基于加权基因共表达网络分析鉴定心房颤动发病的关键基因

目的鉴定房颤(AF)发病机制中的关键基因(Hub Gene)。方法从GEO数据库中下载GSE161450作为训练集筛选差异表达基因,并通过系统加权基因共表达网络分析(WGCNA)寻找与AF相关的模块和候选基因。将差异表达基因与WGCNA中的性状模块基因取交集,获取Hub Gene,而后对Hub Gene进行基因功能注解(GO)和蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析。结果共构建8个具有强保守性模块,其中MEbrown模块与AF显著相关,并鉴定出5个Hub Gene,分别为:超极化激活环状核苷酸门控通道2(HCN2)、亲离子型谷氨酸受体5(GRIK5)、乙酰胆碱受体E(CHRNE)、钾向内整流通道亚族J成员2(KCNJ2)和热休克蛋白家族成员2(HSPA2)。此Hub Gene主要聚集于GO:0034702离子通道复合体(ion channel complex),GO:1902495跨膜转运体复合体(transmembrane transporter complex)和GO:1990351转运体复合体(transporter complex)三个通路。结论WGCNA分析鉴定出与AF发病相关的5个Hub Gene可能有助于AF发病机制的阐述。