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题名大豆GmGW2基因的生物信息学分析
被引量:2
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作者
吕金东
刘灿
屈亦潇
陈汉谋
杨翊晖
丁晨
郭蓓
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机构
北京农学院植物科学技术学院
北京农学院生物科学与工程学院
中华人民共和国农业农村部华北都市农业重点实验室
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出处
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第3期379-384,共6页
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文摘
GW2基因在多种植物中发挥调控籽粒性状的功能,为预测分析大豆中GW2基因的功能,前期通过同源克隆的方法从大豆中成功克隆出GmGW2基因的cDNA序列。为了继续开展深入研究,本试验从大豆中黄10号中克隆出GmGW2基因的全长DNA序列并进行了较为详细的生物信息学分析。结果表明:GmGW2全长8 467 bp,包含8个外显子和7个内含子,编码431个氨基酸。预测是一个不稳定亲水蛋白,定位于细胞核或细胞质中,不含跨膜结构域及信号肽,具有Zinc finger和RING-type结构域。二级、三级结构预测分析显示,α-螺旋及不规则卷曲是其整体蛋白质结构中的主要组成结构元件。利用该基因的DNA序列,构建进化树分析得出该基因与木豆、相思子、鹰嘴豆亲缘关系较近。根据以上分析结果推测GmGW2基因可能也具有调控大豆籽粒发育的功能。此研究旨在为进一步挖掘和验证GmGW2基因功能奠定基础,为大豆产量育种工作提供有益信息。
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关键词
大豆
中黄10号
GmGW2
生物信息学分析
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Keywords
Soybean
Zhonghuang 10
GmGW2
Bioinformatics analysis
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分类号
S565.1
[农业科学—作物学]
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题名大豆GmAGL8基因功能在拟南芥中的初步鉴定
被引量:1
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作者
刘媛媛
陆婉瑶
刘双
秦雅菲
杨翊晖
丁晨
郭蓓
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机构
北京农学院植物科学技术学院
北京农学院北京农学院生物与资源环境学院
中华人民共和国农业农村部华北都市农业重点实验室
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出处
《北京农学院学报》
2020年第4期20-25,共6页
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基金
大豆种质资源保护项目(2014115040)。
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文摘
【目的】为了培育炸荚抗性新品种,提高大豆产量。【方法】利用前期通过同源克隆方法得到的大豆GmAGL8基因构建的pCAMBIA1300∷GmAGL8和pCAMBIA1300∷antiGmAGL8载体,采用花浸法对野生型拟南芥(Arabidopsis thaliana)进行遗传转化,对转基因拟南芥进行了PCR鉴定、表型观察与分析。【结果】对比野生型,过表达GmAGL8的转基因拟南芥叶片相对较厚,呈圆形,出现早花现象,果荚成熟提前,果荚成熟后2周少量果荚出现开裂;对比野生型反义抑制GmAGL8植株叶片较薄呈长圆形,开花较迟,果荚成熟晚且短小,角果成熟时果荚完全炸开。【结论】GmAGL8对拟南芥叶片发育,开花时间以及果荚开裂性状均有影响,在拟南芥中过表达GmAGL8基因可在一定程度上提高果荚开裂抗性。
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关键词
大豆
炸荚
GmAGL8基因
拟南芥
功能
验证
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Keywords
soybean
pod-shattering
GmAGL8
Arabidopsis
function
identification
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分类号
S565.1
[农业科学—作物学]
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