肿瘤中扩增基因的筛选策略

肿瘤基因组中常有大片段的 DNA扩增 ,鉴定这些扩增片段中的基因是寻找与特定肿瘤发生发展密切相关癌基因的策略之一。通过微阵列比较基因组杂交和限制性内切酶标记位点基因组扫描分析等 ,可以发现肿瘤中扩增的 DNA片段 ,其中所包含的扩增的基因及其 m RNA和蛋白水平的变化可采用定量 PCR和组织芯片免疫组织化学等方法加以检测。筛选出与特定肿瘤相关的扩增基因后 ,使用细胞转染、RNA干扰、c DNA芯片或逆转录多重连接依赖的探针扩增等方法进一步研究将有助于明确目的基因在特定肿瘤发生发展中所起的作用。

食管鳞癌FHIT基因等位缺失及其表达下调

背景与目的:食管癌3号染色体短臂(3p14)经常发生缺失或易位,脆性组氨酸三联体基因(fragilehistidinetriad,FHIT)定位于3p14.2,在许多肿瘤中均发现此基因缺失或表达异常。然而,FHIT基因在食管癌中变化的形式以及FHIT改变在食管癌发生、发展中的作用尚未明确。本研究旨在探讨FHIT基因在食管鳞癌中的变化情况及其意义。方法:用微卫星分析方法观察80例食管鳞癌中FHIT基因的缺失,并用半定量逆转录聚合酶链反应法(reversetranscriptase-polymerasechainreaction,RT-PCR)分析其中20例食管鳞癌FHITmRNA表达的变化。结果:FHIT基因内标志D3S3356、D3S3378、D3S3361在本系列的标本中为纯合子。FHIT基因旁侧微卫星位点D3S1234和D3S1540在癌旁组织具有较高的杂合度,信息个体中肿瘤组织的杂合性丢失(lossofheterozygosity,LOH)频率分别为57.69%(30/52)和67.86%(38/56)。在20例同时获得其RNA的标本中,15(75%)例出现FHIT基因的mRNA表达下调,且多发生于DNA水平伴有LOH的病例。但LOH发生与mRNA表达下调并不完全一致。结论:食管癌中FHIT基因频发异常,LOH是FHIT基因表达失调的主要机制,表观遗传学(epigenetic)变化可能与部分食管癌中FHIT基因的表达下调相关。