基于功能元基因组学的人体系统生物学新方法：中医药现代化的契机

中医药是中华民族在几千年的生产实践中不断积累而形成的一种卓越的医学体系,具有完整的中医理论和丰富的诊疗经验,但其宏观、抽象和复杂等特性使得中医药学很难被国际主流医学界所理解和接受。人体系统生物学从整体出发,用"组学"手段研究由人的细胞和共生微生物细胞共同构成的人体这一"超级生物体"的生理病理现象,与中医药基于整体观的理念和方法论不谋而合,为中医药学与国际主流医学界之间搭起了一座沟通的桥梁,有可能为中医药现代化研究提供一个契机。因此,本文在总结人体系统生物学的研究内容、方法、技术特点与优势,及其在疾病、健康、中医药等复杂系统研究中应用情况的基础上,提出以人体系统生物学为理论框架、基于功能元基因组学的中医药现代化研究策略,有望为中医药研究打开一扇新的大门。

中药复方“金复康”抑制肺癌细胞生长机制的研究

目的:本文主要探讨中药复方金复康萃取物对人非小细胞肺癌(Non-Small Cell Lung Cancer,NSCLC)A549细胞增殖和凋亡的影响及其分子机制。方法:本文以人非小细胞肺癌A549细胞为研究对象,应用CCK8试剂盒检测了金复康萃取物对细胞增殖活力的影响,流式细胞技术检测金复康对细胞凋亡诱导作用,实时荧光定量逆转录聚合酶链式反应(Real-time q PCR,RT-q PCR)检测细胞凋亡相关基因的表达。结果:金复康萃取物对A549细胞增殖有较显著抑制作用,并且存在剂量依赖效应。与对照组相比,金复康处理组细胞数量明显减少,伴随着大量细胞间距增大,失去原有形态,DAPI细胞核染色结果显示细胞核受到损伤。流式细胞检测实验显示金复康明显诱导A549细胞凋亡。RT-q PCR检测发现金复康上调凋亡相关基因转录表达水平。结论:金复康通过诱导细胞凋亡抑制A549细胞增殖,这一过程可能与其诱导凋亡相关基因FADD和GADD45a表达上调有关。

结膜松弛症泪液蛋白质肽质量指纹谱分析

目的分析结膜松弛症泪液蛋白表达谱的变化。方法收集22例结膜松弛症患者和13例正常对照组的泪液样本,毛细管从每眼收集15μL泪液,采用ZipTip C18柱浓缩和纯化泪液样本,利用基质辅助的激光解吸质谱进行线性模式和肽质量指纹谱(PMF)检测,并对PMF图谱数据进行多变量数据统计分析,比较结膜松弛症组和正常对照组的泪液PMF的差异。结果2组泪液的质谱检测峰在数量上差异无统计学意义(P>0.05),主成分分析结合偏最小二乘法分析显示结膜松弛症组泪液蛋白质表达与正常对照组比较有差异,结膜松弛症组泪液蛋白质表现为"离群"样本,且离群分散度较大的样本为结膜松弛症Ⅳ级的患者。结论应用ZipTipC18柱分离联合基质辅助的激光解吸质谱技术可有效筛查泪液蛋白质。对PMF图谱进行多变量数据统计分析,可以观察到结膜松弛症组与正常对照组泪液蛋白质存在差异,并可为结膜松弛症临床诊断、疾病发生发展的机理及治疗提供参考。

鉴定人甲基化CpG结合结构域蛋白4为蛋白激酶X的底物(英文)

人蛋白激酶X(PrKX)是由X染色体编码的一种cAMP依赖性蛋白激酶,但是到目前为止已鉴定到的PrKX底物还很少.为了鉴定蛋白激酶X的底物,我们以蛋白激酶X为诱饵进行了酵母双杂交实验,结果发现甲基化CpG结合结构域蛋白4(MBD4)与PrKX在酵母细胞内相互作用较强.GST融合蛋白沉降和细胞内蛋白质的免疫共沉淀证实PrKX与MBD4之间确实存在相互作用.进一步研究表明,大肠杆菌中表达的重组MBD4在体外可以被PrKX磷酸化,而且MBD4蛋白的磷酸化能明显增强它在体外与甲基化DNA探针的结合活性.

达尔文力学:统计力学的动力学基础

受生物启发而建立的达尔文力学或演化力学可作为期待已久的统计力学的普运动力学基础,对于体系自由度从N=∞到N=1都适用。

不同类型生态农庄的面源污染调查与分析

从上海市郊区(县)选取6个具有代表性的生态农庄(划分为3种类型:产品型、综合型、服务型)进行水质特征的研究,通过连续监测各农庄的进水、过程水和排水的总氮(TN)、总磷(TP)、铵态氮(NH_4^+)、硝态氮(NO_3^-)、可溶性磷(DP)、pH值、溶解氧(DO)、化学需氧量(COD_(Cr))8个水质指标,评价农庄水体污染程度,并结合调查计算得到生态农庄面源等标污染负荷。结果表明,产品型农庄水质达到劣V类,综合型农庄水质达到V类,服务型农庄水质达到Ⅳ类。不同类型经营模式生态农庄的水体污染程度排序为:产品型>综合型>服务型。产品型农庄以TN为主要污染源,综合型农庄以COD_(Cr)为主要污染源,服务型农庄以DO为主要污染源。

灵芝锰过氧化物酶毕赤酵母工程菌培养条件的优化

目的研究毕赤酵母生产重组灵芝锰过氧化物酶(recombinant Ganoderma lucidum manganese peroxidase,rGlMnP)的最优培养条件。方法在单因素实验基础上,采用中心组合设计和响应曲面法对rGlMnP工程酵母产rGlMnP的发酵条件进行优化,探讨初始pH、温度、甲醇浓度和血红素浓度对重组毕赤酵母生产的rGlMnP的酶活力的影响,分析上述4个因子的交互作用及其最佳水平范围,并验证模型的有效性。结果初始pH、温度、甲醇浓度和血红素浓度对毕赤酵母生产rGlMnP的酶活力有显著影响;毕赤酵母生产rGlMnP最优的培养条件为:初始pH 5.5、诱导温度30℃、甲醇浓度1.5%以及血红素浓度1.0mmol/L。结论本研究为利用毕赤酵母工程菌大规模生产rGlMnP奠定了基础。

以肠道菌群为靶点的代谢病营养干预研究进展

肥胖及其引发的糖尿病等代谢性疾病已经成为我国国民健康的重大威胁。近年来的研究表明,不合理的饮食结构会造成肠道菌群结构失调,内毒素产生菌等有害菌增加,丁酸盐产生菌等有益菌减少,宿主的肠屏障功能下降,导致内毒素入血,诱发慢性炎症,破坏胰岛素受体和脂肪代谢机能,最终形成肥胖和后续的代谢损伤。我国学者的多项研究表明,通过科学设计的膳食干预,可以纠正菌群失调,减少毒素入血,减轻慢性炎症,显著缓解代谢综合征。以肠道菌群为靶点的疾病干预,将成为食品科学技术领域的1个重要的新方向。

中药复方葛根芩连汤治疗2型糖尿病过程中的肠道菌群结构变化

2014年10月国际微生物生态学会会刊ISMEJ（影响因子9．267）在线发表了中国中医科学院广安门医院仝小林教授课题组与上海交通大学生命科学技术学院赵立平教授课题组合作完成的研究——“中药复方葛根芩连汤（GQD）治疗2型糖尿病（T2DM）过程中的肠道菌群结构变化”。这是一项随机、双盲、安慰剂对照的临床研究，首次在人群试验中观察了GQD在治疗T2DM过程中患者肠道菌群的变化及其与糖尿病改善的关系。

顺铂对卵巢癌细胞几种生长和凋亡相关基因表达的影响

顺铂是治疗卵巢癌的一线药物,它与癌细胞内的DNA结合是产生细胞毒性的主要原因.在用基因表达谱芯片筛选顺铂处理IGROV-1细胞产生的差异表达基因基础上,选取其中与细胞生长、凋亡有关的部分重要基因,用实时定量PCR方法进行了差异表达验证.结果表明,顺铂可引起CEACAM1、KLF6、JUN、TP53INP1、MAP2K4、UBE2D3表达上调;导致HERC1、PIK3CA表达下调.

蛋白质芯片用于疾病监测的现状和趋势

蛋白质芯片是一种新型的高通量蛋白质组学技术，因其具有高通量、微型化、平行快速等优点，在疾病监测等方面具有广泛的应用前景。