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胰腺癌细胞的异质性和肿瘤细胞分子亚型鉴定:基于CEACAM5、LGALS1和CENPF基因表达
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作者 孙敬杰 卢鹏 +1 位作者 管莎莎 刘淞淞 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期1567-1576,共10页
目的探讨胰腺癌的异质性和肿瘤细胞分子亚型鉴定新方法,鉴定胰腺癌发展过程中的特征基因。方法分析GSE155698数据集中16例胰腺癌组织单细胞测序数据,初步聚类后,根据各细胞EPCAM基因的表达情况分离胰腺癌细胞,再聚类、分群后鉴定特征基... 目的探讨胰腺癌的异质性和肿瘤细胞分子亚型鉴定新方法,鉴定胰腺癌发展过程中的特征基因。方法分析GSE155698数据集中16例胰腺癌组织单细胞测序数据,初步聚类后,根据各细胞EPCAM基因的表达情况分离胰腺癌细胞,再聚类、分群后鉴定特征基因,进行通路GO和KEGG通路富集分析,并进行拟时序分析。提取癌症基因组图谱179例胰腺癌患者和正常胰腺组织基因表达库中171例正常人基因表达数据、临床信息及预后情况,结合人类蛋白表达图谱蛋白表达情况对各亚型关键基因进行验证。最后通过细胞功能实验验证CEACAM5、LGALS1、CENPF对胰腺癌细胞的增殖、侵袭与迁移等功能的影响。结果对16例胰腺癌样本48570个细胞进行分析后发现,细胞总共被聚类为22群,其中包含5群胰腺癌细胞。这些胰腺癌细胞被分为3群:亚型1、亚型2和亚型3,分别具有完全不同的基因表达模式和功能。亚型1胰腺癌细胞的特征基因主要富集于蛋白代谢过程的负调节、铁死亡和抗原提呈相关通路;亚型2胰腺癌细胞的特征基因主要于肽合成过程、翻译和核糖体相关通路;亚型3胰腺癌细胞的特征基因主要富集于ATP代谢过程、糖酵解/葡萄糖生成和细胞周期相关通路。亚型2和亚型3可能是由亚型1发展而来,亚型3可能是胰腺癌细胞发育的最终状态。各亚型的关键特征基因CEACAM5、LGALS1、CENPF的表达情况也在发育轨迹中展现了不同状态。基因和蛋白表达层面均显示各亚型的关键特征基因CEACAM5、LGALS1、CENPF在胰腺癌中高表达,且与患者的不良预后相关,当下调CEACAM5、LGALS1、CENPF的表达后,胰腺癌细胞的增殖(P<0.05)、迁移(P<0.05)和侵袭(P<0.05)能力均被抑制。结论胰腺癌细胞有较强的异质性,基于CEACAM5、LGALS1、CENPF基因表达可鉴定肿瘤细胞发展过程中的不同分子亚型,且影响胰腺癌细胞的增殖、侵袭和转移。 展开更多
关键词 胰腺癌 分子亚型 异质性 单细胞测序
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癌症相关缺血性脑卒中的研究进展
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作者 林佳才 张倩 +4 位作者 赵宁 伍思婷 刘辉 崔芳 徐睿 《中国医药》 2024年第10期1573-1576,共4页
癌症与缺血性脑卒中存在非常紧密的联系。随着癌症患者人数逐年递增,癌症相关缺血性脑卒中患者数量也呈现出逐年增长的趋势,严重威胁患者的预期寿命和生活质量。目前研究发现癌症相关缺血性脑卒中较传统认知的缺血性脑卒中在诸多方面均... 癌症与缺血性脑卒中存在非常紧密的联系。随着癌症患者人数逐年递增,癌症相关缺血性脑卒中患者数量也呈现出逐年增长的趋势,严重威胁患者的预期寿命和生活质量。目前研究发现癌症相关缺血性脑卒中较传统认知的缺血性脑卒中在诸多方面均存在显著差异,早期认知并识别上述差异有助于临床医师更好地筛查和服务癌症相关缺血性脑卒中患者。本文对癌症相关缺血性脑卒中的国内外研究进行详细的总结和分析,从流行病学情况、病因分类、实验室化验结果、影像学特点以及治疗预防策略等方面展开综述。 展开更多
关键词 癌症 缺血性脑卒中 颅脑磁共振成像 病因 预防
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