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应用大规模测序技术和生物信息学研究造血干/祖细胞的基因表达及新基因的识别和克隆
被引量:
2
1
作者
吴济生
茅矛
+9 位作者
付刚
周隽
张庆华
顾健
黄秋花
沈宇
俞亚萍
徐淑华
王亚新
陈竺
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
1998年第6期11-14,共4页
从新生儿脐血和成人骨髓中分选出造血干/祖细胞(HSC/HPC),构建成cDNA文库,对其进行大规模表达序列标签(EST)测序,通过生物信息学等手段分析基因表达谱,并进行新基因的全长cDNA克隆。在所测的10512条可...
从新生儿脐血和成人骨髓中分选出造血干/祖细胞(HSC/HPC),构建成cDNA文库,对其进行大规模表达序列标签(EST)测序,通过生物信息学等手段分析基因表达谱,并进行新基因的全长cDNA克隆。在所测的10512条可分析EST序列中,有9866条来自脐血CD34+细胞,其中4697条(476%)为已知基因,2603条(264%)为已知EST,1415条(143%)代表未知EST。在已知基因中,82%基因与造血相关,227%涉及细胞代谢、结构和迁移,130%与细胞分裂和防御相关,262%与RNA、蛋白质的合成相关,106%和细胞信号传递有关。对一些已知和未知的EST,综合测序、生物信息学等方法,进行全长克隆,已获得23个新基因的全长cDNA。
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关键词
造血干/祖细胞
大规模测序
基因表达
生物信息
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职称材料
题名
应用大规模测序技术和生物信息学研究造血干/祖细胞的基因表达及新基因的识别和克隆
被引量:
2
1
作者
吴济生
茅矛
付刚
周隽
张庆华
顾健
黄秋花
沈宇
俞亚萍
徐淑华
王亚新
陈竺
机构
上海第二医科大学附属瑞金医院卫生部和上海市人类基因组研究重点实验室
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
1998年第6期11-14,共4页
文摘
从新生儿脐血和成人骨髓中分选出造血干/祖细胞(HSC/HPC),构建成cDNA文库,对其进行大规模表达序列标签(EST)测序,通过生物信息学等手段分析基因表达谱,并进行新基因的全长cDNA克隆。在所测的10512条可分析EST序列中,有9866条来自脐血CD34+细胞,其中4697条(476%)为已知基因,2603条(264%)为已知EST,1415条(143%)代表未知EST。在已知基因中,82%基因与造血相关,227%涉及细胞代谢、结构和迁移,130%与细胞分裂和防御相关,262%与RNA、蛋白质的合成相关,106%和细胞信号传递有关。对一些已知和未知的EST,综合测序、生物信息学等方法,进行全长克隆,已获得23个新基因的全长cDNA。
关键词
造血干/祖细胞
大规模测序
基因表达
生物信息
Keywords
Hematopoietic stem/progenitor cell, Large-scale sequencing, Expressed sequence tag, Gene expression, Bioinformatics, Full-length cDNA cloning
分类号
Q343 [生物学—遗传学]
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
应用大规模测序技术和生物信息学研究造血干/祖细胞的基因表达及新基因的识别和克隆
吴济生
茅矛
付刚
周隽
张庆华
顾健
黄秋花
沈宇
俞亚萍
徐淑华
王亚新
陈竺
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
1998
2
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