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构建铁死亡相关的lncRNAs预测肝细胞癌预后模型
1
作者
张聪悦
孙殿兴
《胃肠病学和肝病学杂志》
CAS
2024年第6期753-762,共10页
目的通过铁死亡相关lncRNAs差异基因构建反映肝细胞(hepatocellular carcinoma,HCC)患者生存情况的预后模型。方法我们从TCGA和FerrDb数据库中收集了与铁死亡相关的lncRNA表达谱以及临床病理情况。通过对总生存期(overall survival,OS)...
目的通过铁死亡相关lncRNAs差异基因构建反映肝细胞(hepatocellular carcinoma,HCC)患者生存情况的预后模型。方法我们从TCGA和FerrDb数据库中收集了与铁死亡相关的lncRNA表达谱以及临床病理情况。通过对总生存期(overall survival,OS)的共表达分析,研究铁死亡相关lncRNAs与HCC患者生存的关系。利用Cox回归分析和LASSO算法,构建22个差异表达的lncRNAs的预后模型。结果Kaplan-Meier分析显示,高风险的lncRNAs谱与HCC的不良预后有关。我们的风险评估模型在预测HCC的预后方面优于传统的临床数据。GSEA揭示了高风险组和低风险组个体的免疫和肿瘤相关通路。此外,TCGA显示T细胞功能,包括B细胞、细胞溶解、巨噬细胞、MHC-I类、肥大细胞、中性粒细胞、NK细胞、辅助T细胞、Ⅰ型-IFN和Ⅱ型-IFN,在高危组和低危组之间有明显差异。免疫检查点如TNFSF18、IDO2、CD276、NRP1和TNFSF4在两个风险组之间也有不同表达。选取MIR4435-2HG、SNHG4、PRRT3-AS1和PTOV1-AS1在肝癌细胞中进行验证,结果显示这四个基因在肝癌细胞中的表达上调。结论我们的研究结果有望为HCC诊断、靶向治疗及预后评估提供新的研究方向。
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关键词
铁死亡
长链非编码RNA
生物信息学
肝细胞癌
预后模型
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职称材料
慢性乙肝患者锌指蛋白A20、CTGF、FibroScan与肝纤维化关系
2
作者
张松
赵子龙
+6 位作者
胡倩
李健
王晓静
耿惠杰
康海燕
孙殿兴
郭争荣
《公共卫生与预防医学》
2024年第3期133-136,共4页
目的观察锌指蛋白A20(A20)、结缔组织生长因子(connective tissue growth factor,CTGF)在慢性乙型肝炎患者肝脏组织中的表达和定位情况,并检测瞬时肝弹性测定(FibroScan),探讨其与肝脏纤维化的关系。方法对160例来自2017年1月至2020年6...
目的观察锌指蛋白A20(A20)、结缔组织生长因子(connective tissue growth factor,CTGF)在慢性乙型肝炎患者肝脏组织中的表达和定位情况,并检测瞬时肝弹性测定(FibroScan),探讨其与肝脏纤维化的关系。方法对160例来自2017年1月至2020年6月石家庄市第五医院住院患者的慢性乙型肝炎患者,肝组织中的A20、CTGF按照肝脏病理纤维化及炎症分期,行免疫组化定量检测,并检测FibroScan,进行统计学分析。结果肝组织A20、CTGF表达随肝脏病理纤维化及炎症加重而增加,各期与对照组之间差异有统计学意义(P<0.05),相邻组间两两比较差异有统计学意义(P<0.05)。FibroScan亦随肝脏病理纤维化及炎症加重而增加,各期与对照组之间差异有统计学意义(P<0.05),相邻组间两两比较差异无统计学意义(P>0.05)。肝脏A20、CTGF之间呈正相关,r=0.796,(P<0.05)。结论慢性乙型肝炎患者A20、CTGF、FibroScan与肝脏纤维化程度均呈正相关,A20、CTGF亦与肝脏炎症程度正相关,其可作为评价肝脏炎症及纤维化严重程度的指标,进一步指导患者的抗炎抗纤维化的治疗。
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关键词
乙型肝炎
锌指蛋白A20
结缔组织生长因子
瞬时肝弹性测定
肝纤维化
免疫组化
原文传递
锌指蛋白A20及碱性成纤维细胞生长因子与慢性乙型肝炎患者肝脏纤维化的相关性研究
3
作者
张松
黄肖雨
+6 位作者
孟明辉
胡倩
赵子龙
李健
康海燕
孙殿兴
郭争荣
《中国医师进修杂志》
2024年第12期1061-1064,共4页
目的探讨锌指蛋白A20(A20)及碱性成纤维细胞生长因子(BFGF)与慢性乙型肝炎患者肝脏纤维化的相关性。方法采用回顾性研究的方法,选取2019年1月至2020年12月在石家庄市第五医院诊治的120例慢性乙型肝炎患者,均行肝组织穿刺活检术,另选择...
目的探讨锌指蛋白A20(A20)及碱性成纤维细胞生长因子(BFGF)与慢性乙型肝炎患者肝脏纤维化的相关性。方法采用回顾性研究的方法,选取2019年1月至2020年12月在石家庄市第五医院诊治的120例慢性乙型肝炎患者,均行肝组织穿刺活检术,另选择行肝脏血管瘤切除术的肝脏病理标本25例,分析肝组织A20、BFGF表达与肝脏病理纤维化分期及炎性反应分级的相关性。结果A20在S1~S4期的表达分别为(7.01±1.98)%、(11.26±3.59)%、(17.68±6.32)%、(27.32±8.73)%,明显高于S0期的(0.93±0.81)%;BFGF在S1~S4期的表达分别为(6.12±1.22)%、(10.18±2.43)%、(16.94±5.06)%、(25.99±7.57)%,明显高于S0期的(0.81±0.29)%,差异均有统计学意义(P<0.05)。A20在G1~G4级的表达分别为(6.56±1.87)%、(10.01±3.29)%、(15.54±5.01)%、(25.86±8.02)%,明显高于G0级的(0.85±0.71)%;BFGF在G1~G4级的表达分别为(5.91±1.52)%、(9.65±2.48)%、(15.03±4.86)%、(24.62±7.22)%,明显高于G0级的(0.79±0.41)%,差异均有统计学意义(P<0.05)。Pearson检验结果表明,肝组织A20表达与BFGF表达呈正相关(r=0.824,P<0.05)。结论肝组织A20、BFGF表达随肝脏病理纤维化分期及炎性反应分级程度加重而增加,可作为评价肝脏纤维化严重程度的重要指标。
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关键词
肝炎
乙型
慢性
纤维化
锌指蛋白A20
碱性成纤维细胞生长因子
原文传递
题名
构建铁死亡相关的lncRNAs预测肝细胞癌预后模型
1
作者
张聪悦
孙殿兴
机构
河北医
科
大学
中国人民解放军联勤保障部队第九八〇医院肝病科
出处
《胃肠病学和肝病学杂志》
CAS
2024年第6期753-762,共10页
文摘
目的通过铁死亡相关lncRNAs差异基因构建反映肝细胞(hepatocellular carcinoma,HCC)患者生存情况的预后模型。方法我们从TCGA和FerrDb数据库中收集了与铁死亡相关的lncRNA表达谱以及临床病理情况。通过对总生存期(overall survival,OS)的共表达分析,研究铁死亡相关lncRNAs与HCC患者生存的关系。利用Cox回归分析和LASSO算法,构建22个差异表达的lncRNAs的预后模型。结果Kaplan-Meier分析显示,高风险的lncRNAs谱与HCC的不良预后有关。我们的风险评估模型在预测HCC的预后方面优于传统的临床数据。GSEA揭示了高风险组和低风险组个体的免疫和肿瘤相关通路。此外,TCGA显示T细胞功能,包括B细胞、细胞溶解、巨噬细胞、MHC-I类、肥大细胞、中性粒细胞、NK细胞、辅助T细胞、Ⅰ型-IFN和Ⅱ型-IFN,在高危组和低危组之间有明显差异。免疫检查点如TNFSF18、IDO2、CD276、NRP1和TNFSF4在两个风险组之间也有不同表达。选取MIR4435-2HG、SNHG4、PRRT3-AS1和PTOV1-AS1在肝癌细胞中进行验证,结果显示这四个基因在肝癌细胞中的表达上调。结论我们的研究结果有望为HCC诊断、靶向治疗及预后评估提供新的研究方向。
关键词
铁死亡
长链非编码RNA
生物信息学
肝细胞癌
预后模型
Keywords
Ferroptosis
Long non-coding RNA
Bioinformatics
Hepatocellular carcinoma
Prognostic model
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
慢性乙肝患者锌指蛋白A20、CTGF、FibroScan与肝纤维化关系
2
作者
张松
赵子龙
胡倩
李健
王晓静
耿惠杰
康海燕
孙殿兴
郭争荣
机构
河北省石家庄市第五
医院
感染六
科
中国人民解放军联勤保障部队第九八〇医院肝病科
全军
肝病
诊疗中心
石家庄市
人民
医院
消化五
科
出处
《公共卫生与预防医学》
2024年第3期133-136,共4页
基金
河北省2022年度医学科学研究课题计划(20221685)。
文摘
目的观察锌指蛋白A20(A20)、结缔组织生长因子(connective tissue growth factor,CTGF)在慢性乙型肝炎患者肝脏组织中的表达和定位情况,并检测瞬时肝弹性测定(FibroScan),探讨其与肝脏纤维化的关系。方法对160例来自2017年1月至2020年6月石家庄市第五医院住院患者的慢性乙型肝炎患者,肝组织中的A20、CTGF按照肝脏病理纤维化及炎症分期,行免疫组化定量检测,并检测FibroScan,进行统计学分析。结果肝组织A20、CTGF表达随肝脏病理纤维化及炎症加重而增加,各期与对照组之间差异有统计学意义(P<0.05),相邻组间两两比较差异有统计学意义(P<0.05)。FibroScan亦随肝脏病理纤维化及炎症加重而增加,各期与对照组之间差异有统计学意义(P<0.05),相邻组间两两比较差异无统计学意义(P>0.05)。肝脏A20、CTGF之间呈正相关,r=0.796,(P<0.05)。结论慢性乙型肝炎患者A20、CTGF、FibroScan与肝脏纤维化程度均呈正相关,A20、CTGF亦与肝脏炎症程度正相关,其可作为评价肝脏炎症及纤维化严重程度的指标,进一步指导患者的抗炎抗纤维化的治疗。
关键词
乙型肝炎
锌指蛋白A20
结缔组织生长因子
瞬时肝弹性测定
肝纤维化
免疫组化
Keywords
Hepatitis B
Zinc finger protein A20
Connective tissue growth factor
FibroScan
Liver fibrosis
Immunohistochemistry
分类号
R181 [医药卫生—流行病学]
原文传递
题名
锌指蛋白A20及碱性成纤维细胞生长因子与慢性乙型肝炎患者肝脏纤维化的相关性研究
3
作者
张松
黄肖雨
孟明辉
胡倩
赵子龙
李健
康海燕
孙殿兴
郭争荣
机构
石家庄市第五
医院
感染六
科
中国人民解放军联勤保障部队第九八〇医院肝病科
全军
肝病
诊疗中心
石家庄市
人民
医院
消化
科
出处
《中国医师进修杂志》
2024年第12期1061-1064,共4页
基金
河北省2022年度医学科学研究课题计划(20221685)。
文摘
目的探讨锌指蛋白A20(A20)及碱性成纤维细胞生长因子(BFGF)与慢性乙型肝炎患者肝脏纤维化的相关性。方法采用回顾性研究的方法,选取2019年1月至2020年12月在石家庄市第五医院诊治的120例慢性乙型肝炎患者,均行肝组织穿刺活检术,另选择行肝脏血管瘤切除术的肝脏病理标本25例,分析肝组织A20、BFGF表达与肝脏病理纤维化分期及炎性反应分级的相关性。结果A20在S1~S4期的表达分别为(7.01±1.98)%、(11.26±3.59)%、(17.68±6.32)%、(27.32±8.73)%,明显高于S0期的(0.93±0.81)%;BFGF在S1~S4期的表达分别为(6.12±1.22)%、(10.18±2.43)%、(16.94±5.06)%、(25.99±7.57)%,明显高于S0期的(0.81±0.29)%,差异均有统计学意义(P<0.05)。A20在G1~G4级的表达分别为(6.56±1.87)%、(10.01±3.29)%、(15.54±5.01)%、(25.86±8.02)%,明显高于G0级的(0.85±0.71)%;BFGF在G1~G4级的表达分别为(5.91±1.52)%、(9.65±2.48)%、(15.03±4.86)%、(24.62±7.22)%,明显高于G0级的(0.79±0.41)%,差异均有统计学意义(P<0.05)。Pearson检验结果表明,肝组织A20表达与BFGF表达呈正相关(r=0.824,P<0.05)。结论肝组织A20、BFGF表达随肝脏病理纤维化分期及炎性反应分级程度加重而增加,可作为评价肝脏纤维化严重程度的重要指标。
关键词
肝炎
乙型
慢性
纤维化
锌指蛋白A20
碱性成纤维细胞生长因子
Keywords
Hepatitis B,chronic
Fibrosis
Zinc finger protein A20
Basic fibroblast growth factor
分类号
R512.62 [医药卫生—内科学]
R575.2 [医药卫生—消化系统]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
构建铁死亡相关的lncRNAs预测肝细胞癌预后模型
张聪悦
孙殿兴
《胃肠病学和肝病学杂志》
CAS
2024
0
下载PDF
职称材料
2
慢性乙肝患者锌指蛋白A20、CTGF、FibroScan与肝纤维化关系
张松
赵子龙
胡倩
李健
王晓静
耿惠杰
康海燕
孙殿兴
郭争荣
《公共卫生与预防医学》
2024
0
原文传递
3
锌指蛋白A20及碱性成纤维细胞生长因子与慢性乙型肝炎患者肝脏纤维化的相关性研究
张松
黄肖雨
孟明辉
胡倩
赵子龙
李健
康海燕
孙殿兴
郭争荣
《中国医师进修杂志》
2024
0
原文传递
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