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中国南北方汉族急性淋巴细胞白血病患者HLA基因分型特征 被引量:2
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作者 程曦 林创松 +3 位作者 程良红 金士正 邹红岩 高素青 《现代检验医学杂志》 CAS 2009年第2期9-12,共4页
目的研究中国南北方汉族急性淋巴细胞白血病(ALL)患者人群中人类白细胞抗原(HLA)-A,B,DRB1等位基因的分布特征.方法根据11个南方省区556名南方汉族和18个北方省区644名北方汉族ALL患者的HLA—A,B,DRB1表型数据,采用最大似然性... 目的研究中国南北方汉族急性淋巴细胞白血病(ALL)患者人群中人类白细胞抗原(HLA)-A,B,DRB1等位基因的分布特征.方法根据11个南方省区556名南方汉族和18个北方省区644名北方汉族ALL患者的HLA—A,B,DRB1表型数据,采用最大似然性方法分别计算两个群体的HLA—A,B,DRB1等位基因和单倍型频率并采用卡方检验方法比较其分布特征.结果南北方汉族ALL患者群体中,A*02,A*11,A*24,A*33,B*13,B*46,B*51,B*60,B*62,DRB1*04,DRB1*08,DRB1*09,DRB1*11,DRB1*12,DRB1*14和DRB1*15均比较常见,另外B*58,B*62和B*75仅在南方群体中较高,而A*30,B*35,B*61和DRB1*07则仅常见于北方患者,7个A,12个B和5个DRB1等位基因的分布存在显著性差异.结论中国南北方汉族ALL患者人群HLA—A,B,DRB1等位基因的分布有其自身特征,此研究数据可作为ALL患者群体的HLA相关研究和应用的参考数据. 展开更多
关键词 急性淋巴细胞白血病 人类白细胞抗原(HLA) 等位基因 频率
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中国人群HLA-DRB1*1454等位基因和HLA-DRB1第3外显子鉴定意义(英文) 被引量:3
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作者 高素青 程曦 +3 位作者 邹红岩 程良红 卢亮 邓志辉 《中国组织工程研究与临床康复》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期983-987,共5页
目的:在中国人群中鉴定人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)DRB1*1454等位基因,分析供受者HLA-DRB1第3外显子DNA序列信息对器官移植、细胞移植及人类遗传学研究的重要现实意义。方法:应用聚合酶链反应-直接测序分型方法对58例... 目的:在中国人群中鉴定人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)DRB1*1454等位基因,分析供受者HLA-DRB1第3外显子DNA序列信息对器官移植、细胞移植及人类遗传学研究的重要现实意义。方法:应用聚合酶链反应-直接测序分型方法对58例等待造血干细胞移植供受者进行人类白细胞抗原测序分型,1268例广东地区随机健康供者采用聚合酶链式反应-序列特异寡核苷酸探针反向杂交法进行HLA-DRB1中高分辨基因分型,部分模棱两可结果采用聚合酶链式反应-序列特异引物PCR-SSPHLA-DRB*14高分辨方法分型法。结果:在1268例广东地区随机健康人群中检出HLA-DRB1*1403,1406,1410,1412,1418,1425和1454等位基因,HLA-DRB*1401/1434/1454等位基因模棱两可结果的8例样本被确认为HLA-DRB1*1454等位基因,DRB1*1454等位基因可能是广东人群最为常见的HLA-DRB1*14基因。中国人群HLA-DRB1*14第3外显子存在多态性。结论:中国人群HLA-DRB1*1454等位基因确认了DRB1等位基因第3外显子多态性的存在,进一步明确了开展中国汉族人群及少数民族HLA-DRB1第3外显子检测的意义。 展开更多
关键词 人类白细胞抗原 DNA测序 外显子
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2000-2006年中华骨髓库等待造血干细胞移植白血病患者的人口学及临床分布特征 被引量:2
3
作者 高素青 程良红 +5 位作者 卢亮 金士正 程曦 邹红岩 邓志辉 朱为刚 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期19-23,共5页
目的研究2000--2006年中华骨髓库中等待造血干细胞移植的白血病患者的分布特征和规律,为白血病的预防、干预提供科学依据。方法采用MicrosoftSQL2005数据库操作平台对3708例中国籍汉族白血病患者数据,分组计算患者年龄、性别、地区等... 目的研究2000--2006年中华骨髓库中等待造血干细胞移植的白血病患者的分布特征和规律,为白血病的预防、干预提供科学依据。方法采用MicrosoftSQL2005数据库操作平台对3708例中国籍汉族白血病患者数据,分组计算患者年龄、性别、地区等分布曲线,并采用x2检验方法比较其分布差异。结果2000--2006年间,中华骨髓库中3708例白血病患者,年龄范围7个月至69岁,中位年龄为24.5岁,标准差为±6.7岁;男女患者总体比值1.95:1(2451/1257);慢性粒细胞白血病(chronic myeloid leukemia,CML)患者1435例,急性淋巴细胞白血病(acute lymphoblastic leukemia,ALL)患者1202例,急性非淋巴细胞白血病(acute myeloid leukemia,AML)患者1066例,慢性淋巴细胞白血病(chronicly mphoblastic leukemia,CLL)患者5例,以CML最为多见;白血病患者的分布高峰值在15-岁至30~岁年龄组,15~岁年龄组542例,20-岁年龄组559例,25~岁年龄组514例,30一岁年龄组522例;20~岁以下年龄组(儿童组),其中ALL占49.36%(613/1242),AML占27.78%(245/1242),CML占22.78%(283/1242),CLL占0.08%(1/1242),以ALL患者构成比居多;白血病患者在我国30个地区的分布构成不均一,最低0例,最高494例,中位数101例。结论2000--2006年间,中华骨髓库中等待造血干细胞移植的白血病患者构成以儿童和青少年为主,男性高于女性,儿童白血病分类以ALL为主,应加强这一群体的健康教育和白血病防治工作。等待造血干细胞移植的白血病患者在各地区分布不均一,江苏、广东、浙江和山东地区患者有较高的分布格局。 展开更多
关键词 白血病 统计学分布 流行病学研究特征 造血干细胞移植
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应用SBT直接测序分型法研究中国南方汉族人群HLA五个基因座单倍型 被引量:13
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作者 高素青 邹红岩 +2 位作者 程良红 金士正 邓志辉 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期228-232,共5页
目的 研究中国南方汉族人群HLA—A、B、Cw、DRB1、DQB1等位基因多态性及单倍型的分布特征。方法 应用聚合酶链反应-直接测序分型(polymerase chain reaction sequence-based typing,PCR—SBT)法对186名中国南方汉族健康人群HLA—A、B... 目的 研究中国南方汉族人群HLA—A、B、Cw、DRB1、DQB1等位基因多态性及单倍型的分布特征。方法 应用聚合酶链反应-直接测序分型(polymerase chain reaction sequence-based typing,PCR—SBT)法对186名中国南方汉族健康人群HLA—A、B、Cw、DRB1、DQB1进行基因分型。结果 检出的HLA—A、B、Cw、DRB1、DQB1等位基因分别有28、49、24、29、20种。经统计分析A*0207-B*4601(10.81%),A*3303-B*5801(6.14%),B*4601-DRB1*0901(6.22%),B*4001*DRB1*0901(3.78%),DRB1*0901-DQB1*0303(12.16%)和DRB1*1202-DQB1*0301(8.38%)单倍型呈强连锁不平衡单倍型(RLF≥0.5,χ^2〉3.84,P〈0.05);A*0207B*4601Cw*0102(10.75%),A*3303-B*5801-Cw*0302(5.14%),A*0207-B*4601-DR*0901(5.07%),A*3303-B*5801-DRB1*0301(2.96%),A*0207-B*4601-Cw*0102-DRB1*0901-DQB1*0303(4.87%)和A*1101-B*1301-Cw*0304-DRB1*1501-DQB1*0601(2.43%)单倍型分别是中国南方汉族人群常见单倍型。结论 中国南方汉族人群HLA5个基因座单倍型分布具有高度的遗传多态性且有其自身分布特点。本研究获得的较完整的HLA5个基因座单倍型分布数据,将为人类学、HLA疾病相关性和器官移植等研究提供遗传学参考数据。 展开更多
关键词 人类白细胞抗原 单倍型 中国南方汉族
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地中海贫血患者找到人类白细胞抗原A-B-DR单倍型及抗原全相合供者的可能性 被引量:2
5
作者 高素青 程良红 +4 位作者 卢亮 金士正 李明 卓家才 邓志辉 《中国组织工程研究与临床康复》 CAS CSCD 北大核心 2008年第51期10147-10150,共4页
背景:选择适合的人类白细胞抗原匹配供者是实施造血干细胞移植治疗的关键,不同人种、地区和疾病人群的人类白细胞抗原与单倍型频率分布是评估地中海贫血患者选择适合供者的重要遗传学依据。目的:分析地中海贫血患者人类白细胞抗原A-B-D... 背景:选择适合的人类白细胞抗原匹配供者是实施造血干细胞移植治疗的关键,不同人种、地区和疾病人群的人类白细胞抗原与单倍型频率分布是评估地中海贫血患者选择适合供者的重要遗传学依据。目的:分析地中海贫血患者人类白细胞抗原A-B-DRB1单倍型和表型频率分布格局,估算其与骨髓库相合供者相配的概率。设计:病例-对照分析。对象:患者组为2000-06/2006-12广东地市级以上13家医院诊断为地中海贫血的108例患者,广东籍,彼此无血缘关系。正常对照组为2000-08/2006-12中华骨髓库招募的5352名广东籍健康供者,与患者无血缘关系。方法:应用最大似然性算法计算两组人类白细胞抗原A,B,DRB1单倍型及表型频率分布。根据人类白细胞抗原单倍型遗传特征,某一个体人类白细胞抗原A,B,DRB1表型频率等于相应的基因型频率之和。在由n个供者组成的供者群体找到至少1例与患者表型全相同供者的概率P,应用公式P=1-(1-Df)n计算,Df为供者表型频率。结果:患者组和对照组最常见单倍型和表型频率分布格局不同。正常对照组常见的单倍型为A2-B46-DR9,A33-B58-DR17,A11-B75-DR12,A11-B13-DR15和A33-B47-DR13;患者组常见的单倍型为A2-B46-DR9,A33-B58-DR17,A2-B46-DR14,A11-B60-DR12和A11-B75-DR12。正常对照组常见的表型频率分布情况为A2,33;B46,58;DR9,17,A2,11;B46,75;DR9,12,A11,33;B58,75;DR12,17,A2,2;B46,46;DR9,9和A2,11;B13,46;DR9,15;患者组常见的表型为A2,33;B46,58;DR9,17,A2,2;B46,46;DR9,9,A2,2;B46,46;DR9,14,A2,11;B46,60;DR9,12和A2,11;B46,75;DR9,15。两组之间相匹配的表型有19种,表型匹配概率为0.44%(19/4282)。人类白细胞抗原A24-B51-DR8,A3-B38-DR7,A24-B50-DR12,A3-B38-DR4,A24-B51-DR8和A24-B60-DR7等34条单倍型及A2,33;B46,58;DR9,17,A2,2;B46,46;DR9,9和A2,11;B46,75;DR9,15等67种表型,其频率在正常对照组有不同程度的降低,携带有这些单倍型或表型患者找到人类白细胞抗原单倍型相合或全相合供者的概率降低。结论:地中海贫血患者人类白细胞抗原A-B-DR单倍型频率分布呈高度遗传多态性,患者找到人类白细胞抗原全相合供者的概率取决于供者群体人类白细胞抗原表型频率。 展开更多
关键词 人类白细胞抗原 单倍型 地中海贫血
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中国南方汉族急性淋巴细胞白血病患者572例的HLA基因和单倍型分析 被引量:2
6
作者 高素青 程良红 +5 位作者 卢亮 卓家才 李明 金士正 邹红岩 邓志辉 《白血病.淋巴瘤》 CAS 2009年第1期9-11,14,共4页
目的研究HLA—A、B、DRB1基因和单倍型与中国南方汉族急性淋巴细胞白血病(ALL)的疾病相关性。方法应用最大似然性方法分别计算南方汉族ALL患者组572例和5645名南方汉族健康供者HLA—A、B、DRB1基因和单倍型频率,采用X^2检验方法比较... 目的研究HLA—A、B、DRB1基因和单倍型与中国南方汉族急性淋巴细胞白血病(ALL)的疾病相关性。方法应用最大似然性方法分别计算南方汉族ALL患者组572例和5645名南方汉族健康供者HLA—A、B、DRB1基因和单倍型频率,采用X^2检验方法比较其分布差异。结果ALL组HLA—A33、B58和DRB1^*17基因频率均低于对照组[HLA—A33(7.15%比93%,OR=0.73,P〈0.05)、B58(5.93%比8.75%,OR=0.64,P〈0.05)和DRB1^*17(5.15%比6.30%,OR=0.82,P〈0.05)];A3、B51和DRB^*12基因频率均高于对照组[A3(2.1%比1.26%,OR=1.7,P〈0.05),B51(7.25%比5.78%,OR=1.3,P〈0.05)和DRB^*12(16.13%比12.99%,OR=1.35,P〈0.05)];HLA—A33-B58-DRB1^*17单倍型频率低于对照组(2.46%比4.14%,OR=0.35,P〈0.05),A2-B51-DRB1^*12单倍型频率高于对照组(1.24%比0.89%,OR=1.66,P〈0.05)。结论携带有A33-B58-DRB1^*17单倍型个体可能与降低ALL的发病风险有相关性,A3基因和A2-B51-DRB1^*12可能与增加ALL发病风险有弱相关性。 展开更多
关键词 白血病 淋巴细胞 急性 HLA抗原 基因 单倍型
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529例中国汉族健康人群HLA-DQB1基因型遗传特征研究 被引量:1
7
作者 高素青 金士正 +3 位作者 邹红岩 何柳媚 王大明 邓志辉 《国际输血及血液学杂志》 CAS 2011年第2期100-103,共4页
目的探讨中国汉族健康人群HLA—DQBI基因型遗传特征。方法应用聚合酶链反应一测序分型(polymerase chain reaction sequenc}based typing,PCR—SBT)法对529例中国汉族健康人群HLA—DQBI位点进行基因测序分型。结果在529例中国汉族健... 目的探讨中国汉族健康人群HLA—DQBI基因型遗传特征。方法应用聚合酶链反应一测序分型(polymerase chain reaction sequenc}based typing,PCR—SBT)法对529例中国汉族健康人群HLA—DQBI位点进行基因测序分型。结果在529例中国汉族健康人群中,共检出18种等位基因,常见的等位基因依次是DQB】*03:01(23.16%),DQBl*03:03(15.88%),DQBl*06:01(11.63%)和DQBI*05:02(11.15%)。检出的HLA—DQBj基因型有84种,最常见的基因型依次是DQBj*03:0J—DQBI*。3:03(9.64%),DQBl*03:0j—DQBI*06:01(6.99%)和DQBI*03:0I-DQBI*03:01(4.54%),检出1例罕见基因型HLA—DQBj*03:0I—DQB1*06:20(0.19%)。检出12种模棱两可基因型组合。结论中国健康汉族人群HLA—DQBj基因型遗传较丰富,且有其自身遗传特点。HLA—DQBJ基因模棱两可组合结果应该引起注意并加以区分。 展开更多
关键词 人类白细胞抗原 基因型 中国汉族 基因测序
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HLA—A*02:251新等位基因克隆测序鉴定及序列分析
8
作者 金士正 高素青 +1 位作者 邹红岩 邓志辉 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期300-303,共4页
目的鉴定中国人群人类白细胞抗原(human leukocyte antigen, HLA)A*02:251新等位基因,分析新等位基因遗传特征。方法采用聚合酶链反应一测序分型法(polymerase chain reaction-sequence based typing,PCR-SBT)对组织配型健康供... 目的鉴定中国人群人类白细胞抗原(human leukocyte antigen, HLA)A*02:251新等位基因,分析新等位基因遗传特征。方法采用聚合酶链反应一测序分型法(polymerase chain reaction-sequence based typing,PCR-SBT)对组织配型健康供、患者进行HLA基因分型,发现先证者核苷酸杂合序列与已知序列不匹配,不能指定先证者HLA等位基因型,对先证者DNA扩增HLA—A位点第2~4外显子,PCR产物经克隆到PMD18-T质粒载体中以获得单链核苷酸序列,对克隆所得产物进行HLA-A基因的第2~4外显子双向测序分析。结果发现先证者的一个HLA—A*02:06:01基因被确认,而另一个HLAA基因为新等位基因,其序列被GenBank接受(编号为HM245348)。新等位基因序列通过IMGT/HLA数据库BLAST,与最相近的A*02:01:01:01相比,在第3外显子上有1个核苷酸的不同,即第383位G〉C,密码子128GAG→GAC,氨基酸由谷氨酸(Glu)→天门冬氨酸(Asp)。供、患者HLA—A、B、C、DQB1位点等位基因不匹配。结论该等位基因为新的HLA—A*02:251等位基因。中国人群HLA—A位点第3外显子核苷酸序列存在多态性。 展开更多
关键词 人类白细胞抗原 等位基因 外显子
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HLA-DRB1*1218新等位基因克隆测序鉴定及内含子序列分析
9
作者 高素青 邓志辉 徐筠娉 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期272-276,共5页
目的鉴定中国人群人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)DRB1*1218新等位基因,分析新等位基因第1和2内含子序列信息。方法采用聚合酶链反应一序列特异寡核苷酸探针反向杂交法(polymerase chain reaction-sequence specific... 目的鉴定中国人群人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)DRB1*1218新等位基因,分析新等位基因第1和2内含子序列信息。方法采用聚合酶链反应一序列特异寡核苷酸探针反向杂交法(polymerase chain reaction-sequence specific oligonucleotide probes,PCR—SSOP)对广东地区随机正常人群进行HLA常规基因分型,发现1个与HI。A-DRB1*120201相近的未知基因,对先证者DNA应用组特异性引物扩增HLA—DRB1位点第2外显子,PCR产物经克隆到质粒载体中以获得单链,对克隆所得产物进行HLA—DRB1基因的第2外显子及第1和第2内含子双向测序分析,并与DRBl*120201基因序列的第2外显子和DRBl*03010101等位基因内含子相比较。结果发现该个体的一个HLA—DRB1*080302基因被确认,而另一个HI。A—DRB1基因为新等位基因,其序列被GenBank接受(编号为FJ481086)。新等位基因与最相近的DRB1*120201相比,在第2外显子上有1个核苷酸的不同,即第262位G—C(密码子59GAG—CAG,氨基酸59G1u—GIn)。DRB1*1218与DRB1*03010101等位基因第2内含子序列完全相同,而与DRB1*03010101等位基因第1内含子序列相比较有12个碱基不同。结论发现并鉴定一个新的HLA等位基因,经世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA—DRB1*1218. 展开更多
关键词 人类白细胞抗原 等位基因 外显子 内含子
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人类白细胞抗原及单倍型与中国北方汉族急性非淋巴细胞白血病相关性研究 被引量:2
10
作者 高素青 程良红 +5 位作者 卢亮 金士正 王大明 程曦 邹红岩 邓志辉 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期43-45,共3页
急性非淋巴细胞白血病(AML)是我国白血病分类构成中最常见的一类,其疾病的发生、发展机制目前尚不十分清晰,可能与遗传因素、外界环境因素和自身免疫因素等有关。人类白细胞抗原(HLA)与肿瘤的免疫监视作用密切相关,H/A与白血病... 急性非淋巴细胞白血病(AML)是我国白血病分类构成中最常见的一类,其疾病的发生、发展机制目前尚不十分清晰,可能与遗传因素、外界环境因素和自身免疫因素等有关。人类白细胞抗原(HLA)与肿瘤的免疫监视作用密切相关,H/A与白血病相关性研究国内外文献均有报道,但结论不一。 展开更多
关键词 急性非淋巴细胞白血病 人类白细胞抗原 中国北方汉族 单倍型 自身免疫因素 遗传因素 环境因素 免疫监视
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643例中国北方汉族急性淋巴细胞白血病患者人类白细胞抗原连锁不平衡分析 被引量:1
11
作者 高素青 程良红 +5 位作者 卢亮 金士正 程曦 张印则 邹红岩 邓志辉 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期82-86,共5页
目的分析643例中国北方汉族急性淋巴细胞白血病(acute lymphoblastic leukemia,ALL)患者组和20359名健康对照组的人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)HLA—AB、BDR和A—B-DR单倍型频率及连锁不平衡分布差异。方法应用最... 目的分析643例中国北方汉族急性淋巴细胞白血病(acute lymphoblastic leukemia,ALL)患者组和20359名健康对照组的人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)HLA—AB、BDR和A—B-DR单倍型频率及连锁不平衡分布差异。方法应用最大似然性算法(expectation—maximization,EM)计算患者组和对照组的HLA-A-B、B—DRB1和A—B—DRB1单倍型频率及连锁不平衡参数,采用x^2检验比较其分布差异。结果HLA-A30-B13、A2-B46、A33-B58,B13-DR7、B46-DR9、B52-DR15、B58-DR17,A30-B13DR7、A33-B58-DR17和A1-B37-DR10单倍型是两组常见、共有呈强连锁不平衡单倍型。A30—B13、A2-B46、A33-B44、B13-DR7、A30-B13-DR7和A2-B46-DR9的单倍型频率和连锁不平衡水平,患者组低于对照组,差异有统计学意义(x^2〉3.84,P〈0.05)。A2-B52、A2-B27、A24-B8,B60-DR9、B27-DR4、B52-DR14、B44-DR17、B27-DR12、和A11-B27-DR12的单倍型频率和连锁不平衡水平,患者组高于对照组,差异有统计学意义(x^2〉3.84,P〈0.05)。结论643例北方汉族ALL患者组HLA-A-B、B-DRB1、A—B-DRB1单倍型频率分布及连锁不平衡遗传特征和对照组具有高度的同源性。患者组与对照组之间的部分HLA单倍型频率及连锁不平衡分布存在统计学差异。本研究结果为ALL与HLA疾病相关性及HLA相合供者的寻找提供了基础数据。 展开更多
关键词 急性白血病 人类白细胞抗原 单倍型 连锁不平衡
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