蛋白胆固醇(low density lipoprotein cholesterol,LDL-Ch)的水平成负相关;Gemella spp.的丰度与宿主血清TCH、LDL-Ch水平呈正相关;与宿主血清高密度脂蛋白胆固醇水平成负相关的属有Comamonas spp.、Filifactor spp.和Parvimonas spp.。结论·人群中唾液菌群微生物的组成结构具有相对稳定性且与宿主血脂水平相关,可进一步挖掘唾液菌群微生物作为个体脂代谢异常的预警指标。
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关键词
唾液菌群
血脂水平
16S
rDNA测序
Spearman相关分析
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职称材料
题名
唾液菌群微生物与宿主血脂水平的关联分析
被引量:
2
1
作者
赵芬
晋巧巧
苑克勇
侯秀秀
黄正蔚
马瑞
机构
上海交通大学医学院
附属第
九
人民医院
·口腔
医学院
牙体牙髓科
上海交通大学医学院附属第九人民医院·口腔医学院浦东分院
出处
《上海交通大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第4期442-447,共6页
基金
国家自然科学基金(81570964)。
文摘
目的·分析唾液菌群微生物与宿主血脂水平的相关性。方法·采集114名45~60岁志愿者的唾液菌群样本,提取总DNA,随后应用多聚酶链式反应进行16S rDNA V3-V4区扩增。扩增所得产物经Illumina MiSeq PE300平台测序后,将所得序列进行操作分类单元(operational taxonomic units,OTUs)聚类、物种注释并将唾液菌群中丰度前50的属与宿主血脂水平作Spearman相关分析,P<0.05记为差异有统计学意义。结果·114名志愿者的唾液菌群样本测序所得平均序列数为(41084±4740)条,聚类所得OTUs数为1153,共注释到23个门、43个纲、89个目、147个科和317个属。门水平和属水平的物种聚类热图示114个唾液菌群样本具有相似的物种组成丰度模式。Spearman相关分析结果显示,在唾液菌群微生物丰度前50的属中,Neisseria spp.的丰度与宿主血清总胆固醇(total cholesterol,TCH)、三酰甘油(triacylglycerol,TAG)和低密度脂蛋白胆固醇(low density lipoprotein cholesterol,LDL-Ch)的水平成负相关;Gemella spp.的丰度与宿主血清TCH、LDL-Ch水平呈正相关;与宿主血清高密度脂蛋白胆固醇水平成负相关的属有Comamonas spp.、Filifactor spp.和Parvimonas spp.。结论·人群中唾液菌群微生物的组成结构具有相对稳定性且与宿主血脂水平相关,可进一步挖掘唾液菌群微生物作为个体脂代谢异常的预警指标。
关键词
唾液菌群
血脂水平
16S
rDNA测序
Spearman相关分析
Keywords
salivary microbiome
blood lipid levels
16S rDNA sequencing
Spearman correlation analysis
分类号
R781.6 [医药卫生—口腔医学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
唾液菌群微生物与宿主血脂水平的关联分析
赵芬
晋巧巧
苑克勇
侯秀秀
黄正蔚
马瑞
《上海交通大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2021
2
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参考文献
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