苍苓散对轮状病毒肠炎患儿肠道菌群的影响

目的研究苍苓散对轮状病毒(rotavirus,RV)肠炎患儿肠道菌群的影响。方法收集9例RV肠炎患儿在治疗前及治疗5 d后的粪便,采用16S r DNA测序法进行生物信息分析。结果苍苓散治疗前后的肠道菌群优势物种极其相似,但所占比例不同;2者在门水平上均以厚壁菌门的丰度为最高,治疗前脱硫弧菌目、脱硫弧菌科、瘤胃菌科、嗜胆菌属、隐秘杆菌属丰度较高,治疗后乳杆菌目、乳杆菌科、乳杆菌属丰度较高,其差异有统计学意义(P<0.05)。用香农指数、辛普森指数所估算的微生物群落多样性,Uni Frac聚类分析判断的物种组成相似性,以及PCo A、Anosim分析及物种多响应置换过程分析等,均未能发现治疗前后的肠道菌群结构存在显著差异。结论苍苓散的治疗,影响了RV肠炎患儿肠道中某些菌群的丰度,但需要更大样本、更深入的对照研究以明确中医药治疗婴幼儿RV肠炎影响肠道菌群的具体机制。

气肿疽梭菌pVAX1-NagH 基因核酸疫苗的免疫效果评价

为检测气肿疽梭菌中NagH基因的核酸疫苗的免疫效果,在成功构pVAX1-NagH真核表达重组质粒后,将其转染至Vero细胞,通过间接免疫荧光方法对重组体进行鉴定。鉴定成功后,大量提取重组体质粒,对BALB/c小鼠进行免疫,免疫方法为肌肉注射。设置pVAX1-NagH核酸疫苗组、载体对照组以及PBS阴性对照组。对小鼠采血后分离血清,采用ELISA方法对IgG、IgG1、IgG2a抗体水平和IL-4、IFN-γ细胞因子水平进行测定。结果表明:IgG、IgG1、IgG2a抗体水平与IL-4、IFN-γ细胞因子水平呈显著上升趋势,且与另外2个对照组相比,均存在显著性差异,而2个对照组间未表现出显著性差异。该试验说明初步制备了pVAX1-NagH核酸疫苗,并且pVAX1-NagH核酸疫苗可刺激BALB/c小鼠产生良好的体液免疫和细胞免疫。

联合检测SDC2和SFRP2甲基化在结直肠癌筛查中的价值

目的评价在粪便样本中联合检测SDC2和SFRP2基因启动子甲基化在结直肠癌筛查中的应用价值。方法选取海军军医大学长海医院、同济大学附属第十人民医院以及解放军总医院第七医学中心2018年3月至2018年12月收治的500例患者粪便标本,其中结直肠癌132例为肠癌组,进展期腺瘤38例为腺瘤组,健康标本152例为健康组,存在其他肠道病变或非肠癌肿瘤的178例为干扰组,健康组与干扰组共同构成330例肠癌与进展期腺瘤阴性的阴性组。应用甲基化特异度PCR(methylation-specific PCR,MSP)法对上述患者粪便中SDC2和SFRP2基因启动子甲基化进行检测,并与单个基因甲基化检测和粪便免疫潜血试验(FIT)的检测性能相比较,评价其筛查结直肠癌的灵敏度和特异度。结果SDC2和SFRP2两基因联合检测在肠癌组中的灵敏度为97.73%(129/132),显著高于单基因SDC2检测[ 70.45%(93/132),P=0.000]、SFRP2检测[ 81.82%(108/132),P=0.000]以及FIT检测[ 69.70%(92/132),P=0.000]。腺瘤组中SDC2和SFRP2联合检测的灵敏度为57.89%(22/38),显著高于单基因SDC2检测[ 15.79%(6/38),P=0.000]、FIT检测[21.05%(8/38),P=0.021],与单基因SFRP2检测差异无统计学意义[ 47.37%(18/38),P=0.358]。在健康组中,SDC2和SFRP2联合检测的特异度为98.68%(150/152),与单基因SDC2 [100.00%(152/152),P=0.156]、SFRP2 [98.68%(150/152),P=1.000]以及FIT [95.39%(145/152),P=0.091]相比,差异无统计学意义。在干扰组以及阴性组中,两基因联合检测的特异度分别为90.45%(161/178)和94.24%(311/330),均显著高于FIT [73.03%(130/178),P=0.000;83.33%(275/330),P=0.000]。结论粪便中SDC2和SFRP2两基因联合检测优于单基因检测,在肠癌、进展期腺瘤的灵敏度以及在区分良性息肉、其他癌种或非癌肠道病变的特异度上均显著高于FIT,具有潜在的应用价值。

新型冠状病毒肺炎与mNGS技术

新型冠状病毒肺炎(Coronavirus Disease 2019,COVID-19)是指2019新型冠状病毒(Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2,SARS-CoV-2)感染导致的肺炎。截至2020年5月21日已造成全球超过496万人感染、30万人以上死亡。宏基因组下一代测序(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)技术是在发现和检测新冠肺炎中发挥重要作用的技术。本文介绍了mNGS在新冠肺炎疫情中的作用及核心技术特点,并为mNGS在抗击全球疫情中的应用做出技术性归纳总结。