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题名iTRAQ技术检测烟雾病病人硬脑膜特异性蛋白表达
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作者
张小军
尹林
刘思远
张丽军
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机构
上海天佑医院神经外科
上海市公共卫生临床中心新药临床研究中心
中国人民解放军海军第九〇五医院神经外科
上海师范大学信息与机电工程学院
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出处
《中国临床神经外科杂志》
2021年第4期261-265,共5页
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基金
十三五重大新药创制课题(2017ZX09304027)。
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文摘
目的优化硬脑膜蛋白质的提取方法,筛选烟雾病(MMD)病人硬脑膜特异性表达蛋白质。方法收集96例MMD和13例非MMD病人的硬脑膜组织,用胶原酶Ⅳ孵育去除硬脑膜表面的血液,用机械破碎或液氮研磨方法提取蛋白质,一维凝胶电泳分离后进行质谱鉴定,用同位素相对标记与绝对定量(iTRAQ)技术进行标记、分离和鉴定差异蛋白质,应用R语言和生物信息学分析筛选MMD相关蛋白质,再应用组织芯片技术验证差异蛋白质表达。结果胶原酶Ⅳ消化、液氮研磨和十二烷基硫酸钠法提取硬脑膜蛋白质效果较好;iTRAQ技术和生信分析发现23个差异蛋白质,组织芯片结果证实MMD病人硬脑膜组织SLC4A1蛋白表达明显下调。结论iTRAQ技术可以很好地进行标记、分离和鉴定硬脑膜组织差异蛋白质,SLC4A1可能在MMD发病过程中具有一定的作用。
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关键词
烟雾病
硬脑膜
蛋白质组
生物信息学
组织芯片
同位素相对标记与绝对定量技术(iTRAQ)
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Keywords
Moyamoya disease
Dura mater
Proteomics
Bioinformatics
Tissue microarray
isobaric tag for relative and absolute quantitation(iTRAQ)technique
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分类号
R743
[医药卫生—神经病学与精神病学]
Q786
[生物学—分子生物学]
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