2011至2012年徐汇区致泻性大肠埃希菌病原学监测与流行病学研究

目的监测致泻性大肠埃希菌(DEC)在肠道传染病中的感染情况,掌握区域内各种DEC的分子流行病学特征。方法通过采集医院肠道监测点的胃肠道感染病例进行持续性的病原学监测,使用设计的10对不同毒力基因的引物探针片段进行检测后,分析各类DEC的流行病学分布特征。结果各类DEC的阳性检出率为9%[包括侵袭性大肠埃希菌(EIEC)、致病性大肠埃希菌(EPEC)、产毒性大肠埃希菌(ETEC)、肠出血性大肠埃希菌(EHEC)],如增加检测聚集性大肠埃希菌(EAEC),阳性率上升至12%;包含EAEC和弥散性聚集大肠埃希菌(DAEC)时,阳性率为17%;包含EAEC、耐热性肠毒素阳性时,阳性率为23%。EAEC和DAEC有明显的年龄分布特征,ETEC和DAEC的季节性特征相反,各类DEC均无性别分布差异。结论各类DEC的感染者年龄分布特点明显,月度分布呈季节性变化,加强并建立长期持续性的DEC监测是深入了解DEC分子流行病学的基础。

2012年上海市徐汇区人肠道病毒5'非编码区序列分析

目的通过分析HEV的5'-UTR基因序列,确定上海市徐汇区手足口病(HFMD)病例中HEV的型别。方法采集2012年HFMD患儿标本,采用Real time-RT-PCR分别检测HEV、EV71和CoxA16核酸,初步鉴定其型别。从中挑选未能分型的HEV毒株扩增其5'-UTR进行核苷酸序列测定,运用DNAStar和MEGA5.2软件进行序列分析。结果26例标本均为HEV阳性:10例EV71阳性,5例CoxA16阳性,11例其他型HEV阳性。扩增11例未能分型的HEV标本的5'-UTR序列,9例测序成功,通过序列比对确定病毒型别:CoxA16 8例,CoxA10 1例。结论上海市徐汇区HFMD患儿的主要病原是EV71和CoxA16,也存在着其他型别的HEV,如CoxA10,应加强HEV基因亚型的分布及流行特点的监测。

口腔综合治疗台治疗用水污染危险因素调查

目的了解上海市徐汇区口腔综合治疗台治疗用水污染状况,并分析污染的危险因素。方法采集上海市徐汇区9家医疗机构34台综合治疗台不同时段三种管道的治疗用水,进行细菌菌落总数计数,同时收集相关资料进行危险因素分析。结果上午开诊前、第一个病人诊疗后、上午诊疗结束后治疗用水合格率分别为57.6%,70.7%,87.0%。综合治疗台当日的使用时间短是影响治疗用水菌落总数的主要因素。治疗用水合格率的危险因素分析中,回吸强度大、采用储水罐供水方式、水处理设备管理水平差及当日管道冲洗时间短都是独立的危险因素。结论口腔综合治疗台治疗用水污染情况严重,存在引起医院感染的隐患。影响污染状况的因素较多,需要有综合措施对综合治疗台水路污染状况进行控制。

2000-2012年中国HIV基因亚型时空分布的系统综述

目的了解2000年以来我国艾滋病病毒(human immunodeficiency virus,HIV)基因亚型的时间和空间分布特征。方法计算机检索中国知网期刊全文数据库和PubMed数据库,按纳入和排除标准选取文献,提取资料,描述分析HIV亚型在不同时间、不同地区和不同传播途径感染人群中的分布。结果纳入78篇文献,涵盖我国20个省、直辖市和特区。研究结果显示:我国目前存在A、B、B’、C、D、E、G、K、CRF01_AE、CRF07_BC、CRF08_BC、CRF02_AG、CRF03_AB、CRF12_BF、CRF14_BG、CRF02_AG/CRF01_AE、CRF08_BC/B、CRF07_BC/CRF01_AE、G/CRF12_BF、A/CRF10_CD、CRF01_AE/B’、U/CRF01_AE、B/C、U/G等多种亚型,其中CRF01_AE、CRF07_BC、CRF08_BC、B’、B为主要流行亚型;HIV的基因亚型与传播途径相关,近年来,我国流行的重组毒株增多且出现多种独特重组型。结论过去10年,随着HIV流行形势的变化,我国HIV基因亚型分布特征发生变化并日趋多样化,必须予以高度重视。