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汉滩病毒Gc的细胞免疫反应性评估和验证 被引量:1
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作者 谢明阳 孙报增 +8 位作者 马思婕 杨端 罗程 王越越 曹宇宸 康文龙 张赟 杨琨 姜东伯 《陆军军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第19期2007-2017,共11页
目的筛选、鉴定并验证汉滩病毒包膜糖蛋白C末端(Hantaan virus glycoprotein C-terminal,HTNV Gc)上免疫反应性表位。方法在预测覆盖率超过全球98%人群主要组织相容性复合物(major histocompatibility complex,MHC)基因基础上,通过免疫... 目的筛选、鉴定并验证汉滩病毒包膜糖蛋白C末端(Hantaan virus glycoprotein C-terminal,HTNV Gc)上免疫反应性表位。方法在预测覆盖率超过全球98%人群主要组织相容性复合物(major histocompatibility complex,MHC)基因基础上,通过免疫表位数据库(Immune Epitope Database,IEDB)、丹麦技术大学(Technical University of Denmark,DTU)等免疫信息学前沿算法系统分析HTNV Gc上9肽和15肽表位的亲和力,使用Vaxijen工具分析免疫原性,使用Blastp工具分析种间种内保守性;双向层次聚类比较MHC-Ⅰ类和Ⅱ类限制性表位的交叉免疫反应性;使用分子对接模拟出优势表位与MHC对接的可能结果;通过酶联免疫斑点(ELISpot)实验验证计算机分析结果。结果将多种生物信息学算法结果整合后,获得高亲和力、种间种内保守和强免疫原性的9肽和15肽表位,分别为8和80个,其中人鼠共同优势表位8个;聚类分析证明H-2基因型与HLA基因型存在部分相似;分子对接结果模拟出下优势表位与多个MHC基因型对接良好,且与亲和力分析结果一致;在非优势表位对比下,优势表位组小鼠脾细胞分泌IFN-γ的量更高。结论使用多种生物信息学算法成功筛选出HTNV Gc上优势表位,并通过ELISpot实验鉴定了上述表位的细胞免疫反应性。 展开更多
关键词 汉滩病毒 糖蛋白 表位 计算机预测 免疫反应性
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