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纳米二氧化钛暴露人胚肺细胞差异表达基因分析
被引量:
2
1
作者
孟金萍
刘云波
+4 位作者
张以河
孙淑华
王艳蓉
吕凤柱
杨旭
《生态毒理学报》
CAS
CSCD
2009年第4期475-481,共7页
为探讨纳米二氧化钛(Nano-TiO2)颗粒对人胚肺(HPF)细胞基因表达和基因功能的影响,使用粒径10nmTiO2暴露体外培养的人胚肺细胞24h,提取RNA,应用基因芯片方法,寻找差异表达基因,并对差异基因进行基因本体(GeneOntology,GO)分类.结果表明,...
为探讨纳米二氧化钛(Nano-TiO2)颗粒对人胚肺(HPF)细胞基因表达和基因功能的影响,使用粒径10nmTiO2暴露体外培养的人胚肺细胞24h,提取RNA,应用基因芯片方法,寻找差异表达基因,并对差异基因进行基因本体(GeneOntology,GO)分类.结果表明,纳米TiO2暴露人胚肺细胞,导致514条肺中表达的基因发生差异表达,基因分类显示400条基因涉及生物学过程;415条基因涉及分子学功能;391条基因涉及细胞构成.纳米TiO2作为外界刺激物质,与细胞膜上的受体结合,影响钙、钾离子通道,上调细胞免疫和炎症反应相关的细胞因子TNF、IL1B、IL1A等基因表达.
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关键词
纳米二氧化钛
基因表达
人胚肺细胞
基因芯片
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职称材料
纳米二氧化钛暴露人胚肺细胞差异表达基因相关通路
被引量:
2
2
作者
孟金萍
孙淑华
+4 位作者
王艳蓉
杨旭
吕凤柱
刘云波
张以河
《生态毒理学报》
CAS
CSCD
2009年第4期482-487,共6页
为探讨纳米二氧化钛(Nano-TiO2)对人胚肺(HPF)细胞差异表达基因相关通路的影响,采用半致死浓度(0.437mg·mL-1)的10nmTiO2暴露体外培养的人胚肺细胞24h,提取RNA,应用基因芯片技术筛选差异表达基因,分析纳米TiO2对基因通路的影响.结...
为探讨纳米二氧化钛(Nano-TiO2)对人胚肺(HPF)细胞差异表达基因相关通路的影响,采用半致死浓度(0.437mg·mL-1)的10nmTiO2暴露体外培养的人胚肺细胞24h,提取RNA,应用基因芯片技术筛选差异表达基因,分析纳米TiO2对基因通路的影响.结果表明,纳米TiO2暴露人胚肺细胞,导致514条肺中表达的基因发生差异表达,涉及多个KEGG通路和BioCarta通路.纳米TiO2暴露人胚肺细胞可能产生以下生物学效应:1)众多位于细胞外区域和细胞膜上的基因(特别是细胞膜受体基因)差异表达,对外界环境胁迫产生应激反应;2)与炎症相关的细胞因子基因表达大量改变,调控细胞的炎症反应;3)钙离子通路的膜受体基因差异表达,导致大量钙离子内流,调控钙离子信号传导;4)某些基因的差异表达(如OCLN下调),降低了细胞紧密联接力;5)与造血细胞增殖和分化相关的基因差异表达,刺激产生大量白细胞以抵抗感染.
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关键词
纳米二氧化钛
基因芯片
人胚肺细胞
通路分析
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职称材料
E3泛素连接酶RNF138抑制溃疡性结肠炎的发生及进展
被引量:
1
3
作者
邓博雅
路亚岚
+4 位作者
羽思
张旖垚
黄婧怡
李玥
刘长征
《基础医学与临床》
2023年第6期941-947,共7页
目的研究E3泛素连接酶RNF138在溃疡性结肠炎(UC)中的作用。方法利用GEO数据库分析活动期、缓解期以及经免疫抑制剂治疗后UC样本中RNF138的表达水平;利用RNF138基因敲除小鼠构建UC模型,对模型小鼠进行病理学观察及组织学分析;取小鼠结肠...
目的研究E3泛素连接酶RNF138在溃疡性结肠炎(UC)中的作用。方法利用GEO数据库分析活动期、缓解期以及经免疫抑制剂治疗后UC样本中RNF138的表达水平;利用RNF138基因敲除小鼠构建UC模型,对模型小鼠进行病理学观察及组织学分析;取小鼠结肠组织进行转录组测序,初步探究RNF138敲除促进UC进展的可能机制;利用免疫组化和Western blot检测小鼠结肠组织中RNF138和phospho-NF-κB p65(p-p65)的表达水平;通过qPCR实验检测核因子NF-кB通路靶基因的表达水平;利用免疫组化对临床样本中RNF138和p-p65的表达进行检测。结果GEO数据库及临床样本分析显示,与缓解期相比,活动期UC组织中RNF138表达下调(P<0.05);敲除RNF138促进DSS诱导的UC发生及进展(P<0.05);敲除RNF138促进p-p65及其靶基因表达(P<0.05),提示NF-кB信号通路激活。结论RNF138通过阻断NF-кB通路活化抑制UC发生及进展。
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关键词
RNF138
溃疡性结肠炎
NF-кB
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职称材料
题名
纳米二氧化钛暴露人胚肺细胞差异表达基因分析
被引量:
2
1
作者
孟金萍
刘云波
张以河
孙淑华
王艳蓉
吕凤柱
杨旭
机构
中国医学科学院、北京协和医学院实验动物研究所
中国
地质大学
出处
《生态毒理学报》
CAS
CSCD
2009年第4期475-481,共7页
基金
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目
文摘
为探讨纳米二氧化钛(Nano-TiO2)颗粒对人胚肺(HPF)细胞基因表达和基因功能的影响,使用粒径10nmTiO2暴露体外培养的人胚肺细胞24h,提取RNA,应用基因芯片方法,寻找差异表达基因,并对差异基因进行基因本体(GeneOntology,GO)分类.结果表明,纳米TiO2暴露人胚肺细胞,导致514条肺中表达的基因发生差异表达,基因分类显示400条基因涉及生物学过程;415条基因涉及分子学功能;391条基因涉及细胞构成.纳米TiO2作为外界刺激物质,与细胞膜上的受体结合,影响钙、钾离子通道,上调细胞免疫和炎症反应相关的细胞因子TNF、IL1B、IL1A等基因表达.
关键词
纳米二氧化钛
基因表达
人胚肺细胞
基因芯片
Keywords
Nano-TiO2 particles
gene expression
human pulmonary fibroblast cell
gene chip
分类号
R994.6 [医药卫生—毒理学]
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职称材料
题名
纳米二氧化钛暴露人胚肺细胞差异表达基因相关通路
被引量:
2
2
作者
孟金萍
孙淑华
王艳蓉
杨旭
吕凤柱
刘云波
张以河
机构
中国医学科学院、北京协和医学院实验动物研究所
中国
地质大学
出处
《生态毒理学报》
CAS
CSCD
2009年第4期482-487,共6页
基金
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目
文摘
为探讨纳米二氧化钛(Nano-TiO2)对人胚肺(HPF)细胞差异表达基因相关通路的影响,采用半致死浓度(0.437mg·mL-1)的10nmTiO2暴露体外培养的人胚肺细胞24h,提取RNA,应用基因芯片技术筛选差异表达基因,分析纳米TiO2对基因通路的影响.结果表明,纳米TiO2暴露人胚肺细胞,导致514条肺中表达的基因发生差异表达,涉及多个KEGG通路和BioCarta通路.纳米TiO2暴露人胚肺细胞可能产生以下生物学效应:1)众多位于细胞外区域和细胞膜上的基因(特别是细胞膜受体基因)差异表达,对外界环境胁迫产生应激反应;2)与炎症相关的细胞因子基因表达大量改变,调控细胞的炎症反应;3)钙离子通路的膜受体基因差异表达,导致大量钙离子内流,调控钙离子信号传导;4)某些基因的差异表达(如OCLN下调),降低了细胞紧密联接力;5)与造血细胞增殖和分化相关的基因差异表达,刺激产生大量白细胞以抵抗感染.
关键词
纳米二氧化钛
基因芯片
人胚肺细胞
通路分析
Keywords
Nano-TiO2 particle
microarray
HPF cell
pathway analysis
分类号
R994.6 [医药卫生—毒理学]
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职称材料
题名
E3泛素连接酶RNF138抑制溃疡性结肠炎的发生及进展
被引量:
1
3
作者
邓博雅
路亚岚
羽思
张旖垚
黄婧怡
李玥
刘长征
机构
中国医学科学院
基础
医学
研究所
、北京协和医学院
基础
学院、
生物化学与分子生物学系、
医学
分子生物学国家重点
实验
室
中国医学科学院
、北京协和医学院
医学
实验
动物
研究所
、国家卫生健康委员会人类比较
医学
重点
实验
室
中国医学科学院
、北京协和医学院
北京
协和
医院消化内科
出处
《基础医学与临床》
2023年第6期941-947,共7页
基金
中国医学科学院医学与健康科技创新工程(2022-I2M-JB-003)。
文摘
目的研究E3泛素连接酶RNF138在溃疡性结肠炎(UC)中的作用。方法利用GEO数据库分析活动期、缓解期以及经免疫抑制剂治疗后UC样本中RNF138的表达水平;利用RNF138基因敲除小鼠构建UC模型,对模型小鼠进行病理学观察及组织学分析;取小鼠结肠组织进行转录组测序,初步探究RNF138敲除促进UC进展的可能机制;利用免疫组化和Western blot检测小鼠结肠组织中RNF138和phospho-NF-κB p65(p-p65)的表达水平;通过qPCR实验检测核因子NF-кB通路靶基因的表达水平;利用免疫组化对临床样本中RNF138和p-p65的表达进行检测。结果GEO数据库及临床样本分析显示,与缓解期相比,活动期UC组织中RNF138表达下调(P<0.05);敲除RNF138促进DSS诱导的UC发生及进展(P<0.05);敲除RNF138促进p-p65及其靶基因表达(P<0.05),提示NF-кB信号通路激活。结论RNF138通过阻断NF-кB通路活化抑制UC发生及进展。
关键词
RNF138
溃疡性结肠炎
NF-кB
Keywords
RNF138
ulcerative colitis
NF-кB
分类号
R574 [医药卫生—消化系统]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
纳米二氧化钛暴露人胚肺细胞差异表达基因分析
孟金萍
刘云波
张以河
孙淑华
王艳蓉
吕凤柱
杨旭
《生态毒理学报》
CAS
CSCD
2009
2
下载PDF
职称材料
2
纳米二氧化钛暴露人胚肺细胞差异表达基因相关通路
孟金萍
孙淑华
王艳蓉
杨旭
吕凤柱
刘云波
张以河
《生态毒理学报》
CAS
CSCD
2009
2
下载PDF
职称材料
3
E3泛素连接酶RNF138抑制溃疡性结肠炎的发生及进展
邓博雅
路亚岚
羽思
张旖垚
黄婧怡
李玥
刘长征
《基础医学与临床》
2023
1
下载PDF
职称材料
已选择
0
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参考文献
引证文献
统计分析
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