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栽培种花生EST-SSR引物的开发及应用
被引量:
6
1
作者
肖洋
廖伯寿
+4 位作者
晏立英
黄家权
任小平
雷永
姜慧芳
《湖北农业科学》
北大核心
2010年第11期2625-2628,共4页
从高油抗青枯病花生新品系"06-4104"构建的5个cDNA文库获得了63207条EST,经序列拼接,获得14547条Uni-EST。经MISA检索,在这些Uni-EST中共检测出2643个SSR位点,分布于2250条EST中,发生频率为15.5%,平均每3.1kbEST序列含有一个...
从高油抗青枯病花生新品系"06-4104"构建的5个cDNA文库获得了63207条EST,经序列拼接,获得14547条Uni-EST。经MISA检索,在这些Uni-EST中共检测出2643个SSR位点,分布于2250条EST中,发生频率为15.5%,平均每3.1kbEST序列含有一个SSR位点。其中,三核苷酸重复类型出现频率最高,占SSR总数的49.1%,其次是二核苷酸重复类型,占SSR总数的45.8%。在发现的46类重复基序中,AG/TC重复基序的频率最高,AAG/TTC次之。利用Primer3从含有SSR的2250条EST中共设计引物100对,利用这些引物检测花生栽培品种的多态性。结果表明,在所设计的100对引物中有91对在供试的6个花生栽培品种中得到有效扩增,其中13对得到了多态性的扩增产物,每对引物检测出的等位基因数2~3个,平均2.2个。
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关键词
花生
EST-SSR
标记开发
下载PDF
职称材料
宜城市花生枯萎病病原的鉴定
2
作者
晏立英
温少华
+4 位作者
雷永
黄家权
蒋相国
王圣玉
廖伯寿
《湖北农业科学》
北大核心
2011年第17期3532-3534,3539,共4页
对湖北宜城花生枯萎病的病原进行了生物学和分子鉴定,结果显示,6月份的病原主要是真菌,41份样品中,分离的真菌样品有38份,其中23份样品是黑曲霉菌。通过PSA培养基上真菌形态观察、真菌核糖体间区ITS区段的PCR扩增和序列分析,明确6月份...
对湖北宜城花生枯萎病的病原进行了生物学和分子鉴定,结果显示,6月份的病原主要是真菌,41份样品中,分离的真菌样品有38份,其中23份样品是黑曲霉菌。通过PSA培养基上真菌形态观察、真菌核糖体间区ITS区段的PCR扩增和序列分析,明确6月份花生枯萎病的病原分别是黑曲霉菌、立枯丝核菌和镰刀菌;8月份的病原主要为细菌,10份样品中,9份分离得到茄科雷尔氏菌(青枯病菌),通过细菌的回接试验,部分植株产生典型青枯、萎蔫症状,明确8月份的病原是青枯病菌。
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关键词
花生
枯萎病
病原
鉴定
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职称材料
题名
栽培种花生EST-SSR引物的开发及应用
被引量:
6
1
作者
肖洋
廖伯寿
晏立英
黄家权
任小平
雷永
姜慧芳
机构
中国农业科学院油料作物研究所/油料作物生物学重点开放实验室
出处
《湖北农业科学》
北大核心
2010年第11期2625-2628,共4页
基金
国家"863"计划项目(2006AA10A115
2007AA100106)
国家自然科学基金项目(30871626)
文摘
从高油抗青枯病花生新品系"06-4104"构建的5个cDNA文库获得了63207条EST,经序列拼接,获得14547条Uni-EST。经MISA检索,在这些Uni-EST中共检测出2643个SSR位点,分布于2250条EST中,发生频率为15.5%,平均每3.1kbEST序列含有一个SSR位点。其中,三核苷酸重复类型出现频率最高,占SSR总数的49.1%,其次是二核苷酸重复类型,占SSR总数的45.8%。在发现的46类重复基序中,AG/TC重复基序的频率最高,AAG/TTC次之。利用Primer3从含有SSR的2250条EST中共设计引物100对,利用这些引物检测花生栽培品种的多态性。结果表明,在所设计的100对引物中有91对在供试的6个花生栽培品种中得到有效扩增,其中13对得到了多态性的扩增产物,每对引物检测出的等位基因数2~3个,平均2.2个。
关键词
花生
EST-SSR
标记开发
Keywords
peanut
EST-SSR
marker development
分类号
S565.2 [农业科学—作物学]
Q789 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
宜城市花生枯萎病病原的鉴定
2
作者
晏立英
温少华
雷永
黄家权
蒋相国
王圣玉
廖伯寿
机构
中国农业科学院油料作物研究所/油料作物生物学重点开放实验室
湖北省襄阳市
农业
科学院
出处
《湖北农业科学》
北大核心
2011年第17期3532-3534,3539,共4页
基金
国家花生产业技术体系专项(nycytx-19)
公益性行业(农业)科研专项经费项目(200903004)
文摘
对湖北宜城花生枯萎病的病原进行了生物学和分子鉴定,结果显示,6月份的病原主要是真菌,41份样品中,分离的真菌样品有38份,其中23份样品是黑曲霉菌。通过PSA培养基上真菌形态观察、真菌核糖体间区ITS区段的PCR扩增和序列分析,明确6月份花生枯萎病的病原分别是黑曲霉菌、立枯丝核菌和镰刀菌;8月份的病原主要为细菌,10份样品中,9份分离得到茄科雷尔氏菌(青枯病菌),通过细菌的回接试验,部分植株产生典型青枯、萎蔫症状,明确8月份的病原是青枯病菌。
关键词
花生
枯萎病
病原
鉴定
Keywords
peanut
wilt disease
pathogen
identification
分类号
S435.652 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
栽培种花生EST-SSR引物的开发及应用
肖洋
廖伯寿
晏立英
黄家权
任小平
雷永
姜慧芳
《湖北农业科学》
北大核心
2010
6
下载PDF
职称材料
2
宜城市花生枯萎病病原的鉴定
晏立英
温少华
雷永
黄家权
蒋相国
王圣玉
廖伯寿
《湖北农业科学》
北大核心
2011
0
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职称材料
已选择
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