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我国汉族Vogt-小柳原田综合征患者人类白细胞抗原-DQB1基因启动子区单核苷酸多态性的研究
被引量:
4
1
作者
闵寒毅
牛妮芳
+3 位作者
刘英
张美芬
朱席琳
赵家良
《中华眼科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第10期870-875,共6页
目的探讨我国汉族Vogt-小柳原田综合征患者人类白细胞抗原(HIA)-DQBI基因启动子区单核苷酸多态性(SNP)。方法采用病例一对照研究方法。应用聚合酶链反应·单链构象多态性(PCR-SSCP)-克隆-测序方法检测88例汉族Vogt-小柳原田...
目的探讨我国汉族Vogt-小柳原田综合征患者人类白细胞抗原(HIA)-DQBI基因启动子区单核苷酸多态性(SNP)。方法采用病例一对照研究方法。应用聚合酶链反应·单链构象多态性(PCR-SSCP)-克隆-测序方法检测88例汉族Vogt-小柳原田综合征患者和88例非Vogt-小柳原田综合征正常对照者的HLA-DQB1基因启动子区(QBP)等位基因。使用Chromas软件和Bioedit软件进行序列比对和分析测序结果。应用卡方检验或Fisher精确概率法分别对受试者PCR-SSCP带型、基因频率进行统计分析。结果受试者(患者与正常人)HLA-DQB1基因启动子区(QBP)分为16种聚丙烯酰胺凝胶电泳带型,带型QBPb(对应序列为QBP2.1+77C〉A,X^2=26.01,Pc〈0.001)和QBPI(对应序列为QBP3.3,X^2=16.99,Pc〈0.001)在Vogt-小柳原田综合征患者中出现频率显著高于正常人。而QBPg(对应序列为QBP3.1,X^2=12.10,Pc〈0.05)和QBPn(对应序列为QBP6.1+39G〉A,X^2=14.64,Pc〈0.05)在vost-小柳原田综合征患者中出现频率显著低于正常人。受试者启动子区共存在12种单核苷酸多态性,其中Vogt-小柳原田综合征患者的-189C/A的c等位基因频率显著高于正常人(X^2=45.92,P=0.000),而-227G/A的G等位基因频率低于正常人(X^2=15.63,P=0.000)。结论HLA-DQB1启动子区-189C/A的C等位基因可能是Vogt-小柳原田综合征遗传易感因素,而-227G/A的G等位基因可能是Vogt-小柳原田综合征的遗传保护因素。
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关键词
葡萄膜脑膜脑炎综合征
聚合酶链反应
多态性
单核苷酸
启动区(遗传学)
原文传递
题名
我国汉族Vogt-小柳原田综合征患者人类白细胞抗原-DQB1基因启动子区单核苷酸多态性的研究
被引量:
4
1
作者
闵寒毅
牛妮芳
刘英
张美芬
朱席琳
赵家良
机构
中国医学科学院
北京协和医院眼科
中国医学科学院国家分子生物学重点实验室基础医学研究所
出处
《中华眼科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第10期870-875,共6页
文摘
目的探讨我国汉族Vogt-小柳原田综合征患者人类白细胞抗原(HIA)-DQBI基因启动子区单核苷酸多态性(SNP)。方法采用病例一对照研究方法。应用聚合酶链反应·单链构象多态性(PCR-SSCP)-克隆-测序方法检测88例汉族Vogt-小柳原田综合征患者和88例非Vogt-小柳原田综合征正常对照者的HLA-DQB1基因启动子区(QBP)等位基因。使用Chromas软件和Bioedit软件进行序列比对和分析测序结果。应用卡方检验或Fisher精确概率法分别对受试者PCR-SSCP带型、基因频率进行统计分析。结果受试者(患者与正常人)HLA-DQB1基因启动子区(QBP)分为16种聚丙烯酰胺凝胶电泳带型,带型QBPb(对应序列为QBP2.1+77C〉A,X^2=26.01,Pc〈0.001)和QBPI(对应序列为QBP3.3,X^2=16.99,Pc〈0.001)在Vogt-小柳原田综合征患者中出现频率显著高于正常人。而QBPg(对应序列为QBP3.1,X^2=12.10,Pc〈0.05)和QBPn(对应序列为QBP6.1+39G〉A,X^2=14.64,Pc〈0.05)在vost-小柳原田综合征患者中出现频率显著低于正常人。受试者启动子区共存在12种单核苷酸多态性,其中Vogt-小柳原田综合征患者的-189C/A的c等位基因频率显著高于正常人(X^2=45.92,P=0.000),而-227G/A的G等位基因频率低于正常人(X^2=15.63,P=0.000)。结论HLA-DQB1启动子区-189C/A的C等位基因可能是Vogt-小柳原田综合征遗传易感因素,而-227G/A的G等位基因可能是Vogt-小柳原田综合征的遗传保护因素。
关键词
葡萄膜脑膜脑炎综合征
聚合酶链反应
多态性
单核苷酸
启动区(遗传学)
Keywords
Uveomeningoencephalitic syndrome
Polymerase chain reaction
Polymorphism, single nucleotide
Promoter regions (genetics)
分类号
R686 [医药卫生—骨科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
我国汉族Vogt-小柳原田综合征患者人类白细胞抗原-DQB1基因启动子区单核苷酸多态性的研究
闵寒毅
牛妮芳
刘英
张美芬
朱席琳
赵家良
《中华眼科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2008
4
原文传递
已选择
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