基于ZmDEP1基因的玉米籽粒性状关联分析

以水稻籽粒产量相关的OsDEP1为候选基因,利用生物信息学分析方法获得了其在玉米中同源基因ZmDEP1的全长并进行了基因结构划分和验证,将该基因与玉米粒重相关基因QTL-q300k20和QTL-qgrwt6共定位。将ZmDEP1基因的3′端在一个由121份优良玉米自交系组成的关联群体中进行测序及多态性位点测定,结合北京和海南两个环境下的籽粒性状表型数据进行关联分析。发现该基因3′UTR的一个单核苷酸多态性位点(SNP)S182,两种环境下都与粒重和籽粒体积相关,表明S182可能是一个影响玉米粒重、体积的功能位点。

玉米和类玉米中45S rDNA位点的CPD显带识别

采用CPD(PI和DAPI组合)染色对玉米和类玉米有丝分裂中期染色体进行了显带分析,供试物种所有的45S rDNA位点都能够有效地被CPD染色显示为红色带纹。在栽培玉米、墨西哥玉米、二倍体多年生类玉米中只有一对染色体上具有45S rDNA位点,在多年生类玉米的2对染色体上具有45S rDNA位点。

一种快速提取玉米大群体基因组DNA的方法

快速高效的DNA提取方法是玉米大规模分子育种的第一步,因此,需要发展一种快速提取玉米基因组DNA的方法,以满足我国中小型实验室的需要。本研究介绍了一种可用于玉米大规模基因组DNA提取的方法:先利用改良碱煮法提取玉米籽粒小块胚乳的DNA,进行基因型鉴定,对大群体进行筛选,再利用电钻磨样及简化的CTAB法快速提取玉米苗期叶片的DNA,进行后期的研究。这种方法使得玉米大群体的筛选和研究简单化、快速化、常规化,可广泛应用于玉米分子育种。

植物数量性状关联分析研究进展

关联分析是新近开始在植物数量性状研究和植物育种中应用的一种分析方法。它以连锁不平衡为基础鉴定某一群体内性状与遗传标记或候选基因间的关系。本文在介绍连锁不平衡的定义和度量方法的基础上,综述了连锁不平衡和关联分析在植物方面的研究进展,并讨论了交配体系、重组、遗传漂变等对连锁不平衡程度的影响,以及连锁不平衡程度和群体结构对关联分析的影响,最后讨论了关联分析在植物数量性状和分子育种研究中可能的应用。

玉米CACTA型转座子携带宿主基因片段转移新功能的发现与特性分析

携带宿主基因片段转座子的转座对基因组扩增、新基因产生具有重要作用.本研究以参与玉米维生素E合成的基因HGGT为例,采用生物信息学方法,寻找携带宿主基因片段转座子,并分析其特性.通过BLAST搜索和基因注释,发现了3个携带HGGT基因不同部位片段的ENSPM2_ZM转座子.利用公共数据库,在玉米自交系B73基因组中发现了另外66个能携带宿主基因片段的转座子.这69个转座子分布在10条染色体上,平均长度为3689bp.其中,有9个转座子携带了2个来源的宿主基因片段.通过比对玉米EST数据库,发现至少13个转座子可以转录,且2个携带不同来源宿主基因片段的转座子具有融合转录的特征.