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猪源艰难梭菌的分离鉴定与生物学特性分析
被引量:
2
1
作者
张悦
艾伟诚
+6 位作者
王斐
梁婉
谢思思
华琳
李春辉
彭忠
吴斌
《中国动物传染病学报》
CAS
北大核心
2022年第2期27-33,共7页
为了了解我国猪源艰难梭菌(Clostridioides difficile,CD)的病原学及分子生物学特征,本研究收集湖北和广东地区疑似患有肠炎的病猪粪便样品,提取基因组DNA,利用已经报道的5重PCR方法对艰难梭菌的16S rDNA基因、毒素A的编码基因tcdA、毒...
为了了解我国猪源艰难梭菌(Clostridioides difficile,CD)的病原学及分子生物学特征,本研究收集湖北和广东地区疑似患有肠炎的病猪粪便样品,提取基因组DNA,利用已经报道的5重PCR方法对艰难梭菌的16S rDNA基因、毒素A的编码基因tcdA、毒素B的编码基因tcdB以及二元毒素编码基因cdtA和cdtB进行检测,同时采用厌氧培养法,对PCR检测毒素编码基因为阳性的粪便样品进行艰难梭菌的分离培养,并对所分离到的菌株进行药物敏感性测试和全基因组重测序。结果发现:本研究所采集到的97份粪便样品经PCR检测显示有80份样品为16S rDNA阳性,其中仅有2份样品为tcdA和tcdB阳性。从这两份样品中分离出一株tcdA和tcdB阳性的艰难梭菌,命名为HuB01。药敏试验发现,HuB01对头孢菌素(FOX)、氯霉素(CHL)、克林霉素(CLI)、氨苄西林(AMP)、头孢曲松钠(CRO)耐药,对莫西沙星(MXF)和万古霉素(VAN)表现出中度耐药,而对利福西明(RFX)、甲硝哒唑(MTZ)、非达霉素(FDX)敏感。全基因组重测序发现HuB01的全基因组大小为3.93 Mb,平均GC含量为28.31%,编码3691个蛋白基因及63个tRNA和10个rRNA;3691个基因中含有31个耐药基因和164个毒力相关基因。多序列位点分型(MLST)结果显示HuB01为ST11。由于目前国内对于艰难梭菌的研究大多集中在人医领域,因此本研究可为兽医领域艰难梭菌的相关研究奠定基础。
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关键词
艰难梭菌
分离鉴定
PCR检测
药敏试验
全基因组重测序
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职称材料
题名
猪源艰难梭菌的分离鉴定与生物学特性分析
被引量:
2
1
作者
张悦
艾伟诚
王斐
梁婉
谢思思
华琳
李春辉
彭忠
吴斌
机构
华中农业
大学
动物医学院农业微生物学国家重点实验室生猪健康养殖协同创新
中心
湖北省农业科学院畜牧兽医研究所农业农村部畜禽细菌病防治制剂创制重点实验室
中南大学湘雅医院感染与控制中心
出处
《中国动物传染病学报》
CAS
北大核心
2022年第2期27-33,共7页
基金
湖北省创新行动计划项目(2018skjcx05)。
文摘
为了了解我国猪源艰难梭菌(Clostridioides difficile,CD)的病原学及分子生物学特征,本研究收集湖北和广东地区疑似患有肠炎的病猪粪便样品,提取基因组DNA,利用已经报道的5重PCR方法对艰难梭菌的16S rDNA基因、毒素A的编码基因tcdA、毒素B的编码基因tcdB以及二元毒素编码基因cdtA和cdtB进行检测,同时采用厌氧培养法,对PCR检测毒素编码基因为阳性的粪便样品进行艰难梭菌的分离培养,并对所分离到的菌株进行药物敏感性测试和全基因组重测序。结果发现:本研究所采集到的97份粪便样品经PCR检测显示有80份样品为16S rDNA阳性,其中仅有2份样品为tcdA和tcdB阳性。从这两份样品中分离出一株tcdA和tcdB阳性的艰难梭菌,命名为HuB01。药敏试验发现,HuB01对头孢菌素(FOX)、氯霉素(CHL)、克林霉素(CLI)、氨苄西林(AMP)、头孢曲松钠(CRO)耐药,对莫西沙星(MXF)和万古霉素(VAN)表现出中度耐药,而对利福西明(RFX)、甲硝哒唑(MTZ)、非达霉素(FDX)敏感。全基因组重测序发现HuB01的全基因组大小为3.93 Mb,平均GC含量为28.31%,编码3691个蛋白基因及63个tRNA和10个rRNA;3691个基因中含有31个耐药基因和164个毒力相关基因。多序列位点分型(MLST)结果显示HuB01为ST11。由于目前国内对于艰难梭菌的研究大多集中在人医领域,因此本研究可为兽医领域艰难梭菌的相关研究奠定基础。
关键词
艰难梭菌
分离鉴定
PCR检测
药敏试验
全基因组重测序
Keywords
Clostridioides difficile
isolation and identification
PCR detection
antimicrobial susceptibility
whole genome
分类号
S858.61 [农业科学—临床兽医学]
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题名
作者
出处
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被引量
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1
猪源艰难梭菌的分离鉴定与生物学特性分析
张悦
艾伟诚
王斐
梁婉
谢思思
华琳
李春辉
彭忠
吴斌
《中国动物传染病学报》
CAS
北大核心
2022
2
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