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EBLN2基因对肝癌细胞增殖的抑制作用及其机制
被引量:
2
1
作者
魏岩冰
韩泽广
《山东医药》
CAS
北大核心
2016年第41期6-9,共4页
目的探讨人类内源性非逆转录博纳病毒样核蛋白序列2(EBLN2)基因对肝癌细胞增殖的抑制作用及其机制。方法采用实时定量RT-PCR技术和蛋白印迹技术检测EBLN2基因在肝癌细胞系(Hep G2、SK-hep-1、Huh7、Hep3B、MHCC-97H、PLC/PRF/5、Focus、...
目的探讨人类内源性非逆转录博纳病毒样核蛋白序列2(EBLN2)基因对肝癌细胞增殖的抑制作用及其机制。方法采用实时定量RT-PCR技术和蛋白印迹技术检测EBLN2基因在肝癌细胞系(Hep G2、SK-hep-1、Huh7、Hep3B、MHCC-97H、PLC/PRF/5、Focus、SMMC7721、YY-8103、LO2)和人肝癌组织样本中的表达;选取EBLN2表达水平较低的肝癌细胞株Focus和YY-8103进行外转质粒过表达,Pcmv-EBLN2重组质粒转入肝癌细胞株Focus和YY-8103,24 h观察EBLN2基因过表达对肝癌细胞株细胞增殖、平板克隆形成能力及软琼脂克隆形成能力、细胞周期的影响。结果定量和半定量PCR实验结果表明EBLN2基因在59%的肝癌样本中表达下调,且在10株肝癌细胞系(Hep G2、SK-hep-1、Huh7、Hep3B、MHCC-97H、PLC/PRF/5、Focus、SMMC7721、YY-8103、LO2)中表达水平与正常肝组织相比明显下调,依次下调48%、73%、72%、79%、84%、72%、87%、74%、82%、80%,P均<0.05;PcmvEBLN2质粒转染肝癌细胞株YY-8103和Focus 24 h后,肝癌细胞株YY-8103和Focus的细胞增殖率分别为72.2%、85.0%,平板克隆形成率分别为52.6%、25.6%,软琼脂克隆形成率分别为40.9%、37.5%,与空白对照相比,P均<0.05;肝癌细胞株YY-8103和Focus从G1期进入S期受到抑制。结论 EBLN2基因在肝癌组织中表达下调,其可能通过调节细胞周期抑制肝癌细胞增殖。
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关键词
肝细胞癌
人类内源性非逆转录博纳病毒样核蛋白序列2基因
抑癌基因
细胞增殖
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职称材料
利用定量蛋白组学对脓毒症外周血单个核细胞差异蛋白的研究
被引量:
4
2
作者
童译庆
吴春荣
+3 位作者
刘建军
唐建国
库鑫
严威
《中华急诊医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第11期1251-1259,共9页
目的 探讨基于数据非依赖性采集高分辨率色谱- 质谱技术(data independent acquisition liquid chromatography-mass spectrometry, DIA LC-MS)对于脓毒症外周血差异蛋白研究的可行性。方法 采用前瞻性研究,纳入2016 年4 月至2016 ...
目的 探讨基于数据非依赖性采集高分辨率色谱- 质谱技术(data independent acquisition liquid chromatography-mass spectrometry, DIA LC-MS)对于脓毒症外周血差异蛋白研究的可行性。方法 采用前瞻性研究,纳入2016 年4 月至2016 年7 月复旦大学附属上海市第五人民医院重症监护室(ICU)收治的10 例脓毒症以及10 例同时期入住ICU 年龄性别相仿的术后未并发脓毒症的患者(疾病对照组)。采用最新的数据非依赖性采集技术(data independent acquisition,DIA)联合skyline 数据提取软件对10 例脓毒症和10 例对照组的外周血单个核细胞的蛋白进行研究分析,所得的数据分别采用主成分分析法(principal component analysis,PCA)、偏最小二乘法- 判别分析(partial least squares discriminant analysis,PLS-DA)和正交偏最小二乘法判别分析(orthogonal partial least squares discriminant analysis,OPLS-DA)进行模式识别分析,确定外周血单个核细胞的差异蛋白,进行通路分析以及GO 分析。根据PLS-DA 模型变量的重要性投影(variable importance in the projection, VIP 值)初步筛选可能的蛋白标志物,并对贡献最大(VIP 〉1, P〈0.05)的3 个蛋白进行ELISA 验证和ROC 曲线的分析。结果 总共鉴定到了1 062 个碎片离子加和得到119 个差异蛋白,其中31 个蛋白上调,88 个蛋白下调。通过通路分析发现与碳代谢,血小板激活,细菌侵袭上皮,补体凝血瀑布激活有关。其中高迁移率蛋白1(HMGB-1),中性粒细胞明胶酶相关脂质运载蛋白(NGAL),基质金属蛋白酶8(MMP-8)用ELISA 验证在脓毒症与疾病对照组的外周血单个核细胞表达中差异有统计学意义(P〈0.01)。ROC 曲线下面积均大于0.85,有较好的敏感度和特异度。结论 利用DIA-MS 技术对脓毒症外周血单个核细胞进行研究检测,PLS-DA、OPLS-DA、PCA 模式识别均能用于蛋白组学数据的分析,初步筛选HMGB-1、NGAL、MMP-8 是值得进一步研究的脓毒症外周血单个核细胞候选生物标志物。
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关键词
脓毒症
外周血单个核细胞
数据非依赖性采集
蛋白组学
炎症免疫
原文传递
题名
EBLN2基因对肝癌细胞增殖的抑制作用及其机制
被引量:
2
1
作者
魏岩冰
韩泽广
机构
上海交通大学
医学院
附属瑞金医院
国家人类基因组南方研究中心
上海交通大学系统生物医学院
出处
《山东医药》
CAS
北大核心
2016年第41期6-9,共4页
基金
国家科技重大专项课题(2012zx10001012)
文摘
目的探讨人类内源性非逆转录博纳病毒样核蛋白序列2(EBLN2)基因对肝癌细胞增殖的抑制作用及其机制。方法采用实时定量RT-PCR技术和蛋白印迹技术检测EBLN2基因在肝癌细胞系(Hep G2、SK-hep-1、Huh7、Hep3B、MHCC-97H、PLC/PRF/5、Focus、SMMC7721、YY-8103、LO2)和人肝癌组织样本中的表达;选取EBLN2表达水平较低的肝癌细胞株Focus和YY-8103进行外转质粒过表达,Pcmv-EBLN2重组质粒转入肝癌细胞株Focus和YY-8103,24 h观察EBLN2基因过表达对肝癌细胞株细胞增殖、平板克隆形成能力及软琼脂克隆形成能力、细胞周期的影响。结果定量和半定量PCR实验结果表明EBLN2基因在59%的肝癌样本中表达下调,且在10株肝癌细胞系(Hep G2、SK-hep-1、Huh7、Hep3B、MHCC-97H、PLC/PRF/5、Focus、SMMC7721、YY-8103、LO2)中表达水平与正常肝组织相比明显下调,依次下调48%、73%、72%、79%、84%、72%、87%、74%、82%、80%,P均<0.05;PcmvEBLN2质粒转染肝癌细胞株YY-8103和Focus 24 h后,肝癌细胞株YY-8103和Focus的细胞增殖率分别为72.2%、85.0%,平板克隆形成率分别为52.6%、25.6%,软琼脂克隆形成率分别为40.9%、37.5%,与空白对照相比,P均<0.05;肝癌细胞株YY-8103和Focus从G1期进入S期受到抑制。结论 EBLN2基因在肝癌组织中表达下调,其可能通过调节细胞周期抑制肝癌细胞增殖。
关键词
肝细胞癌
人类内源性非逆转录博纳病毒样核蛋白序列2基因
抑癌基因
细胞增殖
Keywords
hepatocellular carcinoma
endogenous Bornavirus-like nucleoprotein 2
tumor suppressor gene
cell pro-liferation
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
利用定量蛋白组学对脓毒症外周血单个核细胞差异蛋白的研究
被引量:
4
2
作者
童译庆
吴春荣
刘建军
唐建国
库鑫
严威
机构
复旦
大学
附属
上海
市第五人民医院创伤急救危重病
医学
中心
上海交通大学系统生物医学院
出处
《中华急诊医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第11期1251-1259,共9页
基金
上海市卫生和计划生育委员会课题面上项目(201540136)
上海市科委科研项目(18411950600)
文摘
目的 探讨基于数据非依赖性采集高分辨率色谱- 质谱技术(data independent acquisition liquid chromatography-mass spectrometry, DIA LC-MS)对于脓毒症外周血差异蛋白研究的可行性。方法 采用前瞻性研究,纳入2016 年4 月至2016 年7 月复旦大学附属上海市第五人民医院重症监护室(ICU)收治的10 例脓毒症以及10 例同时期入住ICU 年龄性别相仿的术后未并发脓毒症的患者(疾病对照组)。采用最新的数据非依赖性采集技术(data independent acquisition,DIA)联合skyline 数据提取软件对10 例脓毒症和10 例对照组的外周血单个核细胞的蛋白进行研究分析,所得的数据分别采用主成分分析法(principal component analysis,PCA)、偏最小二乘法- 判别分析(partial least squares discriminant analysis,PLS-DA)和正交偏最小二乘法判别分析(orthogonal partial least squares discriminant analysis,OPLS-DA)进行模式识别分析,确定外周血单个核细胞的差异蛋白,进行通路分析以及GO 分析。根据PLS-DA 模型变量的重要性投影(variable importance in the projection, VIP 值)初步筛选可能的蛋白标志物,并对贡献最大(VIP 〉1, P〈0.05)的3 个蛋白进行ELISA 验证和ROC 曲线的分析。结果 总共鉴定到了1 062 个碎片离子加和得到119 个差异蛋白,其中31 个蛋白上调,88 个蛋白下调。通过通路分析发现与碳代谢,血小板激活,细菌侵袭上皮,补体凝血瀑布激活有关。其中高迁移率蛋白1(HMGB-1),中性粒细胞明胶酶相关脂质运载蛋白(NGAL),基质金属蛋白酶8(MMP-8)用ELISA 验证在脓毒症与疾病对照组的外周血单个核细胞表达中差异有统计学意义(P〈0.01)。ROC 曲线下面积均大于0.85,有较好的敏感度和特异度。结论 利用DIA-MS 技术对脓毒症外周血单个核细胞进行研究检测,PLS-DA、OPLS-DA、PCA 模式识别均能用于蛋白组学数据的分析,初步筛选HMGB-1、NGAL、MMP-8 是值得进一步研究的脓毒症外周血单个核细胞候选生物标志物。
关键词
脓毒症
外周血单个核细胞
数据非依赖性采集
蛋白组学
炎症免疫
Keywords
Sepsis
Peripheral blood mononuclear cells
Data independent acquisition
Proteomics
Inflammatory immunity
分类号
R459.7 [医药卫生—急诊医学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
EBLN2基因对肝癌细胞增殖的抑制作用及其机制
魏岩冰
韩泽广
《山东医药》
CAS
北大核心
2016
2
下载PDF
职称材料
2
利用定量蛋白组学对脓毒症外周血单个核细胞差异蛋白的研究
童译庆
吴春荣
刘建军
唐建国
库鑫
严威
《中华急诊医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2018
4
原文传递
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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