云南省汉族人群LMP基因多态性与结核病易感性的关联性研究

目的:研究云南省汉族人群LMP2、LMP7基因单核苷酸多态性(SNP)与结核病(TB)的相关性。方法:选取449例云南省汉族TB患者(其中肺TB 324例、肺外TB 125例)作为病例组,367例健康人群作为对照组;采用SNaPshot分型法对LMP 2基因的3个SNP位点rs1351383(T>G)、rs17587(C>T)、rs2127675(A>G)和LMP 7基因的rs2071543(G>T)位点进行基因分型,比较这4个SNP位点等位基因和基因型在病例组和对照组中的频率,结合遗传模式分析和单倍型分析,研究LMP 2和LMP 7基因SNP多态性与TB的相关性。结果:经Bonferroni校正后,4个SNP位点的等位基因及基因型频率在病例组和对照组中差异均无统计学意义(P>0.0125);但在分层研究中,rs1351383位点的C等位基因在肺外TB患者中的频率显著高于对照组(P=0.010,OR=1.377,95%CI为1.030~1.841),加性遗传模式分析显示该位点基因型在病例组和对照组间频率的差异具有统计学意义(P=0.008,OR=1.520,95%CI为1.120~2.080);rs1351383-rs17587-rs2127675-rs2071543单倍型C-G-G-G在肺外TB患者中的频率显著高于对照组(P=0.003,OR=1.982,95%CI为1.246~3.154)。结论:云南省汉族人群中LMP基因的多态位点rs1351383的C等位基因及其rs1351383-rs17587-rs2127675-rs2071543单倍型C-G-G-G可能增加肺外TB的患病风险。

云南汉族人群CD80基因多态性与宫颈癌发生发展的相关性研究

目的探讨CD80基因多态性与云南汉族人群宫颈癌发生发展的相关性。方法本研究选取云南地区汉族人群癌前病变(CINⅢ期)患者126例,宫颈癌患者450例,健康体检人群500例,采用TaqMan探针基因分型方法对CD80基因中的4个SNP位点rs16829980(A>G)、rs16829984(G>C)、rs41271391(G>T)和rs41271393(C>T)进行基因分型,并研究其等位基因、基因型及所构建的单倍型在CINⅢ期患者、宫颈癌患者和健康对照人群中分布频率的差异。结果 rs16829984(G>C)等位基因C和G在CINⅢ期组和对照组、癌症组和对照组中分布频率的差异具有统计学意义(P=0.026和0.006)。rs16829980(A>G)中等位基因A和G在CINⅢ期组和癌症组中分布频率的差异具有统计学意义(P=0.038)。而rs41271391(G>T)和rs41271393(C>T)的等位基因和基因型在病例组(CINⅢ期组和癌症组)和对照组中的分布频率的差异无统计学意义(P>0.05)。单倍型分析结果显示AGGC单倍型可能是宫颈癌发生的危险因素(OR=1.449;95%CI:1.096-1.915)。结论位于CD80基因启动子区域的SNP位点rs16829984(G>C)等位基因C可能是云南汉族人群宫颈癌发生的保护性因素(OR=0.700;95%CI:0.510-0.960),rs16829980(A>G)等位基因A可能是云南汉族人群CINⅢ期向宫颈癌发展的保护性因素(OR=0.703;95%CI:0.503-0.982)。

云南汉族人群IL-10基因启动子多态性与HCV慢性感染的相关性研究

目的探讨IL-10基因启动子SNP-1082G/A(rs1800896)、-819C/T(rs1800871)、-592C/A(rs1800872)位点与HCV慢性感染的相关性.方法入选云南地区汉族人群HCV慢性感染患者379例,健康对照364例.采用Taq Man探针基因分型方法对IL-10基因启动子SNP-1082G/A(rs1800896)、-819C/T(rs1800871)、-592C/A(rs1800872)的3个位点进行基因分型,并构建单倍型,评估上述3个SNPs及单倍型与HCV慢性感染的相关性.结果在病例组和对照组中,IL-10基因启动子SNP-1082G/A(rs1800896)、-819C/T(rs1800871)、-592C/A(rs1800872)基因型频率和等位基因频率差异没有统计学意义(P>0.05).单倍型分析结果显示,SNP-1082G/A(rs1800896)、-819C/T(rs1800871)和-592C/A(rs1800872)构建的单倍型频率的差异无统计学意义(P>0.05).结论在云南汉族群体中,IL-10基因启动子SNP-1082G/A(rs1800896)、-819C/T(rs1800871)、-592C/A(rs1800872)与HCV慢性感染没有相关性.

云南汉族人群HSPA1A基因多态性位点与肺癌的相关性研究

目的：探讨HSPA1A基因多态性与肺癌发生发展的相关性。方法：选取云南地区汉族人群肺癌患者288例为病例组,健康体检人群298例为对照组,采用Taq Man探针基因分型方法对HSPA1A基因中的4个多态性位点（SNPs）位点rs12190359（C〉T）、rs562047（C〉G）、rs1008438（G〉T）及rs1043618（G〉C）进行基因分型,研究其等位基因、基因型及所构建的单倍型在两组人群中分布差异。结果：2组人群rs1043618（G〉C）等位基因C和G的分布频率差异有统计学意义（P=0.038）,其中等位基因C是肺癌发生的保护性因素[OR=0.767;95%CI（0.597～0.986）];rs12190359（C〉T）、rs562047（C〉G）和rs1008438（G〉T）的等位基因和基因型的分布差异无统计学意义（P〉0.05）;rs12190359与rs1008438（G〉T）以及rs562047（C〉G）与rs11043618（G〉C）的单倍型在2组间分布频率差异无统计学意义（P〉0.05）。结论：HSPA1A基因rs1043618（G〉C）等位基因C可能是云南汉族肺癌发生的保护性因素。

云南汉族人群NKG2D基因多态性与宫颈癌发生发展的相关性

目的:探讨云南汉族人群NKG2D(member D)基因中的单核苷酸多态性(SNP)位点rs2255336(T>C)及rs2617160(A>T)的多态性与宫颈癌的相关性。方法:选取云南地区汉族宫颈上皮内瘤变(CIN)患者136例作为CIN组、227例宫颈癌患者作为癌症组及483例健康体检人群作为对照组,采用Taqman基因分型法对3组受检者NKG2D基因中2个SNP位点rs2255336(T>C)、rs2617160(A>T)进行基因分型,研究rs2255336(T>C)、rs2617160(A>T)位点的等位基因、基因型及所构建的单倍型在各组中分布频率,用遗传模式分析软件SNPStats分析2个SNP位点的基因型与宫颈癌的相关性。结果:对照组与CIN组NKG2D基因中rs2617160(A>T)等位基因C和T分布频率比较,差异有统计学意义(P=0.049),该位点等位基因A可能是云南汉族人群CIN发生的风险因素(OR=1.31,95%CI为1.00~1.72),而该位点在对照组与癌症组、CIN组与癌症组中的分布频率比较差异无统计学意义(P>0.05);recessive模式为CIN组与对照组分析的最优遗传模式,该模式下TT-AT基因型相对于AA基因型是CIN发生的保护性因素(OR=0.58,95%CI为0.37~0.92);rs2255336(T>C)位点等位基因和基因型在对照组、CIN组、癌症组间的分布频率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论:NKG2D基因中多态性位点rs2617160(A>T)的等位基因A可能是云南汉族人群宫颈癌发生的风险因素。

云南汉族人群CD80基因多态性位点与肺癌的相关性

目的：探讨云南汉族人群中CD80基因中的多态性位点（SNPs）rs16829980（A〉G）、rs16829984（G〉C）、rs41271391（G〉T）及rs41271393（C〉T）与肺癌的相关性。方法：选取云南地区汉族人群肺癌患者288例（病例组）,健康体检人群288例（对照组）,采用Taq Man探针基因分型方法对CD80基因中上述4个SNPs位点进行基因分型,研究其等位基因、基因型及所构建的单倍型在两组人群中的分布差异。结果：rs16829980（A〉G）等位基因A和G、rs41271391（G〉T）等位基因G和T、rs41271393（C〉T）等位基因C和T在病例组和对照组中的分布频率的差异具有统计学意义（P=0.018,0.015,0.015）,单倍型分析结果显示GGTT单倍型是云南汉族人群肺癌发生的保护性因素（OR=0.723;95%CI：0.555~0.941）。结论：CD80基因SNPs位点rs16829980（A〉G）中等位基因A、rs41271391（G〉T）中等位基因G以及rs41271393（C〉T）的等位基因C可能是云南汉族人群肺癌发生的危险因素,GGTT单倍型可能是云南汉族人群肺癌发生的保护性因素。

LMP7、TAP2基因多态性与云南汉族非小细胞肺癌的相关性

目的:探讨低相对分子量蛋白酶体7基因(LMP 7)及抗原处理相关转运体2基因(TAP 2)中的单核苷酸多态性(SNP)与云南汉族人群非小细胞肺癌的相关性。方法:选取云南汉族非小细胞肺癌患者467例作为病例组、同期健康正常人群488例作为对照组,采用Taq Man探针基因分型方法对TAP2基因的SNP位点rs241447及LMP7基因的SNP位点rs2071543进行基因分型,分析rs241447和rs2071543等位基因和基因型在病例组和对照组间的分布差异,分析这两个SNP位点在肺癌不同临床分期的中分布差异。结果:rs241447在对照组和病例组中基因型的分布频率比较,差异有统计学意义(P=0.015);在超显性遗传模式下,rs241447基因型C/C-T/T可能是云南汉族人群非小细胞肺癌的风险因素(OR=1.38,95%CI为1.07~1.78,P=0.014),rs2071543的等位基因和基因型在对照组和病例组中的分布频率比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论:TAP2基因中的SNP位点rs241447可能与云南汉族人群非小细胞肺癌的易感性相关。

云南汉族人群IL-4基因5’和3’非编码区域多态性与HCV慢性感染无相关性

目的探讨IL-4基因5’和3’非编码区域单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphism,SNP)与HCV慢性感染的相关性。方法选取云南地区汉族人群HCV慢性感染患者380例,健康体检人群439例。采用Taq Man探针基因分型方法对IL-4基因5’和3’非编码区域6个SNP位点SNP-1138A/G(rs2243247)、-1098G/T(rs2243248)、-589C/T(rs2243250)、-33C/T(rs2070874)、2979C/A(rs2227284)、3’端C/T(rs2243292)进行基因分型,并构建单倍型,评估上述6个SNP位点及单倍型与HCV慢性感染的相关性。结果 IL-4基因SNP-1138A/G(rs2243247),3’端C/T(rs2243292)在病例组和对照组中无多态性;SNP位点-1098G/T(rs2243248)、-589C/T(rs2243250)、-33C/T(rs2070874)、2979C/A(rs2227284)的基因型频率和等位基因频率在病例组和对照组中差异无统计学意义(P>0.05);单倍型分析结果显示:SNP位点-1098G/T(rs2243248)、-589C/T(rs2243250)、-33C/T(rs2070874)、2979C/A(rs2227284)构建的单倍型频率在病例组和对照组中差异无统计学意义(P>0.05)。结论在云南汉族群体中,IL-4基因5’和3’非编码区域SNP位点-1138A/G(rs2243247)、-1098G/T(rs2243248)、-589C/T(rs2243250)、-33C/T(rs2070874)、2979C/A(rs2227284)、3’端C/T(rs2243292)与HCV慢性感染没有相关性。

云南汉族人群CD6基因多态性与非小细胞肺癌的相关性

目的:探究云南地区汉族人群中细胞表面糖蛋白CD6基因多态性与非小细胞肺癌(NSCLC)的相关性。方法:选取云南汉族NSCLC患者467例作为病例组,选取同期健康正常人群490例作为对照组,采用TaqMan探针基因分型方法对CD6基因的SNP位点(rs12360861、rs11230563及rs17824933)进行基因分型,分析3个SNP位点等位基因和基因型在病例组和对照组间的分布差异,分析3个SNP位点在肺癌不同临床分期的中分布。结果:CD6基因的SNP位点(rs12360861、rs11230563及rs17824933)的等位基因、基因型和构建的单倍型在病例组与对照组中的分布频率比较,差异无统计学意义(P>0.05);CD6基因的3个SNP位点的等位基因、基因型在肺癌Ⅰ+Ⅱ期组和Ⅲ+Ⅳ期组间的分布频率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论:CD6基因的rs12360861、rs11230563及rs17824933多态性位点可能与云南汉族人群NSCLC的发生发展无相关性。

云南汉族人群mircoRNA-149、mircoRNA-219、mircoRNA-let-7基因多态性与非小细胞肺癌发生和发展的相关性

目的探讨mircoRNA基因多态性与云南汉族人群非小细胞肺癌发生发展的相关性。方法选取云南地区汉族人群非小细胞肺癌患者415例,健康对照460例,采用Taqman探针基因分型法对3个SNP位点rs2292832 T>C(pre-miR-149)、rs107822 C>T(pre-miR-219a-1),rs629367 C>A(pri-let-7a-1)进行基因分型并分析其等位基因、基因型在非小细胞肺癌患者(按病理分层为鳞癌、腺癌及其他类型肺癌;按临床分期分层为Ⅰ+Ⅱ期、Ⅲ+Ⅳ期)及健康对照中的频率差异。结果rs2292832、rs107822、rs629367位点的等位基因、基因型频率在非小细胞肺癌组和对照组间的差异没有统计学意义,在分层分析及遗传模式分析中也无显著性差异。结论rs2292832、rs107822、rs629367可能与云南汉族人群非小细胞肺癌无相关性。

云南汉族人群CCR5基因启动子多态性与HCV慢性感染的关系

目的:研究云南汉族人群CCR5基因启动子单核苷酸多态性位点(SNPs)与丙型肝炎病毒(HCV)慢性感染的关系。方法:选取356例云南汉族HCV慢性感染者作为病例组,353例健康体检者作为对照组,采用PCR法扩增受检者CCR5基因启动子区基因序列;然后采用Sanger法对扩增序列进行测序并与Gen Bank(NC_000003.12)序列比较获得与云南省汉族人群具有多态性的SNPs位点,对获得的SNPs位点进行基因分型,计算这些SNPs位点的等位基因频率和基因型频率;构建单倍型并分析遗传模式进行,比较两组间的分布差异。结果:在CCR5基因启动子区域有9个SNPs位点,其中rs2227010(A>G)、rs2734648(T>G)、rs1799987 (G>A)、rs1799988 (T>C)、rs1800023 (G>A)及1800024 (C>T) 6个位点在云南省汉族人群中具有多态性;这6个SNPs位点的基因型频率、等位基因频率及单倍型频率在病例组与对照组比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。结论:CCR5基因启动子中的rs2227010(A>G)、rs2734648(T>G)、rs1799987 (G>A)、rs1799988 (T>C)、rs1800023 (G>A)及1800024 (C>T) SNPs位点与云南汉族人群HCV慢性感染无关。

云南汉族人群TNF-α基因和ALCAM基因多态性与HCV慢性感染的相关性

目的探讨TNF-α基因启动子SNP-C/T(rs1799724)和ALCAM基因3'UTR区SNP-A/G(rs11559013)位点与HCV慢性感染的相关性.方法入选云南地区汉族人群HCV慢性感染患者434例,健康体检人群444例.采用Taq Man探针基因分型方法对TNF-α基因启动子SNP-C/T(rs1799724)和ALCAM基因3'UTR区SNP-A/G(rs11559013)的2个位点进行基因分型,评估上述2个SNPs与HCV慢性感染的相关性.结果在病例组和对照组中,TNF-α基因启动子SNP-C/T(rs1799724)和ALCAM基因3'UTR区SNP-A/G(rs11559013)基因型频率和等位基因频率差异没有统计学意义(P>0.05).结论在云南汉族群体中,TNF-α基因启动子SNP-C/T(rs1799724)和ALCAM基因3'UTR区SNP-A/G(rs11559013)与HCV慢性感染没有相关性.

云南汉族人群HLA-DM基因多态性与HCV慢性感染的相关性分析

目的:研究云南汉族人群中HLA-DM基因多态性与丙型肝炎病毒(HCV)慢性感染的关系。方法:选取云南汉族人群HCV慢性感染者185人(病例组),健康对照180人(对照组),采用Sanger测序法和TA克隆测序法对HLA-DMA,HLA-DMB基因进行基因分型,计算这两个基因在病例组和对照组中的等位基因频率和基因型频率;构建单倍型,比较两组间的分布差异。结果:在病例组和对照组中,共检出4种HLA-DMA等位基因和5种HLA-DMB等位基因,DMA*01∶01-DMB*01∶03单倍型在病例组中的频率显著高于对照组(0.287vs0.197,OR=0.134,95%CI为1.529~2.305,P=0.005),DMA*01∶02-DMB*01∶03单倍型在病例组中的频率显著低于对照组(0.024vs0.056,OR=0.424,95%CI为0.194~0.944,P=0.031)。结论:单倍型DMA*01∶01-DMB*01∶03和DMA*01∶02-DMB*01∶03可能与云南汉族人群HCV慢性感染相关。

云南汉族人群HSPA1A基因多态与宫颈癌发生发展的相关性研究

目的探讨云南汉族人群中HSPA1A基因多态性与宫颈癌发生和发展的相关性。方法选取宫颈癌患者以及444例癌前病变（CINⅢ期）患者130例，健康正常对照548例。用TaqMan探针基因分型方法对HSPAIA基因的4个SNP位点[rs12190359（C〉T）、rs562047（C〉G）、rsl008438（G〉T）和rsl043618（G〉c）]进行基因分型，研究其等位基因、基因型及所构建的单倍型在CINUI期患者、宫颈癌患者和健康对照人群中分布频率的差异。结果rs1008438位点等位基因G和T在CINⅢ期组和对照组、癌症组和对照组（P=0．022和0．030）中的分布频率的差异具有统计学意义，而在CINⅢ期组和癌症组中的分布频率差异无统计学意义（P〉0．05）；rs1008438位点基因型GG、GT和TT仅在CINⅢ期组和对照组中分布频率差异具有统计学意义（P=0．047），而在CINⅢ期组和癌症组之间、癌症组和对照组之间的分布频率差异无统计学意义（P〉0．05）。rs12190359、rs562047和rs1043618位点的等位基因和基因型在病例组和对照组中的分布频率的差异均无统计学意义（P〉0．05）。根据连锁不平衡的分析结果，对rs562047、rs1008438和rs1043618三个位点构建的单倍型进行分析，结果未显示有单倍型在各组间分布频率的差异有统计学意义（P〉0．05）。结论HSPA1A基因rs1008438位点等位基因G可能是云南汉族人群宫颈癌发生的保护性因素（OR=0．797；95％CI：0．674-0．943）。

Ⅲ型登革病毒在THP-1细胞上的ADE模型建立

登革热(dengue fever,DF)是由Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ型登革病毒(dengue virus,DENV)引起的急性传染病,抗体依赖增强感染(antibody-dependent enhancement,ADE)是自限性的登革热以及危及生命的登革出血热(dengue hemorrhagic fever,DHF)或登革休克综合症(dengue shock syndrome,DSS)等重症的主要原因。采用不同稀释度的Ⅱ型登革病毒prM前膜抗体与分离自云南西双版纳重症病人的Ⅲ型登革病毒复合感染THP-1细胞,通过实时荧光定量PCR发现亚中和浓度prM前膜抗体诱发THP-1细胞液中更高浓度的病毒载量。在THP-1细胞系上的研究可为后续研究登革病毒ADE打下坚实的基础。

树鼩白细胞介素6的原核表达、纯化及免疫原性鉴定

目的:克隆树鼩白细胞介素6(IL-6)基因,在大肠杆菌中高效表达、纯化,并鉴定免疫原性。方法:根据GenBank预测的树鼩IL-6基因序列设计引物并扩增基因,克隆至原核表达载体pET-30a(+),构建的重组表达质粒pET-30a(+)-IL-6转化大肠杆菌BL21,IPTG诱导表达;表达的融合蛋白经Ni柱纯化后,Western印迹和ELISA检测其免疫原性,并检测不同组织中IL-6的分布情况。结果:酶切及测序证实重组表达质粒pET-30a(+)-IL-6构建正确;表达的重组蛋白相对分子质量约为29×10~3,纯化后复性的重组蛋白纯度可达95%以上,免疫兔子后Western印迹和ELISA鉴定其具有免疫原性,在气管、心、脾、肾中能检测到IL-6。结论:在大肠杆菌中高效表达了重组树鼩IL-6,纯化复性后具有良好的免疫原性。

两株不同表型的CA16毒株(B基因型)的生物学性状比较分析

CA16病毒作为手足口病主要病原之一,其病原学性状与感染引起的病理过程具有可能的相关意义.对分离自一名重症手足口病(HFMD)患者咽拭子的两株呈现不同蚀斑形态的CA16毒株所做的生物学分析表明,它们在增殖动力学、免疫原性等生物学性状上的差异与其对乳鼠致病能力的差异具有相关性,而这些共同的差异与病毒基因非编码区5′端序列及结构区的VP1区域中的序列之间存在着可能的对应关系,所有这些结果提示了CA16病毒生物学及遗传学性状与其致病能力的相关性.

EV71和CA16研究进展综述

手足口病(hand-foot and mouth disease,HFMD)是一种全球性的传染病,其主要病原体为肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)和柯萨奇病毒A组16型(cosackievirus A 16,CA16)。EV71与CA16同属于小核糖核酸(ribonucleic acid,RNA)病毒科(Picornaviridae)肠道病毒属(Enterovirus)肠道病毒A型(Human enterovirus A)的成员,两者在病原学、感染和复制特征以及感染导致的临床症状和免疫反应有相似的方面,但也有明显不同的方面。现将对EV71和CA16相关的病原学、感染和复制特征以及临床症状和免疫反应研究进行综述。

人诺如病毒最新研究进展

人诺如病毒(Human noroviruses,HuNoVs)是杯状病毒科(Caliciviridae)的一种单股正链RNA病毒,它是导致全球急性非细菌性肠胃炎暴发的主要病原体之一。自1972年美国学者Kapikian利用透射电镜首次观察到首株诺瓦克病毒(Norwalk virus,NV)以来,该病毒在全球范围内多次广泛流行。据报道,全球每年有超过1亿人因感染HuNoVs而发病,其临床症状主要为恶心、呕吐、腹痛和腹泻,多数患者表现为自限性,但也会导致少数婴幼儿、老人和免疫缺陷患者发展成重症,甚至死亡。HuNoVs引起的疫情暴发给全球的公共卫生安全带来了较大的威胁。本文将对HuNoVs的病原学及流行病学、体外培养体系、动物模型、免疫反应和疫苗研发的最新研究进展进行概述。

滤泡辅助性T细胞与病毒感染性疾病研究进展

滤泡辅助性T细胞(follicular helper T cells,Tfh)作为一种新发现的CD4+T细胞亚群,其主要功能是辅助B细胞增殖、分化、产生抗体,参与体液免疫应答。由于Tfh细胞在体液免疫应答中的重要作用,近年来成为研究的热点。现将概述Tfh细胞的发现、分化过程、相关的调控分子,及其在病毒感染性疾病中的研究进展。