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基于18F-FDG PET/CT影像组学的非小细胞肺癌病理亚型分类
被引量:
2
1
作者
戴倩
王梦
黄钢
《中国医学物理学杂志》
CSCD
2023年第4期416-422,共7页
目的:旨在建立一种基于18F-FDG PET/CT的临床—影像组学相结合的综合模型用于区分非小细胞肺癌中的腺癌和鳞癌。方法:回顾性收集上海交通大学附属胸科医院120例经病理学验证为腺癌(65例)和鳞癌(55例)的患者,从预处理的CT图像和PET图像...
目的:旨在建立一种基于18F-FDG PET/CT的临床—影像组学相结合的综合模型用于区分非小细胞肺癌中的腺癌和鳞癌。方法:回顾性收集上海交通大学附属胸科医院120例经病理学验证为腺癌(65例)和鳞癌(55例)的患者,从预处理的CT图像和PET图像中分别提取1218、108个影像组学特征,并纳入10个临床特征因素;卡方检验和Wilcoxon检验用于对临床特征进行筛选,并使用Relief算法和最小绝对收缩和选择算子(LASSO)对影像组学特征进行筛选;通过6种机器学习分类器分别建立临床、影像组学、综合模型。通过受试者工作特征(ROC)曲线及曲线下面积(AUC)来评价模型的分类能力。结果:综合模型在训练集和测试集中均表现出最高的AUC值和准确率,其中随机森林(RF)和Bagging分类器表现出的分类效果最佳。经五折交叉验证后,训练集中RF和Bagging的AUC值和准确率分别为0.92±0.03、0.86±0.06和0.92±0.02、0.83±0.02;测试集中RF和Bagging的AUC值和准确率分别为0.92、0.81和0.91、0.86。结论:结合18F-FDG PET/CT临床特征和影像组学特征的分类预测模型可以很好地区分腺癌、鳞癌。
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关键词
影像组学
非小细胞肺癌
18F-FDG
PET/CT
病理亚型
机器学习
下载PDF
职称材料
肺腺癌免疫相关基因预后模型的构建与应用
被引量:
1
2
作者
黄品正
黄钢
《生物技术》
CAS
2022年第3期313-320,共8页
[目的]基于癌症基因图谱(TCGA)数据库和生物信息学方法构建免疫相关基因的肺腺癌患者预后模型。[方法]基于TCGA和IMMPORT数据库对肺腺癌中免疫相关基因进行LASSO-Cox分析构建模型,使用生存分析、ROC曲线分析和C指数(C-index)分析评估模...
[目的]基于癌症基因图谱(TCGA)数据库和生物信息学方法构建免疫相关基因的肺腺癌患者预后模型。[方法]基于TCGA和IMMPORT数据库对肺腺癌中免疫相关基因进行LASSO-Cox分析构建模型,使用生存分析、ROC曲线分析和C指数(C-index)分析评估模型的预测性能,并在cBioPortal数据库下载的数据集中完成模型的外部验证。[结果]基于差异分析和LASSO-Cox筛选,一共得到26个预后免疫相关基因。训练集和验证集中的生存曲线都显示所构建的风险模型能够显著区分患者预后,高风险组患者预后更差。ROC曲线显示风险模型在训练集中预测1、3、5年生存率的曲线下面积(AUC)分别为0.752、0.772、0.736,在验证集中预测1、3、5年生存率的曲线下面积(AUC)分别为0.536、0.692、0.705,模型的C指数为0.715,显著高于第8版AJCC分期系统的C指数0.644。[结论]该模型的C指数显著高于第8版AJCC分期的C指数,能够较准确地预测肺腺癌患者的预后,可能是肺腺癌潜在的预后生物标志物。
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关键词
肺腺癌
癌症基因组图谱
免疫相关基因
预后模型
生物信息学
原文传递
题名
基于18F-FDG PET/CT影像组学的非小细胞肺癌病理亚型分类
被引量:
2
1
作者
戴倩
王梦
黄钢
机构
上海
理工大学
健康
科学与工程
学院
上海
健康
医学院
上海
分子
影像
学
重点
实验室
出处
《中国医学物理学杂志》
CSCD
2023年第4期416-422,共7页
基金
国家自然科学基金(82127807)
上海市分子影像学重点实验室建设项目(18DZ2260400)。
文摘
目的:旨在建立一种基于18F-FDG PET/CT的临床—影像组学相结合的综合模型用于区分非小细胞肺癌中的腺癌和鳞癌。方法:回顾性收集上海交通大学附属胸科医院120例经病理学验证为腺癌(65例)和鳞癌(55例)的患者,从预处理的CT图像和PET图像中分别提取1218、108个影像组学特征,并纳入10个临床特征因素;卡方检验和Wilcoxon检验用于对临床特征进行筛选,并使用Relief算法和最小绝对收缩和选择算子(LASSO)对影像组学特征进行筛选;通过6种机器学习分类器分别建立临床、影像组学、综合模型。通过受试者工作特征(ROC)曲线及曲线下面积(AUC)来评价模型的分类能力。结果:综合模型在训练集和测试集中均表现出最高的AUC值和准确率,其中随机森林(RF)和Bagging分类器表现出的分类效果最佳。经五折交叉验证后,训练集中RF和Bagging的AUC值和准确率分别为0.92±0.03、0.86±0.06和0.92±0.02、0.83±0.02;测试集中RF和Bagging的AUC值和准确率分别为0.92、0.81和0.91、0.86。结论:结合18F-FDG PET/CT临床特征和影像组学特征的分类预测模型可以很好地区分腺癌、鳞癌。
关键词
影像组学
非小细胞肺癌
18F-FDG
PET/CT
病理亚型
机器学习
Keywords
radiomics
non-small-cell lung cancer
18F-FDG PET/CT
pathological subtype
machine learning
分类号
R318 [医药卫生—生物医学工程]
R734.2 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
肺腺癌免疫相关基因预后模型的构建与应用
被引量:
1
2
作者
黄品正
黄钢
机构
上海
理工大学
健康
科学与工程
学院
上海健康医学院上海分子影像重点实验室
出处
《生物技术》
CAS
2022年第3期313-320,共8页
基金
国家自然科学基金项目(81830052)
上海市分子影像学重点实验室建设项目(18DZ2260400)。
文摘
[目的]基于癌症基因图谱(TCGA)数据库和生物信息学方法构建免疫相关基因的肺腺癌患者预后模型。[方法]基于TCGA和IMMPORT数据库对肺腺癌中免疫相关基因进行LASSO-Cox分析构建模型,使用生存分析、ROC曲线分析和C指数(C-index)分析评估模型的预测性能,并在cBioPortal数据库下载的数据集中完成模型的外部验证。[结果]基于差异分析和LASSO-Cox筛选,一共得到26个预后免疫相关基因。训练集和验证集中的生存曲线都显示所构建的风险模型能够显著区分患者预后,高风险组患者预后更差。ROC曲线显示风险模型在训练集中预测1、3、5年生存率的曲线下面积(AUC)分别为0.752、0.772、0.736,在验证集中预测1、3、5年生存率的曲线下面积(AUC)分别为0.536、0.692、0.705,模型的C指数为0.715,显著高于第8版AJCC分期系统的C指数0.644。[结论]该模型的C指数显著高于第8版AJCC分期的C指数,能够较准确地预测肺腺癌患者的预后,可能是肺腺癌潜在的预后生物标志物。
关键词
肺腺癌
癌症基因组图谱
免疫相关基因
预后模型
生物信息学
Keywords
lung adenocarcinoma
TCGA
immune-related genes
prognostic model
bioinformatics
分类号
R734.2 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于18F-FDG PET/CT影像组学的非小细胞肺癌病理亚型分类
戴倩
王梦
黄钢
《中国医学物理学杂志》
CSCD
2023
2
下载PDF
职称材料
2
肺腺癌免疫相关基因预后模型的构建与应用
黄品正
黄钢
《生物技术》
CAS
2022
1
原文传递
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引证文献
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