四川省部分豆科植物根瘤菌的遗传多样性

从四川省豆科植物鸡眼草属、合欢属、豇豆属、葛属、金合欢、杭子梢分离获得了103株根瘤菌,采用AFLP、BOXAIR-PCR研究了这些菌株的遗传多样性.结果表明,分离自四川省豆科植物6个属的根瘤菌存在明显的遗传多样性,AFLP分析中,全部供试菌株的相似性为21%,全部供试菌株可分为26个AFLP遗传群;BOXAIR-PCR聚类分析结果表明,103个菌株分在70%相似性水平处,供试菌株被分为18个BOX遗传群.除部分菌株外,多数根瘤菌按宿主类型聚群,同一宿主而地理来源不同的根瘤菌分布于不同的遗传群,表明宿主和地理环境对根瘤菌具有深刻影响.

3株紫花苜蓿根瘤菌sinR基因的克隆、序列测定及系统发育分析

为从与紫花苜蓿共生的3株不同根瘤菌（CCBAU 30085、USDA 1002和CCBAU QH180）中扩增参与根瘤菌群体感应调控的转录激活蛋白基因（sinR基因）并比较它们的不同，根据文献[1]，设计了一对引物，通过PCR扩增，将扩增产物克隆到pGEM-T-easy载体上，转化大肠杆菌DH5α，经蓝白斑和氨苄青霉素筛选得到阳性转化子，用通用引物测序后将序列与已报道的sinR基因（GenBank登录号为AL591788）进行了同源性比较和系统发育分析，本试验成功克隆到了sinR基因，经同源性及系统发育分析后，结果表明，CCBAU30085、USDA1002和CCBAUQH180这3株菌的sinR基因序列相似性高达99％；它们与已知的Sinorhizobium meliloti 1021中的sinR基因序列相似性到达99．7％-100％，与具有相同功能的豌豆根瘤菌及埃氏菜豆根瘤菌中的raiR基因之间的相似性低于45％，这说明与紫花苜蓿共生的根瘤菌虽然经历了长期的进化，但其sinR基因在长期的进化过程中，却是一个非常保守的基因。