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基于转录组学的多组学分析腐败希瓦氏菌冷适应的机制
1
作者
高鑫
李博
刘小杰
《食品研究与开发》
CAS
北大核心
2023年第15期184-192,共9页
该文基于转录组(high-throughput transcriptome sequencing,RNA-seq)分析腐败希瓦氏菌(Shewanella putrefaciens)ATCC8071在低温下基因表达的差异性。结果表明,在低温条件下,S.putrefaciens中2142个基因的表达具有明显差异,其中对S.put...
该文基于转录组(high-throughput transcriptome sequencing,RNA-seq)分析腐败希瓦氏菌(Shewanella putrefaciens)ATCC8071在低温下基因表达的差异性。结果表明,在低温条件下,S.putrefaciens中2142个基因的表达具有明显差异,其中对S.putrefaciens低温冷适应机理起重要的作用基因大量集中于脂肪酸代谢、能量代谢相关通路中。进一步对S.putrefaciens差异基因联合低温条件下脂质组学与蛋白组学数据进行分析,结果表明,在低温下S.putrefaciens基因的差异在不同基因表达层面都表现出明显的一致性,表明脂肪酸代谢与能量代谢的改变对S.putrefaciens冷适应贡献的机制。
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关键词
腐败希瓦氏菌(Shewanella
putrefaciens)
冷适应
转录组学
脂肪酸代谢
能量代谢
多组学联合分析
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职称材料
题名
基于转录组学的多组学分析腐败希瓦氏菌冷适应的机制
1
作者
高鑫
李博
刘小杰
机构
上海
城建职业学院
上海教育教学创新团队
出处
《食品研究与开发》
CAS
北大核心
2023年第15期184-192,共9页
基金
上海城建职业学院教育科学研究项目(cjky202302)。
文摘
该文基于转录组(high-throughput transcriptome sequencing,RNA-seq)分析腐败希瓦氏菌(Shewanella putrefaciens)ATCC8071在低温下基因表达的差异性。结果表明,在低温条件下,S.putrefaciens中2142个基因的表达具有明显差异,其中对S.putrefaciens低温冷适应机理起重要的作用基因大量集中于脂肪酸代谢、能量代谢相关通路中。进一步对S.putrefaciens差异基因联合低温条件下脂质组学与蛋白组学数据进行分析,结果表明,在低温下S.putrefaciens基因的差异在不同基因表达层面都表现出明显的一致性,表明脂肪酸代谢与能量代谢的改变对S.putrefaciens冷适应贡献的机制。
关键词
腐败希瓦氏菌(Shewanella
putrefaciens)
冷适应
转录组学
脂肪酸代谢
能量代谢
多组学联合分析
Keywords
Shewanella putrefaciens
cold adaptation
transcriptome
fatty acid metabolism
energy metabolism
multi-omics analysis
分类号
R73 [医药卫生—肿瘤]
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作者
出处
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1
基于转录组学的多组学分析腐败希瓦氏菌冷适应的机制
高鑫
李博
刘小杰
《食品研究与开发》
CAS
北大核心
2023
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