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利用EST-SSR标记分析绿豆农家种及育成品种的遗传多样性
1
作者
王月影
范保杰
+9 位作者
曹志敏
王彦
苏秋竹
张志肖
王珅
时会影
沈颖超
程须珍
刘长友
田静
《作物杂志》
北大核心
2024年第1期73-79,共7页
利用覆盖绿豆11条染色体的16个EST-SSR标记,对来自我国15个不同省市的156份绿豆农家种和53份育成品种进行遗传多样性分析。结果表明,16个标记总共检测出57个等位变异位点,平均等位变异数3.56,有效等位变异数(Ne)1.89,Shannon信息指数(PI...
利用覆盖绿豆11条染色体的16个EST-SSR标记,对来自我国15个不同省市的156份绿豆农家种和53份育成品种进行遗传多样性分析。结果表明,16个标记总共检测出57个等位变异位点,平均等位变异数3.56,有效等位变异数(Ne)1.89,Shannon信息指数(PIC)0.70。与育成品种相比,绿豆农家种的观测等位变异数、Ne、期望杂合度和PIC较高,表明农家种的遗传多样性高于育成品种。Structure分析可以将所有材料分为3个组群,组群内资源有按地理来源聚集的趋势,3个组群内种质间的平均遗传距离相差不大。利用UPGMA法进行聚类分析,可将所有参试绿豆材料分为A、B、C三大类群,类群A集中了大部分育成品种,类群B和C则以农家种为主。12个不同地理来源资源群体的遗传一致度介于0.4706~0.9627。
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关键词
绿豆
EST-SSR标记
种质资源
遗传多样性
原文传递
MoRAD26参与稻瘟病菌的胁迫应答和致病过程
2
作者
王聪聪
孟帅
+4 位作者
解军辉
丁新华
邱结华
寇艳君
时焕斌
《植物病理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期748-756,共9页
稻瘟病菌引起的稻瘟病是水稻三大病害之一。DNA修复对维持基因组的完整性具有重要作用,为了解析DNA修复基因在稻瘟病菌致病过程中的功能,本试验对稻瘟病菌DNA损伤检控点蛋白MoRad26进行了功能分析。首先我们利用同源重组的方法获得了MoR...
稻瘟病菌引起的稻瘟病是水稻三大病害之一。DNA修复对维持基因组的完整性具有重要作用,为了解析DNA修复基因在稻瘟病菌致病过程中的功能,本试验对稻瘟病菌DNA损伤检控点蛋白MoRad26进行了功能分析。首先我们利用同源重组的方法获得了MoRAD26基因的稻瘟病菌敲除突变体。表型观察发现MoRAD26缺失突变体的致病力下降,对DNA损伤胁迫和H_(2)O_(2)胁迫更加敏感,但是对稻瘟病菌的生长、产孢以及分生孢子萌发和附着胞的形成没有明显影响。进一步分析表明,敲除MoRAD26基因降低了稻瘟病菌侵染菌丝的扩展能力进而影响稻瘟病菌的致病力,但其具体机制还有待深入研究。
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关键词
稻瘟病菌
致病
DNA损伤修复
MoRAD26
原文传递
南方稻区稻瘟病菌株中无毒基因AvrPi9的变异分析
3
作者
沈浙南
时焕斌
邱结华
《植物病理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第4期565-572,共8页
本研究通过PCR(Polymerase Chain Reaction)和测序技术以及稻瘟病菌致病力检测手段,分析了2020年来自安徽、重庆、福建、广西、湖南、江苏、江西、云南以及浙江等省(直辖市、自治区)的300个稻瘟病分离菌株的无毒基因AvrPi9的分布和变异...
本研究通过PCR(Polymerase Chain Reaction)和测序技术以及稻瘟病菌致病力检测手段,分析了2020年来自安徽、重庆、福建、广西、湖南、江苏、江西、云南以及浙江等省(直辖市、自治区)的300个稻瘟病分离菌株的无毒基因AvrPi9的分布和变异情况。结果表明,298份稻瘟病菌分离菌株的AvrPi9位点能被有效扩增,扩增产物经测序分析后显示,其中8株供试菌株的AvrPi9基因位点的外显子区域253位发生单碱基变异(C碱基替换成T碱基,AvrPi9^(C253T)),导致转录提前终止。稻瘟病菌致病力分析表明,AvrPi9^(C253T)菌株对带有Pi9基因的植株TP309-Pi9产生了致病性,说明该类菌株的AvrPi9位点变异后不能被Pi9识别。上述结果提示培育和种植携带有抗稻瘟病基因Pi9的品种可以较大程度上对南方稻区稻瘟病起到防控作用。这对保障水稻生产安全具有重要意义。
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关键词
稻瘟病
无毒基因
AvrPi9
毒力变异
原文传递
题名
利用EST-SSR标记分析绿豆农家种及育成品种的遗传多样性
1
作者
王月影
范保杰
曹志敏
王彦
苏秋竹
张志肖
王珅
时会影
沈颖超
程须珍
刘长友
田静
机构
河北省农林
科学院
粮油作物
研究所
/河北省作物遗传育种
实验室
中国农业科学院中国水稻研究所/水稻生物学国家重点实验室
中国农业科学院
作物
科学
研究所
出处
《作物杂志》
北大核心
2024年第1期73-79,共7页
基金
国家重点研发计划(2019YFD1000700,2019YFD1000702)
国家现代农业产业技术体系(CARS-08-G03)
+3 种基金
河北省青年拔尖人才(2018)
河北省重点研发计划(19226353D)
河北省现代农业产业技术体系(HBCT2018070203)
河北省农林科学院创新工程项目(2022KJCXZX-LYS-17)。
文摘
利用覆盖绿豆11条染色体的16个EST-SSR标记,对来自我国15个不同省市的156份绿豆农家种和53份育成品种进行遗传多样性分析。结果表明,16个标记总共检测出57个等位变异位点,平均等位变异数3.56,有效等位变异数(Ne)1.89,Shannon信息指数(PIC)0.70。与育成品种相比,绿豆农家种的观测等位变异数、Ne、期望杂合度和PIC较高,表明农家种的遗传多样性高于育成品种。Structure分析可以将所有材料分为3个组群,组群内资源有按地理来源聚集的趋势,3个组群内种质间的平均遗传距离相差不大。利用UPGMA法进行聚类分析,可将所有参试绿豆材料分为A、B、C三大类群,类群A集中了大部分育成品种,类群B和C则以农家种为主。12个不同地理来源资源群体的遗传一致度介于0.4706~0.9627。
关键词
绿豆
EST-SSR标记
种质资源
遗传多样性
Keywords
Mung bean
EST-SSR marker
Germplasm resources
Genetic diversity
分类号
S522 [农业科学—作物学]
原文传递
题名
MoRAD26参与稻瘟病菌的胁迫应答和致病过程
2
作者
王聪聪
孟帅
解军辉
丁新华
邱结华
寇艳君
时焕斌
机构
中国农业科学院中国水稻研究所/水稻生物学国家重点实验室
三峡大学
生物
技术
研究
中心
山东
农业
大学植物保护
学院
出处
《植物病理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期748-756,共9页
基金
浙江省自然科学基金(LQ19C130007)
中国水稻研究所中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(2017RG002-8)。
文摘
稻瘟病菌引起的稻瘟病是水稻三大病害之一。DNA修复对维持基因组的完整性具有重要作用,为了解析DNA修复基因在稻瘟病菌致病过程中的功能,本试验对稻瘟病菌DNA损伤检控点蛋白MoRad26进行了功能分析。首先我们利用同源重组的方法获得了MoRAD26基因的稻瘟病菌敲除突变体。表型观察发现MoRAD26缺失突变体的致病力下降,对DNA损伤胁迫和H_(2)O_(2)胁迫更加敏感,但是对稻瘟病菌的生长、产孢以及分生孢子萌发和附着胞的形成没有明显影响。进一步分析表明,敲除MoRAD26基因降低了稻瘟病菌侵染菌丝的扩展能力进而影响稻瘟病菌的致病力,但其具体机制还有待深入研究。
关键词
稻瘟病菌
致病
DNA损伤修复
MoRAD26
Keywords
Magnaporthe oryzae
virulence
DNA repair
MoRAD26
分类号
S432.1 [农业科学—植物病理学]
原文传递
题名
南方稻区稻瘟病菌株中无毒基因AvrPi9的变异分析
3
作者
沈浙南
时焕斌
邱结华
机构
中国农业科学院中国水稻研究所/水稻生物学国家重点实验室
出处
《植物病理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第4期565-572,共8页
基金
国家自然科学基金资助项目(32000103)
中国水稻研究所重点项目(CNRRI-2020-04)
浙江省青年基金(LQ19C130007)。
文摘
本研究通过PCR(Polymerase Chain Reaction)和测序技术以及稻瘟病菌致病力检测手段,分析了2020年来自安徽、重庆、福建、广西、湖南、江苏、江西、云南以及浙江等省(直辖市、自治区)的300个稻瘟病分离菌株的无毒基因AvrPi9的分布和变异情况。结果表明,298份稻瘟病菌分离菌株的AvrPi9位点能被有效扩增,扩增产物经测序分析后显示,其中8株供试菌株的AvrPi9基因位点的外显子区域253位发生单碱基变异(C碱基替换成T碱基,AvrPi9^(C253T)),导致转录提前终止。稻瘟病菌致病力分析表明,AvrPi9^(C253T)菌株对带有Pi9基因的植株TP309-Pi9产生了致病性,说明该类菌株的AvrPi9位点变异后不能被Pi9识别。上述结果提示培育和种植携带有抗稻瘟病基因Pi9的品种可以较大程度上对南方稻区稻瘟病起到防控作用。这对保障水稻生产安全具有重要意义。
关键词
稻瘟病
无毒基因
AvrPi9
毒力变异
Keywords
rice blast
avirulent gene
AvrPi9
virulence variation
分类号
S435.111.41 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用EST-SSR标记分析绿豆农家种及育成品种的遗传多样性
王月影
范保杰
曹志敏
王彦
苏秋竹
张志肖
王珅
时会影
沈颖超
程须珍
刘长友
田静
《作物杂志》
北大核心
2024
0
原文传递
2
MoRAD26参与稻瘟病菌的胁迫应答和致病过程
王聪聪
孟帅
解军辉
丁新华
邱结华
寇艳君
时焕斌
《植物病理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
0
原文传递
3
南方稻区稻瘟病菌株中无毒基因AvrPi9的变异分析
沈浙南
时焕斌
邱结华
《植物病理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
0
原文传递
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