基于转录组测序分析人大细胞肺癌NCI-H460细胞对类泛素化抑制剂MLN4924的潜在耐药机制

目的探讨人大细胞肺癌NCI-H460细胞对类泛素化抑制剂MLN4924潜在新型耐药机制。方法利用MLN4924处理NCI-H460细胞,筛选和建立耐药细胞株。对普通NCI-H460对照细胞、MLN4924处理8 h加药细胞株、48 h加药细胞株和建立成功的耐药株进行高通量转录组测序。根据测序结果筛选差异表达基因,并进行通路富集分析。多组间比较采用单因素方差分析,组间两两比较采用Dunnett-t检验。结果共构建3个NCI-H460耐药细胞株。转录组测序分析显示,与对照比较,MLN4924处理8 h加药株、处理48 h加药株、三株耐药株分别筛选出5303、4186、3388、3675和3267个差异表达基因,包括ABCA9、ABCA13、CYR61和CYP39A1等基因。RT-qRCR实验进一步验证了在瞬时加药组和耐药株中ABCA9和CYR61基因高表达。GO富集分析结果显示,差异表达基因与细胞周期、细胞凋亡、细胞间信号转导和细胞黏附等细胞生物过程高度相关,还与细胞核和细胞膜等细胞组分密切相关。KEGG通路富集分析结果显示,耐药细胞中差异表达基因集中在MAPK信号通路、PI3K/Akt信号通路和cAMP信号通路等。结论在人大细胞肺癌NCI-H460细胞中,ABCA9、CYR61、ABCC8和CYP4F12等基因的表达变化可能会提高其对MLN4924的耐药能力。这种耐药能力可能与MAPK信号通路、PI3K/Akt信号通路和cAMP信号通路有关。