10株荚膜组织胞浆菌和7株球孢子菌的分型鉴定及质谱自建库建立

目的利用分子分型及基质辅助激光解析串联飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术对现有的荚膜组织胞浆菌(Histoplasma capsulatum)和球孢子菌属(Coccidioides sp.)复核鉴定并聚类分析。方法通过多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)对10株荚膜组织胞浆菌进行系统发育分析;利用特异性片段(Coi区)明确7株球孢子菌的种归属;MALDI-TOF MS技术建立荚膜组织胞浆菌和球孢子菌的MALDI-TOF MS自建数据库,并从蛋白质指纹图谱角度对两类真菌进行同源性分析。结果通过MLST分析,可以将10株荚膜组织胞浆菌分为3个进化支:欧洲型(Eurasia clade)、澳洲型(Australia clade)和北美2型(North American class 2 clade),且质谱聚类分析亦将10株荚膜组织胞浆菌分为3个簇;利用特异性片段(Coi区)鉴定7株球孢子菌为波萨达斯球孢子菌,同时MALDI-TOF-MS蛋白质指纹图谱同源性分析将其归为两个簇。两类真菌MALDI-TOF MS建库后验证符合率为100%。结论分子鉴定后所有球孢子菌明确为波萨达斯球孢子菌,与美国流行情况一致;国内分离的荚膜组织胞浆菌归于欧洲型、北美2型和澳洲型这3个型别;MALDI-TOF MS建库数据可靠且质谱同源性分析可作为分子分型的补充,成为荚膜组织胞浆菌和波萨达斯球孢子菌鉴定和溯源的另一手段。

基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱用于医学真菌鉴定的新进展

近年来,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱作为微生物鉴定的革命性方法,在医学真菌的鉴定方面,正在发挥越来越重要的作用。前处理的改进、数据库的更新以及自建库的应用,使得质谱的真菌鉴定性能有了长足的进步,包括对多数世界卫生组织高优先级的真菌病原体,都能进行快速准确的区分。该文将对基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱用于医学真菌鉴定的进展开展回顾和总结。