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油菜脂肪酸延长酶基因fae1片段的克隆与SNP分析
被引量:
12
1
作者
肖玲
卢长明
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第5期891-896,共6页
脂肪酸延长酶基因fae1是调控油菜芥酸合成的关键基因。本研究利用GenBank中的fae1基因序列AF490462为模板设计引物,通过多聚酶链式反应(PCR)从白菜、甘蓝和甘蓝型油菜(包括2个人工合成种)的12个不同品种中扩增出长1007bp的fae1基因片段...
脂肪酸延长酶基因fae1是调控油菜芥酸合成的关键基因。本研究利用GenBank中的fae1基因序列AF490462为模板设计引物,通过多聚酶链式反应(PCR)从白菜、甘蓝和甘蓝型油菜(包括2个人工合成种)的12个不同品种中扩增出长1007bp的fae1基因片段。PCR产物经与克隆载体pGEM-Tvector连接和序列测定,获得12个品种的fae1基因片段的DNA序列。对来自12个不同品种的fae1基因序列进行比较分析表明:fae1基因具有高度序列保守性,扩增长度均为1007bp,核苷酸序列相似度达98%以上,氨基酸序列的保守性更高。在1007bp的区间内共发现23个SNP(singlenucleotidepolymorphism)位点,其中有11个单核苷酸变异导致了编码氨基酸的改变。人工甘蓝型油菜和天然甘蓝型油菜的fae1基因片段未发现明显差异。发现了高芥酸品种与低芥酸品种的fae1基因、以及A基因组与C基因组的fae1基因特有SNP位点。
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关键词
油菜
脂肪酸延长酶基因
fae1片段
基因克隆
SNP
芥酸
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职称材料
题名
油菜脂肪酸延长酶基因fae1片段的克隆与SNP分析
被引量:
12
1
作者
肖玲
卢长明
机构
中国农业科学院油料作物研究所/农业部遗传改良重点开放实验室
出处
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第5期891-896,共6页
基金
国家自然科学基金项目(30370891和30471009)
科技部转基因专项(JY04-B-01)
中国农业科学院杰出人才基金项目资助
文摘
脂肪酸延长酶基因fae1是调控油菜芥酸合成的关键基因。本研究利用GenBank中的fae1基因序列AF490462为模板设计引物,通过多聚酶链式反应(PCR)从白菜、甘蓝和甘蓝型油菜(包括2个人工合成种)的12个不同品种中扩增出长1007bp的fae1基因片段。PCR产物经与克隆载体pGEM-Tvector连接和序列测定,获得12个品种的fae1基因片段的DNA序列。对来自12个不同品种的fae1基因序列进行比较分析表明:fae1基因具有高度序列保守性,扩增长度均为1007bp,核苷酸序列相似度达98%以上,氨基酸序列的保守性更高。在1007bp的区间内共发现23个SNP(singlenucleotidepolymorphism)位点,其中有11个单核苷酸变异导致了编码氨基酸的改变。人工甘蓝型油菜和天然甘蓝型油菜的fae1基因片段未发现明显差异。发现了高芥酸品种与低芥酸品种的fae1基因、以及A基因组与C基因组的fae1基因特有SNP位点。
关键词
油菜
脂肪酸延长酶基因
fae1片段
基因克隆
SNP
芥酸
Keywords
Brassica
fae1
PCR
Gene cloning
Sequence analysis
Erucic acid
分类号
S565.4 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
油菜脂肪酸延长酶基因fae1片段的克隆与SNP分析
肖玲
卢长明
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2005
12
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