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一种新的等温单向生长基因合成法初步探索
被引量:
3
1
作者
林继伟
张晓东
+1 位作者
曹雪雁
胡钧
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第6期765-770,共6页
基因合成正日益成为基因获取的一种有效手段。两种常用的基因合成方法是基于PCR的基因合成(P法)和基于连接酶的基因合成(L法)。这两种方法都不是独立于所合成基因的序列内容的。文章首次提出了一种新的基因合成策略-等温单向生长法(Isot...
基因合成正日益成为基因获取的一种有效手段。两种常用的基因合成方法是基于PCR的基因合成(P法)和基于连接酶的基因合成(L法)。这两种方法都不是独立于所合成基因的序列内容的。文章首次提出了一种新的基因合成策略-等温单向生长法(Isothermal Unidirectional Elongation Method,IUEM),在3种酶的作用下,DNA链在等温状态下单向串行延伸,直到获得目标基因。由于引物设计成特殊的发夹结构,该方法可以做到合成过程独立于或部分独立于目标基因的序列内容。本文探索了该策略的实验可行性,检测了影响基因合成的各种因素,并利用该方法成功地合成了一段254bp和一段300bp的DNA序列。
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关键词
基因合成
等温
单向
发夹结构
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职称材料
一种基于单分子纳米操纵的有序化测序策略
被引量:
1
2
作者
吕鸣
石宝晨
+3 位作者
李雪玲
吕军鸿
陈润生
胡钧
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2006年第7期660-664,共5页
尽管包括人类在内的许多生物物种的基因组测序工作已经完成,但由于现有测序技术的限制,大部分复杂基因组还存在很多大大小小的缺口.缺口的填补以及对其他重复序列区域的测序迫切需要全新的思路和技术.基于在DNA单分子定位切割和拾取方...
尽管包括人类在内的许多生物物种的基因组测序工作已经完成,但由于现有测序技术的限制,大部分复杂基因组还存在很多大大小小的缺口.缺口的填补以及对其他重复序列区域的测序迫切需要全新的思路和技术.基于在DNA单分子定位切割和拾取方面的实验进展,提出了一种基于原子力显微镜纳米操纵技术的单分子有序化测序策略.计算机模拟的结果表明,这一方法和策略是可行的,有助于解决目前测序工作中所遇到的一些棘手问题.
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关键词
DNA单分子
原子力显微镜
纳米操纵
有序化测序
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职称材料
题名
一种新的等温单向生长基因合成法初步探索
被引量:
3
1
作者
林继伟
张晓东
曹雪雁
胡钧
机构
上海交通大学
生命科学
技术
学院
中国
科学
院
上海
应用物理
研究
所
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第6期765-770,共6页
基金
国家自然科学基金(编号:10335070
10674147)
+1 种基金
上海市科委创新团队项目和纳米专项(编号:03DZ14025
0652NM006)资助~~
文摘
基因合成正日益成为基因获取的一种有效手段。两种常用的基因合成方法是基于PCR的基因合成(P法)和基于连接酶的基因合成(L法)。这两种方法都不是独立于所合成基因的序列内容的。文章首次提出了一种新的基因合成策略-等温单向生长法(Isothermal Unidirectional Elongation Method,IUEM),在3种酶的作用下,DNA链在等温状态下单向串行延伸,直到获得目标基因。由于引物设计成特殊的发夹结构,该方法可以做到合成过程独立于或部分独立于目标基因的序列内容。本文探索了该策略的实验可行性,检测了影响基因合成的各种因素,并利用该方法成功地合成了一段254bp和一段300bp的DNA序列。
关键词
基因合成
等温
单向
发夹结构
Keywords
gene synthesis
isothermal
unidirectional
hairpin
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
一种基于单分子纳米操纵的有序化测序策略
被引量:
1
2
作者
吕鸣
石宝晨
李雪玲
吕军鸿
陈润生
胡钧
机构
上海交通大学生命科学技术学院bio-x生命科学研究中心
中国
科学
院生物物理
研究
所
中国
科学
院
上海
应用物理
研究
所
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2006年第7期660-664,共5页
基金
国家自然科学基金重点资助项目(10335070)~~
文摘
尽管包括人类在内的许多生物物种的基因组测序工作已经完成,但由于现有测序技术的限制,大部分复杂基因组还存在很多大大小小的缺口.缺口的填补以及对其他重复序列区域的测序迫切需要全新的思路和技术.基于在DNA单分子定位切割和拾取方面的实验进展,提出了一种基于原子力显微镜纳米操纵技术的单分子有序化测序策略.计算机模拟的结果表明,这一方法和策略是可行的,有助于解决目前测序工作中所遇到的一些棘手问题.
关键词
DNA单分子
原子力显微镜
纳米操纵
有序化测序
Keywords
single DNA molecules, atomic force microscopy, nanomanipulation, ordered sequencing strategy
分类号
Q523 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一种新的等温单向生长基因合成法初步探索
林继伟
张晓东
曹雪雁
胡钧
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2007
3
下载PDF
职称材料
2
一种基于单分子纳米操纵的有序化测序策略
吕鸣
石宝晨
李雪玲
吕军鸿
陈润生
胡钧
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2006
1
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职称材料
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