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基于mRNA-Seq的沙漠植物花花柴干旱胁迫表达谱分析
被引量:
2
1
作者
王彦芹
沈李丽
+2 位作者
罗来鑫
李健强
李志军
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第5期879-885,共7页
以抗逆性较强的荒漠植物花花柴为材料,利用数字基因表达谱技术对用质量百分数20%的PEG溶液处理0、4、8、12和24 h后的花花柴幼苗的m RNA-Seq测序结果进行分析。结果表明,花花柴幼苗叶部在不同处理时间均上调表达的基因有122个,下调表达...
以抗逆性较强的荒漠植物花花柴为材料,利用数字基因表达谱技术对用质量百分数20%的PEG溶液处理0、4、8、12和24 h后的花花柴幼苗的m RNA-Seq测序结果进行分析。结果表明,花花柴幼苗叶部在不同处理时间均上调表达的基因有122个,下调表达的基因54个,根部在不同处理时间均上调表达的基因73个,下调表达的基因79个。利用q RT-PCR和RT-PCR对可能与花花柴耐旱相关的6个差异表达基因进行了验证,发现其表达模式与表达谱结果一致,推测这些基因可能均与花花柴响应干旱胁迫相关。本研究为耐旱相关基因的发掘及应用提供了基础。
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关键词
沙漠植物
花花柴
干旱胁迫
MRNA-SEQ
耐旱相关基因
原文传递
题名
基于mRNA-Seq的沙漠植物花花柴干旱胁迫表达谱分析
被引量:
2
1
作者
王彦芹
沈李丽
罗来鑫
李健强
李志军
机构
新疆生产建设兵团塔里木盆地生物资源保护利用重点
实验室
塔里木
大学
生命科学学院
中国农业大学种子病理实验室
出处
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第5期879-885,共7页
基金
新疆生产建设兵团科技计划项目(2012BB045)
国家自然科学基金(31460071和31660085)~~
文摘
以抗逆性较强的荒漠植物花花柴为材料,利用数字基因表达谱技术对用质量百分数20%的PEG溶液处理0、4、8、12和24 h后的花花柴幼苗的m RNA-Seq测序结果进行分析。结果表明,花花柴幼苗叶部在不同处理时间均上调表达的基因有122个,下调表达的基因54个,根部在不同处理时间均上调表达的基因73个,下调表达的基因79个。利用q RT-PCR和RT-PCR对可能与花花柴耐旱相关的6个差异表达基因进行了验证,发现其表达模式与表达谱结果一致,推测这些基因可能均与花花柴响应干旱胁迫相关。本研究为耐旱相关基因的发掘及应用提供了基础。
关键词
沙漠植物
花花柴
干旱胁迫
MRNA-SEQ
耐旱相关基因
Keywords
desert plant
Karelinia caspica
drought stress
mRNA-Seq
drought-related genes
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于mRNA-Seq的沙漠植物花花柴干旱胁迫表达谱分析
王彦芹
沈李丽
罗来鑫
李健强
李志军
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
2
原文传递
已选择
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参考文献
引证文献
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