葡萄A病毒外壳蛋白基因克隆及分子变异分析

为获得葡萄A病毒（Grapevinevirus A，GVA）外壳蛋白（CP）基因，并为开展GVA-CP介导的抗病毒转基因研究提供基础，本研究从葡萄休眠枝条中扩增获得12个GVA分离物的CP基因序列，全长597nt，编码198个氨基酸。所得分离物间核苷酸和氨基酸序列同源性分别为83．9％～99．8％和92．4％～99．5％，与GenBank中12个GVACP序列比较，核苷酸和氨基酸序列同源性分别为71．0％～93．1％和81．8％～98．0％。系统进化分析表明，本研究12个分离物CP序列与已报道的GVAI组亲缘关系最近。种群变异分析表明，GVA种群具有多种变异体类型，并且多个样品存在不同变异体类型的复合侵染。但绝大多数变异体克隆聚集在GVAⅠ组分支，有60％的克隆序列间同源性较高，并且聚集在同一个次级分支ⅠAa，表明其为该GVA种群的优势序列。克隆的GVACP基因以及优势序列群体的分析为葡萄抗病毒转基因研究奠定了基础。