达尔文力学:统计力学的动力学基础

受生物启发而建立的达尔文力学或演化力学可作为期待已久的统计力学的普运动力学基础,对于体系自由度从N=∞到N=1都适用。

纯粹的探索:索利斯是践行科学精神的榜样

2016年诺贝尔物理学奖授予戴维·索利斯（David J．Thouless）、邓肯·霍尔丹（F．Duncan M．Haldane）、迈克尔·科斯特利兹（J．Michael Kosterlitz）（图1），对他们不平常物质形态及其转化探索的赞赏实至名归，从物理学本身的发展状况表彰时机也很恰当：相应领域正处于蓬勃发展中。

干细胞处于所有癌症的中心吗？

干细胞和癌细胞是细胞众多状态中的一部分,这个事实说明干细胞不会处于所有癌症的中心,但会是癌症发生发展的一个重要因素.近年来更多的生物实验研究和医学临床观察也充分支持这个结论.干细胞与癌症的关系是关于细胞形态维持与转化——生物的中心问题之一.通过分析干细胞和癌症在3种层次-现象、分子生物标志、系统生物机理-中的关系,21世纪内发展起来的内源性网络理论可以作为一个全新的、综合性的思考平台.它能定量地刻画细胞状态的稳定性和相互转化的动态路径,把遗传和表观遗传现象的描述统一在同一个理论中,能更好地理解目前对这个问题研究的热潮下的生物学意义并能在理论和计算上帮助它向前推进.所有这些进展都指向一个可能:革命性的突破就在我们眼前.

大卫·邵勒斯的治学和建树:纯粹探索凌绝顶

大卫·邵勒斯（David J.Thouless）对很多重要物理问题有深入的思考,他在同行中有理论物理学家中的理论家称誉.2016年诺贝尔物理学奖授予他和邓肯·霍尔丹（F.Duncan M.Haldane）、迈可·科斯特里兹（J.Michael Kosterlitz）,对他们物质形态及其转化探索的嘉奖实至名归,从物理学本身的发展状况表彰时机也很恰当：相应领域正处于蓬勃发展中.

物理基本力学理论的三足鼎立:已完成的追求?——评《溯源探幽:熵的世界》

从上个世纪末以来,我一直工作在物理、生物、工程、医学等学科之间,对有意理解物理学核心内容的其他学科的研究者和学生,我总是一致地推荐两个领域：经典力学和统计物理。理由很简单：从伽利略（Galileo）和牛顿（Newton）开始的力学是所有科学的范本;热力学和统计力学是不同层次理论对接的范本,联系了微观和宏观两种描述。两个领域的风格很不一样。

粗粒内源性网络可预测血液系统髓系细胞分化和转分化的主要时序特征

揭示细胞命运决定过程中的分子调控机制对理解干细胞分化和组织稳态的建立和维持具有决定性的意义.本文通过归纳从机制研究中积累的分子调控关系,构建了血液系统髓系细胞分化相关的粗粒化内源性网络.通过对网络动力学进行定量分析,本文以稳态的概念对髓系主要细胞类型进行分类,并定量预测了一系列细胞类型转换过程中出现的中间状态或过渡态.基于计算结果和数学中动力学系统的原理,本文提出了髓系细胞发育景观拓扑图,并从高维非线性动力系统的基本特性出发,讨论了实验中在特定基因操作下观测到的转分化现象,并预测了相应过程中的分子动力学变化.本研究表明,髓系细胞发育定量景观拓扑图的构建有助于全局性地阐述恶性肿瘤和再生障碍性疾病的发生发展.