一条脑胶质瘤相关的全长基因的生物信息学分析

目的报道一条脑胶质瘤相关的全长新基因的生物信息学分析及其研究的结果。方法对507E08克隆子进行了测序,生物信息学分析和Northern blot分析。结果507E08基因为全长基因,长度为2002bp,共编码203个氨基酸,命名为人核糖体蛋白L14·22。经Northern blot证实507E08基因在人正常脑组织中低表达,而在人脑胶质瘤中高表达。结论生物信息学是一种有效分析未知基因的工具。507E08基因可能是与人脑胶质瘤形成有关的一条全长新基因。

一条人脑胶质瘤相关新基因的克隆与表达

目的运用基因芯片技术获取正常成人脑组织与人脑胶质瘤中差异表达的基因,并对其中一条与脑胶质瘤相关的新基因进行了克隆和表达的研究。方法抽提正常成人脑组织与人脑胶质瘤组织中的mRNA来制备探针,经杂交、洗涤后,通过计算机观察二者表达谱的差异情况,对 681F05克隆子进行了Northern blot,生物信息学分析和蛋白质的表达。结果通过四次基因芯片筛选,获得15条与胶质瘤相关的新基因,经northern blot证实681F05基因在人正常脑组织中低表达, 而在人脑胶质瘤中高表达。BLASTn和BLASTx分析显示,它们编码蛋白与线虫Cyp-10蛋白同源性分别为52％和72％。cDNA序列分析发现这两个克隆是同一个基因[命名为cyclophilin—like gene (PPIL3)]的两个不同的剪切体(PPIL3a和PPIL3b)。并在大肠杆菌中得到了PPIL3a和PPIL3b与 GST较好表达的融合蛋白。结论基因芯片筛选正常脑组织与人脑胶质瘤差异表达的基因具有样品用量少,高质量,高速度,高敏感等特性。681F05基因可能是与人脑胶质瘤形成有关的一条全长新基因。

人脑胶质瘤差异表达的基因的获得及一条全长新基因的克隆

目的运用基因芯片技术获取正常成人脑组织与人脑胶质瘤中差异表达的基因,并对其中一条基因进行了初步的研究。方法抽提正常成人脑组织与人脑胶质瘤组织中的mRNA来制备探针,经杂交、洗涤后,通过计算机观察两者表达谱的差异情况,对681F05克隆子进行了Northernblot,5’RACE和生物信息学分析。结果通过4次基因芯片筛选,获得15条与胶质瘤相关的新基因,经Northernblot证实681F05基因在人正常脑组织中低表达,而在人脑胶质瘤中高表达。BLASTn和BLASTx分析显示,它们编码蛋白与线虫Cyp10蛋白同源性分别为52%和72%。cDNA序列分析发现这两上克隆是同一个基因[命名为cyclophilinlikegene(PPIL3)]的两个不同的剪切体(PPIL3a和PPIL3b)。结论基因芯片筛选正常脑组织与人脑胶质瘤差异表达的基因具有样品用量少,高质量,高速度,高敏感等特性。681F05基因可能是与人脑胶质瘤形成有关的一条全长新基因。

脑胶质瘤中全长新基因PKIβ的克隆与表达

目前世界上在不同组织或不同病理样本中获取差异表达基因的方法有很多种。在各种技术中诸如：差异显示技术，只适用于少量样本，同时跑电泳的工作相当辛苦，并受限于一次电泳样品数量，而高密度的基因芯片，一次就能完成大量样本的基因表达水平上的筛选工作。

脑胶质瘤相关新基因PKIβ的表达与蛋白质性质的研究

目的运用基因芯片技术获取正常成人脑组织与人脑胶质瘤中差异表达的基因，并对其中1条基因进行了克隆和表达。方法抽提正常成人脑组织与脑胶质瘤组织中的mRNA来制备探针，经杂交、洗涤后，通过计算机观察二者表达谱的差异情况，对436F11克隆子进行Northern印迹，生物信息学分析和蛋白质的表达。结果通过4次基因芯片筛选，获得15条与胶质瘤相关的新基因，经Northern印迹证实436F11基因在人正常脑组织中高表达，而在人脑胶质瘤中低表达。BLASTn和BLASTx分析显示，436F11基因为全长新基因，共编码78个氨基酸，其理论相对分子质量为8468等电点为4．69，与鼠PKIβ69％同源，命名为人PKIβ。并在大肠杆菌中得到了PKIβ较高的表达蛋白，经纯化，在SDS—PAGE胶上获得了1条清晰的条带。氨基酸测序和分子量测定与生物信息学结果完全一致。结论基因芯片筛选正常脑组织与人脑胶质瘤差异表达的基因具有样品用量少，高质量，高速度，高敏感等特性。人PKIβ可能是与人脑胶质瘤形成有关的1条全长新基因，这为脑胶质瘤的基因治疗提供了一条新思路。

人脑胶质瘤中全长新基因PPIL3的生物信息学研究

目的应用基因芯片技术获取正常成人脑组织与人脑胶质瘤中差异表达的基因，并对其中1条基因进行初步研究。方法抽提正常成人脑组织与人脑胶质瘤组织中的mRNA制备探针，经杂交、洗涤后，通过计算机观察两者表达谱的差异，对681F05克隆子进行Northernblot和生物信息学分析。结果通过4次基因芯片筛选，获得15条与胶质瘤相关的新基因，经Northernblot证实681F05基因在人正常脑组织中低表达，而在人脑胶质瘤中高表达。BLASTn和BLASTx分析显示，它们编码蛋白与线虫Cyp-10蛋白同源性分别为52％和72％。cDNA序列分析发现此两个克隆是同一个基因[命名为cyclophilin．1ikegene（PPIL3）]的两个不同的剪切体（PPIL3a和PPIL3b）。结论基因芯片筛选正常脑组织与人脑胶质瘤差异表达的基因具有样品用量少、高质量、高速度、高敏感等特性。681F05基因可能是与人脑胶质瘤形成有关的一条全长新基因。