四种嵌入式实时操作系统关键技术分析

介绍了RT-Linux,μCLinux,μC/OS-Ⅱ和eCos四种源码公开的嵌入式实时操作系统(Embedded Real-Time Operating Systems,ERTOS),详细分析比较了关键实现技术———任务管理、任务及中断间的同步通信机制、存储器管理、中断管理等,指出了不同应用领域所适合的ERTOS。

运动对糖尿病小鼠骨骼肌基因表达影响的生物信息学分析

目的:探讨运动对链脲佐霉素诱导的糖尿病小鼠骨骼肌基因表达谱的影响及其生物代谢过程变化。方法:从GEO数据库下载Lehti等提交的小鼠骨骼肌基因芯片数据,应用生物信息学方法筛选差异表达基因,并对这些差异表达基因的基因本体(GO)和日本京都基因和基因组百科全书代谢通路数据库(KEGG)的注释进行功能富集分析。结果:与糖尿病非运动组小鼠相比,糖尿病运动组小鼠骨骼肌存在253个差异表达基因,这些基因主要富集于三条KEGG代谢通路和三个基因本体生物过程,代谢通路包括粘着斑通路、细胞外基质受体交互通路和细胞通讯;基因本体生物过程包括己糖代谢过程、单糖代谢过程和细胞成熟。结果提示运动影响糖尿病小鼠骨骼肌的粘着斑通路、细胞外基质受体交互通路和细胞通讯三条通路,从而改善糖代谢过程。

基于神经网络集成的蛋白质二级结构预测模型研究

[目的]探讨基于CPN神经网络集成的蛋白质二级结构预测模型的效果。[方法]借助神经网络集成方法对从36个蛋白质提取的共4 000个氨基酸进行预测研究,其数据集是从HSSP数据库中提取的数据经过处理后得到的评测数据库,同时在Profile编码中引进了CPN网络算法的概念。[结果]基于CNP网络的神经网络集成预测模型可以取得很好的预测结果,把蛋白质二级结构预测的平均精度提高了17.74%。同时,所用的Profile编码和CPN网络算法在很大程度上为系统模型引入较多的生物信息和联系,而这一点对蛋白质二级结构预测非常重要。[结论]该研究为蛋白质二级结构预测准确率的提高奠定了基础。

基于动态克隆选择的入侵检测及其搜索核特征的研究

建立了一种基于动态克隆选择的入侵检测模型,结合模糊理论和统计方法,设计了一种新的检测器编码方式,通过划分子库、改进检测方法等途径对负向选择算法的伸缩性问题进行了探讨。文章首次提出了通过人工免疫的方法搜索入侵检测核特征的概念,并探讨了用本研究建立的入侵检测模型从候选特征中搜索核特征的方法。

DNA计算研究的新进展

DNA计算(DNAcomputing)是伴随着分子生物学的兴起和发展而出现的.作为一种全新的算法,DNA计算显示了其进行复杂运算的可行性.该文介绍DNA计算的机理,探讨了目前DNA计算的研究进展,并介绍了表面固定的生物计算和由输入DNA分子同时提供数据和燃料的生物分子自动机.

集成毛细管电泳芯片研究进展

集成毛细管电泳芯片是一种新型的微全分析系统,它具有样品用量少、分析速度快、体积小便于携带、成本低等优点。本文综述了该芯片的产生和发展过程以及芯片的结构、进样方式、检测方法等方面的进展和存在的问题;简述了其主要应用领域并展望了其应用前景。

一种通用的、基于Agent的生物资源整合架构

众所周知,随着基因组测序工作的蓬勃发展和后基因组时代的到来,生物信息学数据呈指数级增长。生物界在享受着资源共享所带来便利的同时,也随着数据总量和复杂性的不断增加而变得异构化和分布化。目前,各种生物计算软件和数据库资源通常标准不一而且很难兼容。因此,如何在这些异构资源之间实现数据集成与软件共享是有效利用生物信息资源的关键。为解决以上问题,本文提出了一种新型的数据整合架构,该架构通过将web服务与并行计算相结合的方法,轻松地实现了对异地资源数据的访问、提取、转化以及整合。实验证明,本系统在处理异构、海量数据方面有着巨大的计算潜力。

毛细管电泳芯片信号分析系统的UML建模研究

集成毛细管电泳芯片(Integrate Capillary Electrophoresis Chip,ICEC)属于分析型生物芯片,近年来发展迅速。ICEC过程复杂,实现困难,有必要前期通过建模等方式,进行必要的系统设计。统一建模语言(UnifiedModelingLanguage,UML)是一种用来描述系统、构造系统模型的面向对象建模语言,运用UML语言对ICEC信号分析系统进行建模研究,可使ICEC的设计逐步优化,从而最终实现混合物高效分析和分离的目的。本文系统描述UML语言和毛细管电泳芯片工作原理,并介绍运用UML语言对ICEC信号分析系统建模方法。

集成毛细管电泳芯片信号仿真及其构件研究

集成毛细管电泳芯片(Integrated Capillary Electrophoresis Chip,ICEC)属于分析型生物芯片,应用广泛,近年来发展迅速。随着ICEC集成程度越来越高,其分析过程也越来越复杂。在软件研究中有必要对其信号曲线进行仿真。本文讨论了ICEC工作原理。由于ICEC的分析方法与色谱分析方法相似,因此本文还以色谱流出曲线方程为基础,推导出便于仿真研究的ICEC信号曲线方程,并以此方程为基础,借助matlab-comtool工具设计出便于仿真的COM构件。最后取Agilent BioAnalyze2100的真实信号进行仿真对比,获得满意的仿真结果。

基于GPRS远程医疗系统的移动终端设计与实现

远程医疗是基于生物医疗、计算机科学、通信技术等多学科,将无线数据传输、计算机软硬件技术等密切结合的高新技术。介绍远程医疗系统的组成及其工作原理,设计基于ARM芯片S3C2410和MC55无线模块的远程医疗系统的移动终端,该终端以ARM芯片为控制器,以通用无线分组业务GPRS(General Packet Radio Service)无线网络和Internet网络为通道,实现远程生理数据的传输。该终端具有强大的数据采集和处理功能。实验结果表明,该移动终端通信可靠、实时性好。

基于GPRS的无线传输系统设计与实现

和基于CSD的GSM相比,GPRS提供了数据交换功能,这样能在能在移动台和INTERNET之间建立基于TCP/IP协议的连接。本文设计使用西门子公司的GPRS模块——M55来设计实现移动台和INTERNET之间的数据传输,实现移动台的无线接入INTERNET。

一种基于RFID的物流管理系统的设计

根据RFID物流管理模型,设计并实现了一种基于RFID的物流管理系统。该系统使用带有RFID读写器的智能移动终端,通过移动通讯技术,可实现物流过程的全程监控和管理。着重强调了系统的框架设计和应用程序服务模块的设计和实现,并给出了整个系统的基本操作流程,有效地提高了物流管理效率,加强了信息传输过程中的安全性,并消除了常规物流管理系统的盲点,真正做到物流全程监控。对RFID技术和我国物流产业的发展和结合具有现实借鉴意义。

基于嵌入式Web服务器病人监护系统设计

远程医疗是基于生物医疗、计算机科学、通讯技术等多学科,将数据传输、计算机软硬件技术等密切结合的高新技术。设计了以ARM芯片为核心的医学检测设备,将嵌入式系统应用于病人网络监护系统中,介绍了其软硬件系统的基本原理、设计思想、实现方法。该终端以ARM芯片为控制器,以Internet网络为通道,实现远程生理数据的传输。该终端具有强大的数据采集和处理功能。实验结果表明,该移动终端通信可靠、实时性好。

基于特征选择和概率神经网络胃癌计算机辅助诊断(英文)

应用信噪比和概率神经网络的方法,结合实验数据,提出胃癌分类模型。它是利用已知信息对胃癌样本进行分析和判别。其方法是首先对数据进行分类信息指数信噪比分析,根据分类信息指数信噪比大小排序,然后采用特征向量递增的方法,将特征向量输入概率神经网络进行分析,采用留一法对PNN训练和检测,找出训练效果最好的特征向量子集。这种模型用MATLAB软件实现,具有可操作性,可推广到其它相应的疾病辅助诊断中去。

基于微全分析系统的毛细管电泳信号采集系统设计

本文介绍了一种基于微全分析系统,采用C8051F020单片机和液晶显示技术而设计的便携式毛细管电泳信号采集系统。它具有强大的功能:显示,存储,回放,打印功能,可以通过USB接口与笔记本电脑相连构成移动式毛细管电泳信号采集和处理工作站,具有极为广阔的应用前景。

低功耗、低灵敏度有源带通滤波器设计的新方法

提出运用低通到带通的频率变换法与阻容细化法相结合的思想,直接利用2阶的低通(L P)滤波器原型电路实现4阶低功耗、低灵敏度的带通(BP)滤波电路的设计新方法。具体而言,通过对低通原型滤波电路进行阻抗变换以及对其对应的RC电路实现所谓“有损的L P BP变换”,就可以实现带通(BP)滤波电路的设计。选用2阶切比雪夫(Chebyshev)低通滤波器电路为原型,给出4阶带通滤波器的具体设计过程,并通过PSpice软件来验证此种方法的可行性和实用性。

一种基于RFID的物流管理系统的设计

本文根据RFID物流管理模型,设计并实现了一种基于RFID的物流管理系统。该系统使用带有RFID读写器的智能移动终端,通过移动通讯技术,可以实现物流过程的全程监控和管理。文章着重强调了系统的框架和应用程序服务模块的设计和实现,并给出了整个系统的基本操作流程。该系统提高了物流管理的效率,消除了以往物流管理系统的盲点,对RFID技术和我国物流产业的结合具有现实借鉴意义。

基于ZigBee的医院病人追踪定位系统设计

介绍了一种基于ZigBee技术的医院病人追踪定位系统的设计,该系统以CC2431集成的RSSI定位引擎为核心,结合定位参考节点实现对病人的追踪定位功能。阐述了系统的结构和硬件电路设计,重点分析了定位引擎的工作原理及其软件操作,并针对定位引擎在实际应用中的不足提出了两点改进措施。

基于SwissPdbViewer和MATLAB对人类SOX蛋白三级结构建模及分析(英文)

SOX蛋白具有一个与DNA特异结合的高保守HMG-box结合域。利用MATLAB的Sequence Analysis工具从Genbank中下载人类SOX蛋白序列信息,二次筛选获得22个有效的序列数据。以三级结构已知的SOX2、SRY、SOX5为模板,联合SwissPdbViewer与MATLAB,采用同源建模方法对SOX蛋白HMG-box进行建模、预测;利用MATLAB的Visualization Tool分析预测结果的三维结构。结果显示SOX蛋白HMG-box的三级结构极为相似,由3个α螺旋和2个热力学结构不稳定的loop区构成;表面静电分析显示SOX蛋白C端有一个可能与其它小分子或蛋白质的相互作用位点的N/C腔。SOX蛋白的上述空间结构可能与其活性与功能的调控有关。

用单片机构建带USB接口的CF读卡器

介绍了Compact Flash Card(以下简称为CF卡)的性能特点,在此基础上,用单片机实现了基于USB 1.1协议的CF卡接口,能够读取各种型号的CF卡,可作为通用的CF读卡器.