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应用高分辨率熔解曲线分析和焦磷酸测序快速筛查线粒体糖尿病MT3243处〉G突变
被引量:
1
1
作者
危新俊
杜秀娟
+1 位作者
王从容
颜景斌
《中华医学遗传学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第4期447-451,共5页
目的建立快速、准确、无创、低成本的线粒体糖尿病MT3243A:〉G位点突变的筛查方法。方法采集上海市儿童医院和上海市第六人民医院确诊的6例线粒体糖尿病患者及50名正常对照的血液、唾液及尿沉渣样本,用焦磷酸测序法进行检测,并比较...
目的建立快速、准确、无创、低成本的线粒体糖尿病MT3243A:〉G位点突变的筛查方法。方法采集上海市儿童医院和上海市第六人民医院确诊的6例线粒体糖尿病患者及50名正常对照的血液、唾液及尿沉渣样本,用焦磷酸测序法进行检测,并比较不同来源样本中MT3243A〉G突变位点的杂合度水平;应用高分辨率熔解曲线(highresolutionmeltingcurveanalysis,HRM)对来自上海市4个社区的1070例糖尿病患者尿沉渣样本中的MT3243A〉G突变位点进行快速筛查,阳性样本进一步采用焦磷酸测序技术进行验证,并定量检测突变位点的杂合度水平。结果对比实验发现,6例线粒体糖尿病患者尿沉渣中MT3243A〉G突变位点的杂合度均高于唾液和血液2~7倍,唾液中突变的杂合度略高于血液;在50名正常对照的血液、唾液及尿沉渣样本中均未检出MT3243A〉G位点突变。在1070例糖尿病尿沉渣样本的筛查实验中,用HRM筛查出2例疑似MT3243A〉G位点突变的样本,经焦磷酸测序验证后确认为MT3243A〉G位点突变,两例患者尿沉渣样本中MT3243A〉G位点杂合度分别为33.32%和14.67%。结论尿沉渣样本取材方便、无创、突变杂合度高,可作为人群中MT3243A〉G位点突变筛查的首选样本。HRM技术使用成本低,可实现点突变的快速筛查。焦磷酸测序技术检测灵敏度高、定量精确。我们将两者的优势相结合,建立了用两步法快速筛查检测线粒体糖尿病MT3243A〉G位点突变的新方法。
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关键词
MT3243A〉G突变
线粒体糖尿病
尿沉渣
高分辨率熔解曲线
焦磷酸测序
快速筛查
原文传递
题名
应用高分辨率熔解曲线分析和焦磷酸测序快速筛查线粒体糖尿病MT3243处〉G突变
被引量:
1
1
作者
危新俊
杜秀娟
王从容
颜景斌
机构
温州医科
大学
检验医学院、生命科学学院
上海交通大学
附属
上海市
儿童
医院、
上海
医学遗传
研究所
上海市
胚胎与生殖工程重点实验室、卫生部医学胚胎分子生物学重点实验室
上海交通大学附属上海市第六人民医院、上海市糖尿病研究所
出处
《中华医学遗传学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第4期447-451,共5页
基金
国家科技支撑计划(2012BA109804)
国家自然科学基金面上项目(81570808)
+2 种基金
卫生行业科研专项(201402018)
上海市卫生系统重要疾病联合攻关项目(2013ZYJB0015)
上海市糖尿病重点实验室开放课题(SHKLI)IKF_1101)
文摘
目的建立快速、准确、无创、低成本的线粒体糖尿病MT3243A:〉G位点突变的筛查方法。方法采集上海市儿童医院和上海市第六人民医院确诊的6例线粒体糖尿病患者及50名正常对照的血液、唾液及尿沉渣样本,用焦磷酸测序法进行检测,并比较不同来源样本中MT3243A〉G突变位点的杂合度水平;应用高分辨率熔解曲线(highresolutionmeltingcurveanalysis,HRM)对来自上海市4个社区的1070例糖尿病患者尿沉渣样本中的MT3243A〉G突变位点进行快速筛查,阳性样本进一步采用焦磷酸测序技术进行验证,并定量检测突变位点的杂合度水平。结果对比实验发现,6例线粒体糖尿病患者尿沉渣中MT3243A〉G突变位点的杂合度均高于唾液和血液2~7倍,唾液中突变的杂合度略高于血液;在50名正常对照的血液、唾液及尿沉渣样本中均未检出MT3243A〉G位点突变。在1070例糖尿病尿沉渣样本的筛查实验中,用HRM筛查出2例疑似MT3243A〉G位点突变的样本,经焦磷酸测序验证后确认为MT3243A〉G位点突变,两例患者尿沉渣样本中MT3243A〉G位点杂合度分别为33.32%和14.67%。结论尿沉渣样本取材方便、无创、突变杂合度高,可作为人群中MT3243A〉G位点突变筛查的首选样本。HRM技术使用成本低,可实现点突变的快速筛查。焦磷酸测序技术检测灵敏度高、定量精确。我们将两者的优势相结合,建立了用两步法快速筛查检测线粒体糖尿病MT3243A〉G位点突变的新方法。
关键词
MT3243A〉G突变
线粒体糖尿病
尿沉渣
高分辨率熔解曲线
焦磷酸测序
快速筛查
Keywords
MT3243A〉G mutation
Mitochondrial diabetes
Urine sediment
High resolutionmelting curve
Pyrosequencing
Rapid screening
分类号
R587.2 [医药卫生—内分泌]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
应用高分辨率熔解曲线分析和焦磷酸测序快速筛查线粒体糖尿病MT3243处〉G突变
危新俊
杜秀娟
王从容
颜景斌
《中华医学遗传学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016
1
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