造血干/祖细胞大规模测序克隆的一个ABC转运体蛋白基因

ＡＢＣ转运体家族是已知的最大基因家族之一〔１〕，在进化上具高度的保守性，其成员含有ＡＴＰ结合小匣（ＡＴＰｂｉｎｄｉｎｇｃａｓｓｅｔｅ，ＡＢＣ）。最近，我们在对具造血功能的ＣＤ３４＋造血干／祖细胞（ＨＳＰＣ）的基因表达谱的研究中，通过大规模的ｃＤＮＡ测...

应用大规模测序技术和生物信息学研究造血干/祖细胞的基因表达及新基因的识别和克隆

从新生儿脐血和成人骨髓中分选出造血干／祖细胞（ＨＳＣ／ＨＰＣ），构建成ｃＤＮＡ文库，对其进行大规模表达序列标签（ＥＳＴ）测序，通过生物信息学等手段分析基因表达谱，并进行新基因的全长ｃＤＮＡ克隆。在所测的１０５１２条可分析ＥＳＴ序列中，有９８６６条来自脐血ＣＤ３４＋细胞，其中４６９７条（４７６％）为已知基因，２６０３条（２６４％）为已知ＥＳＴ，１４１５条（１４３％）代表未知ＥＳＴ。在已知基因中，８２％基因与造血相关，２２７％涉及细胞代谢、结构和迁移，１３０％与细胞分裂和防御相关，２６２％与ＲＮＡ、蛋白质的合成相关，１０６％和细胞信号传递有关。对一些已知和未知的ＥＳＴ，综合测序、生物信息学等方法，进行全长克隆，已获得２３个新基因的全长ｃＤＮＡ。