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机器学习模型预测开放手术修复腹主动脉瘤后急性肾损伤的发生
1
作者
盛昌
廖明媚
+1 位作者
周海洋
杨璞
《中南大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期213-220,共8页
目的:腹主动脉瘤是指腹主动脉扩张超过3.0 cm的一种病理状态,手术治疗方式包括开放手术(open surgical repair,OSR)和腔内修复(endovascular aneurysm repair,EVAR)。预测腹主动脉瘤患者OSR后急性肾损伤(acute kidney injury,AKI)的发...
目的:腹主动脉瘤是指腹主动脉扩张超过3.0 cm的一种病理状态,手术治疗方式包括开放手术(open surgical repair,OSR)和腔内修复(endovascular aneurysm repair,EVAR)。预测腹主动脉瘤患者OSR后急性肾损伤(acute kidney injury,AKI)的发生有助于术后临床决策。为找到一种更有效的预测方法,本研究对不同机器学习预测模型的效能进行测试。方法:回顾性收集2009年1月至2021年12月中南大学湘雅医院80例OSR患者的围手术期数据,手术均由血管外科医师实施。选择logistic回归、线性核支持向量机、高斯核支持向量机、随机森林4种常用的机器学习分类模型来实施预测。通过五重交叉验证来分析模型的性能。结果:33名患者出现AKI,4种分类模型的五重交叉验证结果表明:随机森林是预测AKI最精确的模型,曲线下面积为0.90±0.12。结论:机器学习模型可以精确预测术后AKI的发生,从而使血管外科医生能更早地处理并发症,并且可能有助于提高腹主动脉瘤OSR的临床疗效。
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关键词
腹主动脉瘤
急性肾损伤
机器学习
随机森林
支持向量机
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职称材料
O2-芋螺毒素Tx7.29抑制钙通道电流及镇痛活性研究
2
作者
吴赟
杨满意
+2 位作者
张玮
周茂军
曹锟
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期1411-1420,共10页
目的 海洋肉食性软体动物芋螺的毒液是生物活性多肽的一个宝贵来源。这些活性多肽大多是富含二硫键的神经毒素,通常称为芋螺毒素。在本研究中,发现了一个全新的O2超家族芋螺毒素Tx7.29,通过对其进行功能研究,期望发现新的镇痛药候选物...
目的 海洋肉食性软体动物芋螺的毒液是生物活性多肽的一个宝贵来源。这些活性多肽大多是富含二硫键的神经毒素,通常称为芋螺毒素。在本研究中,发现了一个全新的O2超家族芋螺毒素Tx7.29,通过对其进行功能研究,期望发现新的镇痛药候选物。方法 从织锦芋螺毒管c DNA文库中克隆得到Tx7.29的c DNA序列。通过化学合成,制得了Tx7.29的成熟肽,并通过质谱鉴定了其分子质量。通过膜片钳实验和动物实验确定Tx7.29的生物学功能。结果 Tx7.29的c DNA序列编码了一个包含68个氨基酸残基的芋螺毒素前体,由19个残基的信号肽、28个残基的前片段和22个残基的成熟肽组成。圆二色谱分析表明,β转角和反平行片层是Tx7.29二级结构中的主要组分。通过膜片钳实验发现,Tx7.29可以显著抑制大鼠背根神经节细胞的钙通道电流,但对钠电流和钾电流没有明显作用。在小鼠热板疼痛试验中,从0.5到4小时,Tx7.29以剂量依赖性的方式,增加了试验小鼠的热板潜伏时间。Tx7.29对ND7/23细胞无明显细胞毒性。结论 Tx7.29有望成为一种镇痛药物先导化合物,同时它的发现也扩大了O2-芋螺毒素的作用范围。
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关键词
芋螺毒素
O2超家族
Tx7.29
织锦芋螺
钙通道电流
镇痛活性
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职称材料
题名
机器学习模型预测开放手术修复腹主动脉瘤后急性肾损伤的发生
1
作者
盛昌
廖明媚
周海洋
杨璞
机构
中南大学湘雅医院
血管外科
中南大学湘雅医院国家卫健委纳米生物技术重点实验室
国家
老年疾病临床医学研究中心(
湘雅医院
)
出处
《中南大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期213-220,共8页
基金
湖南省自然科学基金(2021JJ31102)。
文摘
目的:腹主动脉瘤是指腹主动脉扩张超过3.0 cm的一种病理状态,手术治疗方式包括开放手术(open surgical repair,OSR)和腔内修复(endovascular aneurysm repair,EVAR)。预测腹主动脉瘤患者OSR后急性肾损伤(acute kidney injury,AKI)的发生有助于术后临床决策。为找到一种更有效的预测方法,本研究对不同机器学习预测模型的效能进行测试。方法:回顾性收集2009年1月至2021年12月中南大学湘雅医院80例OSR患者的围手术期数据,手术均由血管外科医师实施。选择logistic回归、线性核支持向量机、高斯核支持向量机、随机森林4种常用的机器学习分类模型来实施预测。通过五重交叉验证来分析模型的性能。结果:33名患者出现AKI,4种分类模型的五重交叉验证结果表明:随机森林是预测AKI最精确的模型,曲线下面积为0.90±0.12。结论:机器学习模型可以精确预测术后AKI的发生,从而使血管外科医生能更早地处理并发症,并且可能有助于提高腹主动脉瘤OSR的临床疗效。
关键词
腹主动脉瘤
急性肾损伤
机器学习
随机森林
支持向量机
Keywords
abdominal aortic aneurysm
acute kidney injury
machine learning
random forest
support vector machine
分类号
R692 [医药卫生—泌尿科学]
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职称材料
题名
O2-芋螺毒素Tx7.29抑制钙通道电流及镇痛活性研究
2
作者
吴赟
杨满意
张玮
周茂军
曹锟
机构
广东医科
大学
广东省医学分子诊断
重点
实验室
中南大学湘雅医院国家卫健委纳米生物技术重点实验室
中国科学院高能物理研究所
中南大学湘雅医院
国家
卫健
委
肿瘤蛋白质组学
重点
实验室
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期1411-1420,共10页
基金
国家自然科学基金(81703412,82071571)
广东省基础与应用基础研究基金(2020A1515111040,2019A1515110659,2022A1515010191,2019A1515010261)
+1 种基金
广东省医学科研基金(B2021197,A2020381)
广东省普通高校重点领域专项(2022ZDZX2023)资助。
文摘
目的 海洋肉食性软体动物芋螺的毒液是生物活性多肽的一个宝贵来源。这些活性多肽大多是富含二硫键的神经毒素,通常称为芋螺毒素。在本研究中,发现了一个全新的O2超家族芋螺毒素Tx7.29,通过对其进行功能研究,期望发现新的镇痛药候选物。方法 从织锦芋螺毒管c DNA文库中克隆得到Tx7.29的c DNA序列。通过化学合成,制得了Tx7.29的成熟肽,并通过质谱鉴定了其分子质量。通过膜片钳实验和动物实验确定Tx7.29的生物学功能。结果 Tx7.29的c DNA序列编码了一个包含68个氨基酸残基的芋螺毒素前体,由19个残基的信号肽、28个残基的前片段和22个残基的成熟肽组成。圆二色谱分析表明,β转角和反平行片层是Tx7.29二级结构中的主要组分。通过膜片钳实验发现,Tx7.29可以显著抑制大鼠背根神经节细胞的钙通道电流,但对钠电流和钾电流没有明显作用。在小鼠热板疼痛试验中,从0.5到4小时,Tx7.29以剂量依赖性的方式,增加了试验小鼠的热板潜伏时间。Tx7.29对ND7/23细胞无明显细胞毒性。结论 Tx7.29有望成为一种镇痛药物先导化合物,同时它的发现也扩大了O2-芋螺毒素的作用范围。
关键词
芋螺毒素
O2超家族
Tx7.29
织锦芋螺
钙通道电流
镇痛活性
Keywords
conotoxin
O2 superfamily
Tx7.29
Conus textile
calcium currents
analgesic activity
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
机器学习模型预测开放手术修复腹主动脉瘤后急性肾损伤的发生
盛昌
廖明媚
周海洋
杨璞
《中南大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
2
O2-芋螺毒素Tx7.29抑制钙通道电流及镇痛活性研究
吴赟
杨满意
张玮
周茂军
曹锟
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
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职称材料
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