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猪捷申病毒荧光定量RT-PCR检测方法的建立与应用
被引量:
6
1
作者
王建峰
倪健波
+5 位作者
李如松
张强
杨德全
黄素文
熊炜
李健
《畜牧与兽医》
北大核心
2016年第6期126-129,共4页
参考Gen Bank中猪捷申病毒(PTV)基因序列,通过比对分析,设计引物和Taq Man探针,建立荧光定量RT-PCR检测方法。该方法的最低检测灵敏限度为12.6拷贝/μL,组内组间重复试验的变异系数均小于2%,具有较好的特异性,对猪常见病原如猪瘟病毒、...
参考Gen Bank中猪捷申病毒(PTV)基因序列,通过比对分析,设计引物和Taq Man探针,建立荧光定量RT-PCR检测方法。该方法的最低检测灵敏限度为12.6拷贝/μL,组内组间重复试验的变异系数均小于2%,具有较好的特异性,对猪常见病原如猪瘟病毒、猪传染性胃肠炎病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪圆环病毒和伪狂犬病病毒等均没有特异性扩增。用本研究建立的荧光定量RT-PCR方法检测来自猪场的156份猪粪便,阳性检出率为38.5%,与套式RT-PCR符合率达100%,表明本试验建立的荧光定量RT-PCR方法适用于PTV的快速批量筛检,为PTV感染的流行病学调查提供了必要的技术手段。
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关键词
猪捷申病毒
荧光定量RT—PCR
检测
原文传递
一品红亚属杂草DNA条形码的筛选研究
被引量:
1
2
作者
徐瑛
沈蔚列
+1 位作者
张慧丽
傅怡宁
《植物检疫》
北大核心
2016年第1期21-25,共5页
为筛选可用于一品红亚属植物鉴定的DNA条形码序列,通过比较ITS、ITS2、trn H-psb A、rbc L、ndh F的种内和种间变异,进行Barcoding gap检验和鉴定成功率分析。结果表明:ITS、ITS2和trn H-psb A的种内种间变异数据显示明显好于rbc L、nd...
为筛选可用于一品红亚属植物鉴定的DNA条形码序列,通过比较ITS、ITS2、trn H-psb A、rbc L、ndh F的种内和种间变异,进行Barcoding gap检验和鉴定成功率分析。结果表明:ITS、ITS2和trn H-psb A的种内种间变异数据显示明显好于rbc L、ndh F。在Barcoding gap检验和鉴定效率分析方面,trn H-psb A明显好于其他4个区域,但该区域也存在一些明显的缺点。而ITS2与ndh F的组合序列,明显好于其单条序列,有望成为一品红亚属植物DNA条形码序列。
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关键词
齿裂大戟
DNA条形码
ITS2
TRNH-PSBA
RBCL
NDHF
ITS
原文传递
题名
猪捷申病毒荧光定量RT-PCR检测方法的建立与应用
被引量:
6
1
作者
王建峰
倪健波
李如松
张强
杨德全
黄素文
熊炜
李健
机构
宁波
出入境
检验
检疫
局
技术
中心
上海出入境检验检疫局动植中心
上海
动
物疫病预防控制
中心
出处
《畜牧与兽医》
北大核心
2016年第6期126-129,共4页
基金
国家质检总局项目(2014IK231)
宁波市重大科技专项(2015C110018)
文摘
参考Gen Bank中猪捷申病毒(PTV)基因序列,通过比对分析,设计引物和Taq Man探针,建立荧光定量RT-PCR检测方法。该方法的最低检测灵敏限度为12.6拷贝/μL,组内组间重复试验的变异系数均小于2%,具有较好的特异性,对猪常见病原如猪瘟病毒、猪传染性胃肠炎病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪圆环病毒和伪狂犬病病毒等均没有特异性扩增。用本研究建立的荧光定量RT-PCR方法检测来自猪场的156份猪粪便,阳性检出率为38.5%,与套式RT-PCR符合率达100%,表明本试验建立的荧光定量RT-PCR方法适用于PTV的快速批量筛检,为PTV感染的流行病学调查提供了必要的技术手段。
关键词
猪捷申病毒
荧光定量RT—PCR
检测
分类号
S858.28 [农业科学—临床兽医学]
原文传递
题名
一品红亚属杂草DNA条形码的筛选研究
被引量:
1
2
作者
徐瑛
沈蔚列
张慧丽
傅怡宁
机构
宁波
检验
检疫
技术
中心
宁波检科院
浙江林学院
上海
出入境
检验
检疫
局
动
植
食
中心
出处
《植物检疫》
北大核心
2016年第1期21-25,共5页
基金
国家科技支撑计划(2012BAK11B03)
宁波市科技重大专项(2015C1100118)
文摘
为筛选可用于一品红亚属植物鉴定的DNA条形码序列,通过比较ITS、ITS2、trn H-psb A、rbc L、ndh F的种内和种间变异,进行Barcoding gap检验和鉴定成功率分析。结果表明:ITS、ITS2和trn H-psb A的种内种间变异数据显示明显好于rbc L、ndh F。在Barcoding gap检验和鉴定效率分析方面,trn H-psb A明显好于其他4个区域,但该区域也存在一些明显的缺点。而ITS2与ndh F的组合序列,明显好于其单条序列,有望成为一品红亚属植物DNA条形码序列。
关键词
齿裂大戟
DNA条形码
ITS2
TRNH-PSBA
RBCL
NDHF
ITS
Keywords
Euphorbia dentata
DNA barcoding
ITS2
trnH-psbA
rbcL
ndhF
ITS
分类号
S41-30 [农业科学—植物保护]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
猪捷申病毒荧光定量RT-PCR检测方法的建立与应用
王建峰
倪健波
李如松
张强
杨德全
黄素文
熊炜
李健
《畜牧与兽医》
北大核心
2016
6
原文传递
2
一品红亚属杂草DNA条形码的筛选研究
徐瑛
沈蔚列
张慧丽
傅怡宁
《植物检疫》
北大核心
2016
1
原文传递
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