联合多种高通量表达谱数据库挖掘胃癌S100基因的差异表达

目的:探讨利用生物信息学方法筛选胃癌组织与正常胃组织差异表达基因的可行性及具体方法,寻找胃癌相关S100基因.方法:联合SAGE分析、虚拟电子杂交和虚拟微阵列,挖掘癌基因组解剖计划和基因表达综合数据库资源中关于胃癌和正常胃组织差异表达S100基因.结果:5个S100基因在胃癌组织中上调表达,包括S100A2、S100A3、S100A4、S100A7和S100A10.S100A3是新的胃癌过表达基因.结论:首次探讨性利用生物信息学方法系统分析胃癌S100基因表达.多个S100家族成员在胃癌中上调表达.联合多数据库挖掘肿瘤相关基因是一个可靠的方法,给进一步生物学实验以大量的提示.