沙乌头猪繁殖性状全基因组关联分析

试验选取103头沙乌头猪母猪为研究对象,利用猪50K SNP芯片对猪耳组织DNA进行基因型分型,数据质控后,利用全基因组关联分析技术对影响猪繁殖性状的关键位点进行鉴别。结果表明:103头沙乌头猪母猪的耳组织DNA经基因分型质控后剩余44 739个SNPs位点用于关联分析。平均亲缘关系系数为0.03,亲缘关系较远,不存在明显的群体分层。与活仔数显著关联的SNP有19个,候选基因包括VANGL2、PEX19和USP7等;与出生窝重显著关联的SNPs有6个,候选基因包括U6、SOCS2和IRAK4等;与断奶窝重显著关联的SNPs有2个,候选基因包括QDPR、CLRN2和MED28等。根据基因功能注释推测SOCS2、QDPR和MED28可能是影响沙乌头猪繁殖性状的重要候选基因。本研究为解析沙乌头猪的部分繁殖性状及改善沙乌头猪繁殖性能的方案提供理论依据,同时为沙乌头猪的繁殖性状选育提供分子标记。