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广西性病门诊患者泌尿生殖道沙眼衣原体株高分辨多位点测序分型研究
被引量:
2
1
作者
韩燕
尹跃平
+2 位作者
朱邦勇
刘宏业
钟铭英
《中华皮肤科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第10期692-696,共5页
目的:了解广西性病门诊患者中泌尿生殖道沙眼衣原体型别分布,同时对随访患者沙眼衣原体的感染情况进行分析。方法在广西壮族自治区皮肤病防治所收集泌尿生殖道沙眼衣原体感染患者,采集男性尿道和女性宫颈拭子标本,并对初筛阳性患者...
目的:了解广西性病门诊患者中泌尿生殖道沙眼衣原体型别分布,同时对随访患者沙眼衣原体的感染情况进行分析。方法在广西壮族自治区皮肤病防治所收集泌尿生殖道沙眼衣原体感染患者,采集男性尿道和女性宫颈拭子标本,并对初筛阳性患者在治疗完成后进行随访和标本采集,同时采集患者基本信息和临床信息。应用QIAxtractor全自动核酸纯化仪提取DNA,巢式PCR扩增沙眼衣原体主要外膜蛋白基因(ompA)和MLST(高分辨多位点测序分型)所需的CT046(hctB)、CT058、CT144、CT172和CT682(pbpB)5个基因。对PCR产物进行序列测定,经序列比对和MLST型别分析获得菌株的ompA基因分型和型别,并用BioNumerics7软件对广西和意大利沙眼衣原体株绘制最小生成树。结果在44份来自初诊患者和6份来自随访患者的沙眼衣原体阳性样本中,42份成功进行沙眼衣原体ompA和MLST分型。共发现7种ompA基因型和15种hr-MLST分型的ST型别,其中有3种ST型别为首次报道。广西地区沙眼衣原体基因型别较意大利地区具有特征性。6例随访患者经分型方法鉴定3例为再次的新发感染,3例因未能成功进行基因分型而未能确诊。结论广西性病门诊患者感染的沙眼衣原体具有独特的型别,在随访中出现泌尿生殖道沙眼衣原体再感染病例。
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关键词
沙眼衣原体
多位点测序分型
随访研究
聚类分析
原文传递
题名
广西性病门诊患者泌尿生殖道沙眼衣原体株高分辨多位点测序分型研究
被引量:
2
1
作者
韩燕
尹跃平
朱邦勇
刘宏业
钟铭英
机构
中国医学科学院北京协和医学院皮肤病研究所性病参比实验室中国疾病预防控制中心性病控制中心
广西壮族自治区
皮肤病
防治
研究所
中心
实验室
出处
《中华皮肤科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第10期692-696,共5页
基金
北京协和医学院协和青年基金(33320140135)
文摘
目的:了解广西性病门诊患者中泌尿生殖道沙眼衣原体型别分布,同时对随访患者沙眼衣原体的感染情况进行分析。方法在广西壮族自治区皮肤病防治所收集泌尿生殖道沙眼衣原体感染患者,采集男性尿道和女性宫颈拭子标本,并对初筛阳性患者在治疗完成后进行随访和标本采集,同时采集患者基本信息和临床信息。应用QIAxtractor全自动核酸纯化仪提取DNA,巢式PCR扩增沙眼衣原体主要外膜蛋白基因(ompA)和MLST(高分辨多位点测序分型)所需的CT046(hctB)、CT058、CT144、CT172和CT682(pbpB)5个基因。对PCR产物进行序列测定,经序列比对和MLST型别分析获得菌株的ompA基因分型和型别,并用BioNumerics7软件对广西和意大利沙眼衣原体株绘制最小生成树。结果在44份来自初诊患者和6份来自随访患者的沙眼衣原体阳性样本中,42份成功进行沙眼衣原体ompA和MLST分型。共发现7种ompA基因型和15种hr-MLST分型的ST型别,其中有3种ST型别为首次报道。广西地区沙眼衣原体基因型别较意大利地区具有特征性。6例随访患者经分型方法鉴定3例为再次的新发感染,3例因未能成功进行基因分型而未能确诊。结论广西性病门诊患者感染的沙眼衣原体具有独特的型别,在随访中出现泌尿生殖道沙眼衣原体再感染病例。
关键词
沙眼衣原体
多位点测序分型
随访研究
聚类分析
Keywords
Chlamydia trachomatis
Multilocus sequence typing
Follow-up studies
Cluster analysis
分类号
R440 [医药卫生—诊断学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
广西性病门诊患者泌尿生殖道沙眼衣原体株高分辨多位点测序分型研究
韩燕
尹跃平
朱邦勇
刘宏业
钟铭英
《中华皮肤科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016
2
原文传递
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