目的采用生物信息学技术研究7-脱氢胆固醇还原酶(DHCR7)在膀胱癌中的表达及其与临床预后的关系等。方法采用TCGA、GEO数据库分析膀胱癌与正常膀胱组织中DHCR7基因的表达,利用Human Protein Atlas数据库验证DHCR7蛋白在膀胱癌组织中的表...目的采用生物信息学技术研究7-脱氢胆固醇还原酶(DHCR7)在膀胱癌中的表达及其与临床预后的关系等。方法采用TCGA、GEO数据库分析膀胱癌与正常膀胱组织中DHCR7基因的表达,利用Human Protein Atlas数据库验证DHCR7蛋白在膀胱癌组织中的表达,通过Kaplan Meier法分析DHCR7基因表达水平与膀胱癌患者预后及生存情况之间的关系;应用GeneMANIA数据库构建蛋白质互作网络(PPI),并通过GEPIA2分析互作基因在膀胱癌中的相关性;依据DHCR7基因mRNA相对表达水平,应用GSEA 4.1.0软件对TCGA数据进行分层基因富集分析。结果膀胱癌组织中DHCR7基因mRNA相对表达水平明显高于癌旁组织及正常膀胱组织,差异有统计学意义(P<0.05);不同肿瘤分期、分级、分子分型膀胱癌组织中DHCR7基因mRNA相对表达水平比较,差异有统计学意义(P<0.05);与DHCR7低表达组相比,DHCR7高表达组的总生存期、肿瘤特异性生存期、无进展生存期更低,差异有统计学意义(P<0.05);PPI及基因富集分析显示DHCR7基因功能主要与胆固醇稳态、MTORC1通路等有关。结论DHCR7基因在膀胱癌中高表达,与临床不良预后密切相关,DHCR7基因可能通过多种机制参与肿瘤发展过程,有望成为膀胱癌干预治疗、预后评估新的靶点。展开更多
文摘目的采用生物信息学技术研究7-脱氢胆固醇还原酶(DHCR7)在膀胱癌中的表达及其与临床预后的关系等。方法采用TCGA、GEO数据库分析膀胱癌与正常膀胱组织中DHCR7基因的表达,利用Human Protein Atlas数据库验证DHCR7蛋白在膀胱癌组织中的表达,通过Kaplan Meier法分析DHCR7基因表达水平与膀胱癌患者预后及生存情况之间的关系;应用GeneMANIA数据库构建蛋白质互作网络(PPI),并通过GEPIA2分析互作基因在膀胱癌中的相关性;依据DHCR7基因mRNA相对表达水平,应用GSEA 4.1.0软件对TCGA数据进行分层基因富集分析。结果膀胱癌组织中DHCR7基因mRNA相对表达水平明显高于癌旁组织及正常膀胱组织,差异有统计学意义(P<0.05);不同肿瘤分期、分级、分子分型膀胱癌组织中DHCR7基因mRNA相对表达水平比较,差异有统计学意义(P<0.05);与DHCR7低表达组相比,DHCR7高表达组的总生存期、肿瘤特异性生存期、无进展生存期更低,差异有统计学意义(P<0.05);PPI及基因富集分析显示DHCR7基因功能主要与胆固醇稳态、MTORC1通路等有关。结论DHCR7基因在膀胱癌中高表达,与临床不良预后密切相关,DHCR7基因可能通过多种机制参与肿瘤发展过程,有望成为膀胱癌干预治疗、预后评估新的靶点。