羊布鲁氏菌16M基因组分泌蛋白的生物信息学分析

对羊布鲁氏菌全基因组16M中全部3 197个氨基酸序列进行生物信息学分析。利用SignalP和TatP软件分析N-端信号肽,结果显示具有N-端信号肽的序列有288个;继而用TMHMM和Phobius软件对这288个序列进行跨膜区预测,得到不含跨膜区的蛋白208个;最后利用LipoP对这208个蛋白进行分类,得到具有信号肽的蛋白191个。使用SecretomeP软件对被预测为无信号肽的蛋白质进行分析,结果显示有391个可能通过非经典途径分泌。由于分泌蛋白在细菌的致病过程中起着重要作用,而布鲁氏菌基因组编码的大多数蛋白的功能尚未确定,因此分析和预测布鲁氏菌的分泌蛋白可为更完整地、系统地研究布鲁氏菌的分子致病机理提供非常重要的信息。