3种泥鳅微卫星标记和D-Loop部分序列遗传变异分析

为进一步了解中国当前主要养殖鳅类种质资源现状,实验采用7个微卫星标记和线粒体D-Loop部分序列,对泥鳅（Misgurnus anguillicaudatus,MA）、大鳞副泥鳅（Paramisgurnus dabryanus,PD）和台湾大泥鳅（未见种属分类,TW）3种泥鳅进行群体遗传变异分析。结果显示,6个微卫星位点在3种泥鳅中均能获得有效扩增,1个微卫星标记（Mac239）只在MA中获得特异性扩增,而在PD和TW中未能获得有效扩增条带。在3种泥鳅共90尾个体的D-Loop部分序列中发现32个单倍型,仅在PD和TW间存在1个共享单倍型。实验中共检测到65个变异位点,其中MA与PD和TW间存在29个特异性位点,而PD和TW间未检测到特异性位点。瓶颈效应和中性检验显示,TW近期可能发生有效群体数量的减少。基于微卫星标记和D-Loop部分序列的遗传变异分析显示,TW和PD间的Nei’s遗传距离和K2P遗传距离最近（0.297和0.006）,明显小于两者与MA间的遗传距离（1.011-1.899和0.095-0.099）;分子方差分析（AMOVA）显示,3种泥鳅的遗传分化极显著（P〈0.01）。群体间遗传结构和单倍型网络分析显示,3种泥鳅的遗传结构相对独立,仅在TW和PD间存在一定程度的遗传结构混杂。研究表明,泥鳅和大鳞副泥鳅在遗传结构上存在明显差异,可采用分子标记进行有效鉴别;台湾大泥鳅可能是大鳞副泥鳅的生态种群或遗传改良群体,而非有效物种。

我国草鱼野生群体D-Loop序列遗传变异分析

利用线粒体DNA的D-Loop区序列,对来自长江水系(邗江、吴江、九江、石首、木洞和万州)、珠江水系(肇庆)和黑龙江水系(嫩江)的8个草鱼野生群体开展了遗传变异分析。在424尾鱼中检测到34个变异位点,34个单倍型,单倍型多样性介于0.474—0.708。群体间Kimura双参数遗传距离介于0.0020—0.0049。长江下游3个群体间遗传距离最近,遗传分化不显著(P>0.05);肇庆群体与长江上游3个群体遗传距离较近,与九江群体遗传分化不显著(P>0.05);嫩江群体与长江上游2个群体遗传距离较近,与万州群体遗传分化不显著(P>0.05)。遗传距离与地理距离存在极显著正相关(R=0.61,P<0.01)。分子方差分析显示,不同流域间遗传变异占总变异26.24%,差异极显著(P<0.01)。34个单倍型分为2个分支,分化极显著(FST=0.644,P<0.01),推测分化时间为第四纪更新世纪晚期。