上海市2014—2019年麻疹疑似病例实验室监测结果及病原谱分析

本文旨在探究上海市麻疹疑似病例的病原谱构成。从2014—2019年的3325份麻疹/风疹阴性咽拭子标本中,挑选1197份标本,利用荧光定量PCR技术检测水痘带状疱疹病毒(VZV)、人细小病毒B19、人类疱疹病毒4型(Epstein Barr virus,EBV)、人单纯疱疹病毒1型(HSV-1)、人疱疹病毒6型(HHV-6)、人疱疹病毒7型(HHV-7)、柯萨奇病毒A16(CA16)、柯萨奇病毒A6型(CA6)、柯萨奇病毒A10型(CA10)、肠道病毒71型(EV71)及其它通用肠道病毒(EV)。结果显示,共检测到9种病毒,总检出率为9.7%,未检出混合感染。EBV检出率最高,为1.8%,其次为人疱疹病毒6型(1.7%)、VZV及人细小病毒B19(各1.3%)。其他EV检出率为0.8%;检出CA6、CA10各7例(0.6%);检出HSV-1共6例(0.5%),CA16有4例(0.3%)。人细小病毒B19、VZV主要在未成年人中检出,EBV、HHV-6、CA16、CA6在成人和未成年人中占比相似。VZV、EBV及HHV-6主要在男性中检出,HSV-1主要在女性中检出。本研究提示,在上海市麻疹疑似病例中,除麻疹病毒、风疹病毒外,还存在EB病毒、HSV-1、细小病毒B19等9种病毒,它们均可能引起类似麻疹症状而被临床诊断为麻疹,临床医师诊断时须注意加以鉴别。

上海市首次自腹泻患者中检出格隆柏沙门菌的表型和分子特征研究

目的研究上海市首次自腹泻患者中检出格隆柏沙门菌的表型和分子特征,为沙门菌病防控提供依据。方法对格隆柏分离株(2023JD76)进行生化鉴定、血清凝集试验、抗菌药物敏感性试验以及全基因组测序(whole genome sequencing,WGS)。收集全球格隆柏沙门菌全基因组序列,进行血清分型、多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)、耐药基因和毒力基因预测,分析2023JD76与全球株的系统进化关系。结果2023JD76血清分型符合抗原式(Salmonella Grumpensis,13,23:d:1,7),对20种抗菌药物均敏感,MLST型预测为2060(ST2060),携带氨基糖甙类药物耐药基因aac(6′)-Iaa和5类毒力基因,包括黏附基因csg、rat,分泌和转运基因sip、inv,伤寒毒素基因cdt、plt,侵袭性基因营养代谢因子mgt和抗菌肽抗性因子mig。36株全球格隆柏菌株共携带10种耐药基因,不同毒力基因携带率为58.33%~100%。进化树将全球格隆柏沙门菌基因组分为2个支系,支系Ⅰ以ST751(88.89%,16/18)为主,支系Ⅱ以ST2060(89.47%,17/19)为主。本次分离菌株2023JD76处于支系Ⅱ内,其序列型与全球人源粪便株和人源脑脊液株全基因组序列密切相关。结论本研究首次分离国内腹泻患者中的格隆柏沙门菌,不同地理来源菌株间耐药表型差异大,应加强监测以防范全球潜在的传播风险。

2018-2021年上海市金山医院儿童非伤寒沙门菌感染的临床流行特征和药敏分析

为了解复旦大学附属金山医院近年来明显增多的非伤寒沙门菌(nontyphoidal Salmonella,NTS)感染儿童病例的临床特点及病原体特征,本研究回顾性分析了2018年1月-2021年12月该院NTS感染患儿的临床特征、血清型分布及耐药情况,并比较新型冠状病毒感染(简称新冠)疫情出现前后的差异。2018-2021年该院腹泻患儿中NTS的平均分离率为18.1%(110/609),其中2020-2021年(新冠疫情开始后)的分离率(21.3%,57/268)明显高于2018-2019年(15.5%,53/341)(P=0.04)。NTS感染病例主要集中在6个月~<3岁年龄段(80.0%,88/110),多发于每年的5-10月(84.5%,93/110)。临床症状常见发热(70.9%)和肉眼血便(22.7%);均接受第3代头孢菌素类抗生素治疗,疗程一般为5~7 d,所有患儿均临床痊愈。共检出21种血清型,其中鼠伤寒沙门菌单相变种最常见(29.1%,32/110),其次是鼠伤寒沙门菌(26.4%,29/110)。药敏试验结果显示,NTS对头孢曲松的耐药率为21.8%,对阿奇霉素和环丙沙星的耐药率较低(分别为8.2%和6.4%);29.1%的菌株为多重耐药株,2.7%的菌株对所检测抗菌药物均耐药。NTS已成为上海金山及其周边地区儿童急性肠炎的重要病原体,且感染率呈上升趋势,很可能与鼠伤寒沙门菌及其单相变种感染增多有关,对目前临床常用的第3代头孢菌素类抗生素的耐药率较高,因此有必要持续监测NTS的流行特征及其对抗菌药物耐药性的变化。

上海市医疗机构工作人员手污染金黄色葡萄球菌的分子生物学特征及耐药性

目的分析上海市医疗机构工作人员手分离金黄色葡萄球菌的分子生物学特征及其耐药性。方法选取2018—2020年上海市16所不同级别医院工作人员为研究对象,对医疗机构重点科室工作人员的手进行采样、分离、鉴定金黄色葡萄球菌,对金黄色葡萄球菌进行药敏试验、脉冲肠凝胶电泳(PFGE)和全基因组测序,利用BioNumerics软件对全基因组测序数据组装,对组装基因组开展多位点序列分型(MLST)、核心基因组多位点序列分型(cgMLST)、毒力基因、耐药基因、耐消毒剂基因分析。结果上海市2018—2020年医疗机构工作人员手金黄色葡萄球菌分离率为2.9%。其中MRSA占13.6%(3/22),MSSA占86.4%(19/22)。3株MRSA分别来源于医生、护士和护工,其中1株来源于医生的MRSA携带qacB基因。MSSA对红霉素、环丙沙星、四环素、左氧氟沙星有不同程度的耐药;PFGE和cgMLST显示金黄色葡萄球菌基因多样性,2株相同来源的ST72型金黄色葡萄球菌的PFGE带型高度相似,且仅有10个差异基因,提示为克隆株。结论医疗机构中工作人员的手可作为金黄色葡萄球菌传播的载体,医疗机构内存在经手作为载体导致的金黄色葡萄球菌的医院传播。

2020年上海市一起洗浴中心庞蒂亚克热暴发调查

目的报告2020年上海市发生的一起洗浴中心庞蒂亚克热暴发疫情的流行病学调查结果,以期为后续同类疫情的监测和调查处置提供参考。方法对上海市奉贤区发热门诊2020年12月18—21日具有某洗浴中心暴露史的139例发热病例进行流行病学调查。以在该洗浴中心有明确轨迹和饮食信息的74例患者为病例组,以有该洗浴中心暴露史但未发热的44名健康人群作为对照组进行流行病学病因调查,采用logistic回归分析暴露危险因素,并使用RT-PCR方法对病例组15例发热患者深咳痰液样本进行病原核酸检测,利用BCYE平板进行军团菌培养。使用余氯检测仪现场检测该洗浴中心水中游离性余氯。结果除发热外,139例病例出现频率最高的症状依次为乏力(71例,51.08%)、头痛(58例,41.73%)和肌痛(58例,41.73%),疫情潜伏期为12~68 h,M为36 h。病例对照研究中,单因素分析结果显示在该洗浴中心泡汤是发热的危险因素(OR=9.036,95%CI=3.521~23.189);多因素logistic回归结果分析显示曾在美肌汤池泡汤者的危险度是未泡者的5.456倍(95%CI=1.746~17.042)。4例发热病例深咳痰液样本检出军团菌核酸阳性,4份环境样品培养出军团菌菌株,2个汤池余氯低于标准值(分别为0.2、0.09 mg/L)。结论结合流行病学、临床表现和实验室检测结果,综合判断此次疫情为一起由军团菌引起的庞蒂亚克热暴发。

2019—2021年上海市腹泻儿童肠集聚性大肠埃希菌的病原学特征分析

【目的】了解上海市腹泻儿童肠集聚性大肠埃希菌(EAEC)毒力基因携带情况、分子分型特征及抗生素的敏感性,为EAEC监测及EAEC感染的规范治疗提供科学依据。【方法】以上海市6个行政区腹泻儿童(≤5岁)的EAEC菌株作为研究对象。用实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)检测EAEC毒力基因,采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行分子分型,应用微量肉汤稀释法进行药敏试验。采用χ^(2)检验和两独立样本t检验比较郊区和市区来源EAEC毒力基因及耐药性的差异。【结果】2019—2021年59株EAEC的3种毒力基因aggR、pic、astA检出率依次为30.5%、50.8%、57.6%,郊区和市区来源EAEC毒力基因检出率差异无统计学意义(P>0.05)。PFGE溯源分析结果显示,仅有2株EAEC属于同一型别且采集自同一家医院,带型呈多态性。EAEC对亚胺培南、多黏菌素E敏感,对复方新诺明、氨苄西林、萘啶酸、四环素的耐药率(93.1%、79.3%、63.8%、58.6%)高于50.0%。郊区和市区来源EAEC对头孢唑林、头孢噻肟、环丙沙星的耐药率存在差异(P<0.05)。多重耐药菌共有47株,最常见的多重耐药菌耐药谱为氨苄西林-复方新诺明-萘啶酸,郊区和市区间多重耐药EAEC数量差异无统计学意义(P>0.05)。【结论】上海市6个行政区腹泻儿童EAEC毒力基因组合具有多样性,分子分型带型较分散,可能存在同源菌株交叉感染。菌株耐多药现象比较普遍,市区和郊区来源EAEC对头孢唑林、头孢噻肟、环丙沙星的耐药率存在差异。应重视临床抗生素的规范使用,有效阻断EAEC多重耐药菌的传播。

上海市污水处理厂携带mcr-1耐药基因肠道杆菌菌株的分离及拷贝数定量分析

【目的】了解上海市污水处理厂进水中携带多黏菌素类耐药基因-1(mcr-1)的情况及肠道杆菌菌株种类,为污水中含有该类耐药基因菌株的分子监测提供技术支持。【方法】对2023年4—6月收集的上海市污水处理厂的进水样品,采用血琼脂和SS培养基分离培养携带mcr-1耐药基因的肠道杆菌菌株。采用质谱分析仪进行菌株鉴定,利用实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)检测其mcr-1基因和拷贝数,应用微量肉汤稀释法进行药敏试验。利用SPSS 25.0软件针对不同来源分离得到的携带mcr-1基因的大肠埃希菌(Escherichia coli)的拷贝数进行统计学分析。【结果】从49份污水进水样品中共分离得到14株携带mcr-1耐药基因的肠道杆菌菌株,阳性分离率为28.6%,包括12株非致泻性大肠埃希菌和2株肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)。药敏试验结果显示,14株mcr-1阳性菌株均为多重耐药(MDR)菌。其中所有mcr-1阳性菌株均对亚胺培南和替加环素敏感,对氨苄西林和头孢唑林的耐药率为100%。人源携带的致泻性大肠埃希菌和污水源分离得到的非致泻性大肠埃希菌之间拷贝数的差异无统计学意义(t=0.647,P>0.05)。【结论】首次在上海市污水处理厂的进水中分离得到携带mcr-1耐药基因的非致泻性大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌,并发现拷贝数与人源携带mcr-1的致泻性大肠埃希菌差异无统计学意义。污水来源分离得到的菌株MDR现象较为严重。应重视和加强mcr-1耐药基因的监测,以有效防控多黏菌素耐药菌的传播和扩散。

2020年至2021年上海市新型冠状病毒与其他常见呼吸道病原体混合感染的特征

目的:分析上海市新型冠状病毒感染(COVID-19)患者新型冠状病毒(SARS-CoV-2)与其他常见呼吸道病原体混合感染的特征,为科学防控提供依据。方法:采用描述性流行病学方法。纳入2020年1月至2021年2月期间上海市报告的272例COVID-19患者,相关基础数据来源于中国疾病预防控制信息系统。收集纳入患者的临床资料,并采用多重反转录聚合酶链反应,对其就诊或入院时采集的SARS-CoV-2核酸阳性呼吸道标本进行22种常见呼吸道病原体的核酸检测。统计学分析采用独立样本t检验。结果:272例COVID-19患者中,15例(5.5%)存在SARS-CoV-2与其他呼吸道病原体混合感染,均为双重感染。合并感染的呼吸道病原体包括肠道病毒/鼻病毒3例,腺病毒、人偏肺病毒、冠状病毒NL63/HKU1各2例,冠状病毒229E、甲型H1N1流行性感冒病毒、副流感病毒Ⅰ型和呼吸道合胞病毒B型各1例;与肺炎支原体混合感染2例。272例COVID-19患者中,发热212例(77.9%),咳嗽117例(43.0%),乏力46例(16.9%),咽痛35例(12.9%)。混合感染组的白细胞计数为(6.8±1.7)×10^(9)/L,高于非混合感染组的(5.3±1.6)×10^(9)/L,差异有统计学意义(t=3.09,P=0.008)。结论:上海市COVID-19患者中存在一定比例的其他呼吸道病原体混合感染,以病毒为主,尤其是肠道病毒/鼻病毒。在诊疗过程中应注意联合用药,并进一步加强急性呼吸道感染的监测。

2021—2022年上海<5岁住院儿童病毒性腹泻的病原学特征

【目的】了解新型冠状病毒感染(简称“新冠”)疫情防控期间住院儿童病毒性腹泻病原谱变化及主要病原体基因型别的流行变迁。【方法】采集上海市某哨点儿科医院本地<5岁腹泻住院患儿的粪便标本,采用荧光聚合酶链反应(PCR)方法对轮状病毒、诺如病毒、札如病毒、星状病毒和肠道腺病毒进行分子检测,对主要病原体进行分子分型和序列分析。【结果】共收集546份标本,总体病毒阳性检出率为37.55%,依次为诺如病毒GⅡ型(22.16%)、A组轮状病毒(16.12%)、星状病毒(2.93%)、肠道腺病毒(2.38%)、札如病毒(0.92%)和诺如病毒GⅠ型(0.18%)。诺如病毒GⅡ型以GⅡ.4[P31]和GⅡ.4[P16]为主要流行株(占比分别为24.79%和14.05%),其中GⅡ.4[P31]检出占比明显下降(χ2=16.140,P<0.001)。此外,还发现国内罕见轮状病毒基因型G8P[8]型在本地的首次流行,且占比呈上升趋势,总体达到7.95%。该基因型代表株在基因进化分析上与东南亚的DS⁃1⁃like G8P[8]毒株进化距离更近。【结论】诺如病毒基因亚型的分布变化和轮状病毒罕见型别的发现都凸显持续性病原监测和基因分型检测的重要性。少见株的本地化流行对上市疫苗的效果评价和潜在疫苗的开发提出了新的要求。

温度和冻融循环对公共卫生样本中细菌活性的影响评价

本研究旨在模拟公共卫生生物样本库的感染性标本的转运/暂存、冷冻保藏再利用场景,通过在兔血清和饮用水中外加大肠埃希菌模拟感染性人类血清样本和环境水样,评估不同运输温度、冷冻温度、冻融循环,尤其是液氮温区环境对样本中细菌活性的影响。结果显示,感染性血清和饮用水在4℃运输条件下,样本中的大肠埃希菌数均随着时间的增加呈逐步下降的趋势;干冰运输条件下,饮用水样本中的大肠埃希菌数在12 h后下降至极低水平。在-20℃、-80℃和液氮条件下,血清冻融1~3次后大肠埃希菌数结果与基准值无统计学差异。本研究建议应全程记录每个环节影响样本质量的关键数据,例如:转运温度、时限和冻融循环总次数,作为分析前信息记入生物样本库信息系统,尽管这不是生物样本操作信息,但可直接影响检验结果的准确性。

新型冠状病毒感染大流行前后ICU环境中鲍曼不动杆菌同源性分析

目的探究新型冠状病毒感染大流行前后上海市部分医疗机构重症监护病房(ICU)环境中病原菌的分布及鲍曼不动杆菌同源性变化情况。方法采用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)法分离鉴定病原菌,通过Illumina Miseq测序平台对鲍曼不动杆菌进行全基因组测序,基于多位点序列分型(MLST)和核心基因组MLST(cgMLST)探讨其亲缘关系。结果大流行后ICU环境中病原菌总检出率(6.10%,101/1656)低于大流行前(10.77%,181/1680;P<0.05)。大流行前后,ICU环境中检出的鲍曼不动杆菌在被褥表面占比均维持在最高水平,但大流行后ST型呈多样性分布。MLST_Pasteur结果显示,162株鲍曼不动杆菌分为20种ST型,以ST2(80.25%,130株)为主;MLST_Oxford结果显示,162株菌株共有19种ST型,以ST208(37.04%,60株)为主;基于cgMLST的聚类分析结果显示,大流行后ST208_Oxford与ST540_Oxford和ST369_Oxford的亲缘关系更接近,ST164_Pasteur克隆由大流行前的ST234_Oxford转变为大流行后的ST1418_Oxford,新发现2种新型ST_Pasteur和11种新型ST_Oxford。结论大流行后ICU环境中病原菌检出率低于大流行前,大流行前后相同分离位点ST型分布略有不同,大流行前后的流行克隆仍以ST2_Pasteur/ST208_Oxford为主,但部分等位基因发生了改变,cgMLST在同源性分析、进化与传播、暴发分析方面的精确度优于MLST_Oxford和MLST_Pasteur。

2011-2018年上海市公共场所人工水环境中军团菌污染情况调查及其病原型别鉴定

目的了解2011-2018年上海市公共场所人工水环境中军团菌的流行病学特征和病原学特征,为军团菌病的防控提供科学依据。方法2011-2018年累计采集上海市黄浦、静安、徐汇、松江4个区内的31家公共场所人工水环境标本4817份,对采集的年份和月份的时间特征、地区和场所类型特征、标本的类型进行流行病学特征分析,在对采集的水样进行处理、培养和分离鉴定后,再对检测阳性的标本进行军团菌型别特征分析。结果4817份标本中,军团菌阳性率为21.57%(1039份),其中单种型别阳性占96.25%(1000/份),以嗜肺军团菌1型为主,占84.31%(876份),其次为嗜肺军团菌7型和6型,分别占4.72%(49份)和3.75%(39份);同时检出多种型别阳性29份占2.79%(29份);有10份标本无法进一步分型。5-10月份中,以7和8月份的阳性率最高,分别为27.61%(222份)和28.61%(230份),不同月份间差异有统计学意义(P<0.001);以中央空调冷却水和冷冻水的阳性率最高(32.40%),不同水样类型间差异有统计学意义(P<0.001)。不同地区、不同时间、不同场所和不同类型的公共场所人工水环境中均为嗜肺军团菌1型、7型、6型为主的多样性分布,以嗜肺军团菌1型占比最高,不同情况下占阳性标本的比例均超过71.64%。结论上海市公共场所人工水环境中存在以嗜肺军团菌1型为主的较严重污染,每年夏季需加强大型商场、超市、地铁站等公共场所的中央空调冷却水/冷冻水的消毒。

上海市2015-2021年成年人急性呼吸道感染病例中副流感病毒感染情况分析

目的研究2015-2021年上海市成年人急性呼吸道感染病例中副流感病毒(PIV)的感染特征和流行规律, 为PIV的防控提供科学依据。方法收集2015-2021年在上海市13家医院就诊和住院的成年人急性呼吸道感染病例, 对纳入病例进行信息登记和采样, 采用多重PCR技术进行常见呼吸道病原体的检测。结果共纳入5 104例成年人急性呼吸道感染病例, 病原总阳性率为29.37%(1 499/5 104)。PIV阳性率为2.61%(133/5 104), 在流感样病例(ILI)和严重急性呼吸道感染病例(SARI)中的阳性率分别为2.32%(55/2 369)和2.85%(78/2 735)。其中, 以PIV3为主, 占62.41%(83/133), 其次是PIV1(18.80%, 25/133)、PIV2(9.77%, 13/133)和PIV4(9.02%, 12/133)。133例PIV阳性病例的发病时间主要分布在第二、三季度, 占62.41%(83/133), 各季度阳性率的差异有统计学意义(χ2=24.78, P<0.001)。133例PIV阳性病例中与其他呼吸道病原体混合感染占18.80%(25/133), ILI和SARI的混合感染率分别为18.18%(10/55)和19.23%(15/78), 主要混合感染病原为冠状病毒229E。结论上海市急性呼吸道感染病例中存在一定比例的PIV阳性病例, 需进一步加强急性呼吸道感染病例的病原学监测, 重点关注PIV与其他病原的混合感染。

2019—2020年上海市住院儿童病例发热呼吸道症候群病原谱研究

目的了解上海市儿童住院病例中呼吸道症候群的病原谱及临床特征,为疾病的预防及临床诊断提供参考。方法利用荧光定量PCR结合熔解曲线的判定方法对634份下呼吸道吸取物标本进行22种病原体检测,采用卡方检验对不同检出率进行统计分析。结果在634份住院病例标本中,555份病原体核酸检测阳性,总阳性率为87.54%,检出的病原体主要为肺炎支原体(mycoplasma pneumonia,MP)、腺病毒(adenovirus,ADV)、呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)、甲型流感病毒(influenza virus A,FluA)及博卡病毒(bocavirus,BoV);多重感染的比率大于单一感染,多重感染的病原体类型是ADV、RSV、FluA或者BoV伴MP共感染;在年龄分布中,FluA在"<2岁"和"2~5岁"这两个年龄组检出率较高,RSV在"<2岁"年龄组的检出率明显高于其他两个年龄组,而冠状病毒在"2~5岁"和">5岁"的检出率要高于"<2岁"年龄组;结合临床症状的分析显示,RSV在非发热患者中的检出率高于发热患者的检出率,RSV及PIV在咳嗽患者的检出率高于非咳嗽患者的检出率,RSV在喘息患者中的检出率高于非喘息患者,RSV及FluA中的H3N2引起肺炎的概率较大;FLuA、FluB及RSV具有明显的冬春季流行高峰。结论应加强对MP、ADV、RSV、FluA及BoV等呼吸道病原体的持续性监测,了解其流行特征及致病力的变化,为儿童中呼吸道疾病的防控提供科学依据。

2019年上海市松江区手足口病A组肠道病毒病原特征分析

目的了解上海市松江区2019年手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病原中A组肠道病毒(enterovirus,EV)VP1基因特征。方法使用实时荧光逆转录-聚合酶链式反应(reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)检测HFMD疑似病例的标本,EV阳性标本接种人横纹肌肉瘤细胞(rhabdomyosarcoma cells,RD)培养病毒。分离到的A组EV毒株经VP1区基因测序后使用MEGA X软件进行系统进化分析及核苷酸、氨基酸同源性分析。结果2019年共检测207份HFMD标本,其中188份检出EV,柯萨奇病毒(coxsackievirus,CV)-A6、CV-A16、CV-A10、CV-A4阳性分别为47.34%(89/188)、41.49%(78/188)、3.72%(7/188)、2.66%(5/188),其他EV阳性为4.79%(9/188),未检出EV-A71。HFMD夏季流行高峰(5~7月)多检出B1基因亚型的CV-A16,B1a和B1b进化分支共同流行,秋冬季的次高峰(9~12月)检出D3a进化分支的CV-A6较多。CV-A10和CV-A4散在发病,均为C2基因亚型。与原型株相比,CV-A6、CV-A16、CV-A10、CV-A4 VP1基因核苷酸(氨基酸)序列同源性分别为79.22%~81.78%(95.97%~97.19%)、62.70%~65.54%(90.10%~91.30%)、81.76%~82.65%(91.63%~92.03%)、81.09%~81.79%(97.27%~97.67%)。结论HFMD病原体流行的多样性及复杂性增加了HFMD防控难度。EV监测项目的拓展及分子流行病学的研究有助于防控HFMD。

布鲁菌病的生物安全及防控

布鲁菌病(brucellosis)是布鲁菌入侵机体引起的传染-变态反应性人兽共患传染病,易被忽视。该病严重威胁人类健康,影响畜牧业、旅游业的发展,阻碍正常国际贸易,还会造成食品安全隐患。布鲁菌可通过消化道、呼吸道及皮肤黏膜破损处等途径传播至人。人群对布鲁菌的易感性无年龄和性别差异,可通过直接或间接接触感染。从事布鲁氏菌研究的实验室操作人员有发生实验室获得性感染的风险,但可通过有效的生物安全防护措施避免感染的发生。布鲁菌病是一种可防可控的疾病,必须早期诊断和正确治疗,防止疾病慢性化。本文对布鲁菌病的生物安全及其防控原则进行介绍。

上海市2010—2020年健康人群麻疹和风疹及流行性腮腺炎病毒抗体水平研究

目的了解2010—2020年上海市健康人群麻疹、风疹及流行性腮腺炎(流腮)病毒的血清IgG抗体水平,分析不同年龄组人群的抗体变化趋势。方法于2010年1月至2020年12月,将上海市10828名未患麻疹、风疹和流腮的健康人群纳入研究,分为0~7月龄、8~11月龄、1~2、3~4、5~6、7~9、10~14、15~19、20~29、30~39、40~49、50岁及以上12个年龄组。采集血清样本后,采用ELISA法检测血清中麻疹、风疹及流腮病毒IgG抗体水平,并分析抗体阳性率和抗体水平的差异。结果10828名对象年龄M(Q1,Q3)为8岁(9月龄,20岁);男性占48.34%(5234/10828),女性占50.92%(5514/10828),性别信息不详者占0.74%(80/10828);MMR免疫史不详者占27.03%(2927/10828)。10828名对象麻疹、风疹及流腮病毒IgG抗体总阳性率分别为76.78%、64.46%和64.29%,各年份麻疹、风疹及流腮病毒血清IgG抗体阳性率差异均有统计学意义(χ^(2)_(麻疹)=1049.50,P<0.001;χ^(2)_(风疹)=1103.11,P<0.001;χ^(2)_(流腮)=782.59,P<0.001)。麻疹、风疹及流腮病毒IgG抗体GMC分别为541.45 mIU/ml、31.76 IU/ml和133.73 U/ml,各年份麻疹、风疹及流腮病毒血清IgG抗体GMC差异均具有统计学意义(F麻疹=180.74,P<0.001;F风疹=189.95,P<0.001;F_(流腮)=122.40,P<0.001)。麻疹病毒抗体阳性率总体高于风疹和流腮病毒的阳性率,差异具有统计学意义(χ^(2)=518.09,P<0.001)。结论上海市健康人群麻疹病毒IgG抗体水平较高,风疹和流腮病毒IgG抗体水平略低。

2013年至2016年基于上海市腹泻病综合监测体系构建的感染性腹泻监测研究

目的介绍上海市腹泻病综合监测体系的构建，并对2013年至2016年监测数据进行分析，了解上海市感染性腹泻的流行病学特征和病原学特征。 方法对2013年9月至2016年8月上海市腹泻病综合监测的22家成人监测点医院和4家儿童监测点医院的腹泻病例进行主动监测，根据统一设计的调查问卷通过访谈形式开展流行病学调查，并间隔抽样采集病例的腹泻物标本，送至监测点医院所在区CDC开展12种细菌和5种病毒的病原学检测。分析比较感染性腹泻病例的时间分布及病原谱等特征。统计学分析采用卡方检验。 结果4 497例感染性腹泻患者中，病毒感染检出率为29.77%，以诺如病毒（16.33%）、轮状病毒染（7.90%）和札如病毒（1.90%）感染为主；细菌感染检出率为15.38%，以致泻大肠埃希菌（5.25%）、副溶血性弧菌（4.27%）和沙门菌（3.13%）感染为主；混合感染占11.07%。不同年龄组腹泻检出阳性率、感染种类及主要感染病原构成均差异有统计学意义（χ2值分别为18.11、61.86和449.52，均P〈0.01），3～14岁年龄组中致泻大肠埃希菌感染居首位，其他年龄组中诺如病毒感染均居首位。≥15岁感染性腹泻病患者病原谱呈现明显的季节变化，夏季以细菌感染为主8月达到高峰（占81.56%），冬季以病毒感染为主1月达到高峰（占95.27%）；除1月和6至8月以外，诺如病毒感染均居首位。≤14岁感染性腹泻患儿的病原谱季节变化不明显。≥15岁患者中细菌感染出现腹痛、发热、稀软便的比例较高，病毒感染出现呕吐、水样便的比例较高。 结论科学设计、合理布局的腹泻病综合监测体系有利于掌握疾病的流行趋势和病原特征。上海市感染性腹泻病例以病毒感染为主，诺如病毒和轮状病毒为最主要的腹泻病原；感染性腹泻患者的病原谱呈现明显的季节变化，致泻大肠埃希菌为≤14岁儿童的常见腹泻病原；不同病原引起的感染性腹泻的临床症状有差异。应针对不同年龄、不同季节、不同病原的感染性腹泻采取特异性的防控措施。

上海市一起输入性皮肤炭疽疫情的流行病学调查

目的探讨上海市作为特大城市对急性传染病防控的挑战和问题。方法 2019年5月30日上海市发生一起输入性皮肤炭疽疫情,上海市CDC对患者进行流行病学调查及处置,在疫情发生后,上海市CDC收集皮肤炭疽患者相关资料,并对其进行流行病学调查,同时采集患者伤口创面标本和血标本,进行实验室检测。结果该患者的7份伤口创面标本中,6份炭疽芽胞杆菌核酸检测阳性;双份血清学检测结果显示,炭疽芽胞杆菌抗体滴度增长4倍,上海市CDC对该确诊病例进行流行病学调查并对其接触者进行了观察。经治疗,病例康复,19例接触者无续发病例出现。结论上海市有必要加强临床医生对新发传染病的培训,对输入性传染病做到早发现、早诊断、早治疗,减少疾病的发病、传播和死亡。同时需要多部门联防联控,预防和控制继发病例的发生。

2013-2014年上海市污水中人类肠道病毒的基因型分布

目的 分析上海市闵行和嘉定区污水处理厂中人类肠道病毒（HEV）的时间分布特点及其基因分型。方法 于2013—2014年，选取闵行和嘉定区两所污水处理厂入水口作为采样点，每月24—28日采集污水标本1份，每份1 L，共48份。经阴离子膜吸附的方法浓缩，再用牛肉汤洗脱，取上清液并接种RD、HEp-2和L20B细胞进行病毒分离，共分离HEV 249株，其中非脊髓灰质炎病毒（NPEV）185株，脊髓灰质炎病毒（PV）64株（均为疫苗相关株）。通过RT-PCR鉴定基因型，采用Bioedit 7.0.0对VP1核苷酸序列进行序列同源性分析，使用MEGA 5.0软件，通过邻位法构建系统发生树，分析优势株及病毒传播链。结果 185株NPEV中178株鉴定出基因型，包括：柯萨奇B组病毒（CVB）2、3、5基因型，埃可病毒（ECHO）1、3、6、7、11、13、19、20、24、25、30基因型，柯萨奇A组病毒（CVA）4基因型。CVB5和ECHO6是在NPEV分离株中比例较高的两个基因型，分别占33.5%（56株）和24.9%（43株）。闵行区污水水样中HEV分离株主要集中在4—9月份，其中优势株ECHO6主要分布在2013下半年和2014上半年采集水样中，优势株CVB5主要在2013—2014年散在分布。嘉定的ECHO6和CVB5两个优势株的流行趋势与闵行区的基本一致。2013—2014年CVB5形成C6和C8基因亚型2个传播链，而与国外毒株有较大的差异；ECHO6形成C3、C6和D9基因亚型3个传播链，而D9基因亚型在上海属于优势基因亚型，在国内外有一定地域性的传播。结论 2013—2014年上海市污水中的分离到的PV均为疫苗株。HEV优势株为CVB5和ECHO6，其中ECHO6在2013下半年和2014上半年较为流行，CVB5在2014年下半年开始流行。CVB5和ECHO6存在多条传播链的共同流行现象。