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文心兰乙烯不敏感基因EIN2的克隆及表达分析
被引量:
2
1
作者
时欢
李蓉
+4 位作者
高玉莹
林玉玲
杜宜殷
赖钟雄
黄鹏林
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第9期1613-1619,共7页
该研究采用PCR、RACE方法,对文心兰‘南茜'的乙烯不敏感蛋白基因(ethylene insensitive 2,EIN2)进行克隆及生物信息学分析,并采用qRT-PCR技术,对该基因在文心兰不同组织器官和不同花期中的表达模式进行分析。结果表明:(1)成功克隆...
该研究采用PCR、RACE方法,对文心兰‘南茜'的乙烯不敏感蛋白基因(ethylene insensitive 2,EIN2)进行克隆及生物信息学分析,并采用qRT-PCR技术,对该基因在文心兰不同组织器官和不同花期中的表达模式进行分析。结果表明:(1)成功克隆得到文心兰EIN2基因序列,命名为OnEIN2(MH497388);该基因cDNA序列全长为4 177bp,其中开放阅读框3 879bp,编码1 292个氨基酸,3′非编码区长208bp,5′非编码区长90bp。(2)生物信息学分析显示OnEIN2是一个不稳定的疏水蛋白,含有跨膜结构,分子式为C6406H9988N1670O1897S47;蛋白质分子量142.22kD,理论等电点5.80。多序列比对和系统进化分析表明,文心兰EIN2与铁皮石斛EIN2的相似度最高(81.98%),二者亲缘关系也最为接近。(3)实时荧光定量PCR分析发现,OnEIN2基因在根、茎、叶花中均有表达,在花中表达量最高,茎中表达量最低;而在不同花期中,盛开期表达量最高,其次是衰老期。研究表明,文心兰OnEIN2基因在开花和衰老过程中可能有重要的作用。
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关键词
文心兰
EIN2
克隆
表达分析
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职称材料
CRISPR/Cas9介导的植物基因编辑技术研究进展
被引量:
12
2
作者
时欢
林玉玲
+2 位作者
赖钟雄
杜宜殷
黄鹏林
《应用与环境生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第3期640-650,共11页
植物在生长与发育过程中,常遭遇物理、化学或生物性逆境,运用基因编辑技术(Genome editing)有机会了解并克服这些威胁.串联间隔短回文重复序列CRISPR/Cas(Clustered regulatory interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associ...
植物在生长与发育过程中,常遭遇物理、化学或生物性逆境,运用基因编辑技术(Genome editing)有机会了解并克服这些威胁.串联间隔短回文重复序列CRISPR/Cas(Clustered regulatory interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated protein)是近几年来新发现的一种基因定点编辑技术,不仅在基因组解析上是阐明基因功能的重要工具,在植物育种上更为划时代的重大突破.CRISPR系统与细菌抵御外源遗传物质入侵的免疫系统有关,目前,应用最多的是Ⅱ型的CRISPR/Cas9,只需核酸酶Cas9和成熟的crRNA:tracrRNA(CRISPR-derived RNA:trans-activating RNA)复合体就可对特定外源DNA序列进行剪切,该技术已经在拟南芥、烟草、大豆、番茄、马铃薯、水稻、小麦、玉米、高粱、矮牵牛、香蕉、甜橙、苹果、毛白杨及地钱等植物中实现了成功编辑,证明了此基因编辑技术的可行性,并达到植物抗逆境、延缓果实成熟、增加杀草剂耐受性、抗病等效果.Cas9和gRNA的启动子与gRNA的靶标数目对基因编辑效率有所影响,值得进一步深入研究.
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关键词
CRISPR/Cas9
sgRNA
植物
基因编辑
碱基突变
编辑效率
原文传递
题名
文心兰乙烯不敏感基因EIN2的克隆及表达分析
被引量:
2
1
作者
时欢
李蓉
高玉莹
林玉玲
杜宜殷
赖钟雄
黄鹏林
机构
福建农林
大学
园艺植物
生物
工程
研究所
台湾
大学
园艺暨景观学系
中国文化大学生物科技研究所
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第9期1613-1619,共7页
基金
福建省重大专项(2015NZ-0002-1)
文摘
该研究采用PCR、RACE方法,对文心兰‘南茜'的乙烯不敏感蛋白基因(ethylene insensitive 2,EIN2)进行克隆及生物信息学分析,并采用qRT-PCR技术,对该基因在文心兰不同组织器官和不同花期中的表达模式进行分析。结果表明:(1)成功克隆得到文心兰EIN2基因序列,命名为OnEIN2(MH497388);该基因cDNA序列全长为4 177bp,其中开放阅读框3 879bp,编码1 292个氨基酸,3′非编码区长208bp,5′非编码区长90bp。(2)生物信息学分析显示OnEIN2是一个不稳定的疏水蛋白,含有跨膜结构,分子式为C6406H9988N1670O1897S47;蛋白质分子量142.22kD,理论等电点5.80。多序列比对和系统进化分析表明,文心兰EIN2与铁皮石斛EIN2的相似度最高(81.98%),二者亲缘关系也最为接近。(3)实时荧光定量PCR分析发现,OnEIN2基因在根、茎、叶花中均有表达,在花中表达量最高,茎中表达量最低;而在不同花期中,盛开期表达量最高,其次是衰老期。研究表明,文心兰OnEIN2基因在开花和衰老过程中可能有重要的作用。
关键词
文心兰
EIN2
克隆
表达分析
Keywords
Oncidesa
EIN2
cloning
expression analysis
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
Q786 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
CRISPR/Cas9介导的植物基因编辑技术研究进展
被引量:
12
2
作者
时欢
林玉玲
赖钟雄
杜宜殷
黄鹏林
机构
福建农林
大学
园艺植物
生物
工程
研究所
台湾
大学
园艺暨景观学系
中国文化大学生物科技研究所
出处
《应用与环境生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第3期640-650,共11页
基金
福建省重大科技专项(2015NZ0002-1)资助~~
文摘
植物在生长与发育过程中,常遭遇物理、化学或生物性逆境,运用基因编辑技术(Genome editing)有机会了解并克服这些威胁.串联间隔短回文重复序列CRISPR/Cas(Clustered regulatory interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated protein)是近几年来新发现的一种基因定点编辑技术,不仅在基因组解析上是阐明基因功能的重要工具,在植物育种上更为划时代的重大突破.CRISPR系统与细菌抵御外源遗传物质入侵的免疫系统有关,目前,应用最多的是Ⅱ型的CRISPR/Cas9,只需核酸酶Cas9和成熟的crRNA:tracrRNA(CRISPR-derived RNA:trans-activating RNA)复合体就可对特定外源DNA序列进行剪切,该技术已经在拟南芥、烟草、大豆、番茄、马铃薯、水稻、小麦、玉米、高粱、矮牵牛、香蕉、甜橙、苹果、毛白杨及地钱等植物中实现了成功编辑,证明了此基因编辑技术的可行性,并达到植物抗逆境、延缓果实成熟、增加杀草剂耐受性、抗病等效果.Cas9和gRNA的启动子与gRNA的靶标数目对基因编辑效率有所影响,值得进一步深入研究.
关键词
CRISPR/Cas9
sgRNA
植物
基因编辑
碱基突变
编辑效率
Keywords
CRISPR/Cas9
sgRNA
plant
gene editing
base mutation
edit efficiency
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
文心兰乙烯不敏感基因EIN2的克隆及表达分析
时欢
李蓉
高玉莹
林玉玲
杜宜殷
赖钟雄
黄鹏林
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
2
下载PDF
职称材料
2
CRISPR/Cas9介导的植物基因编辑技术研究进展
时欢
林玉玲
赖钟雄
杜宜殷
黄鹏林
《应用与环境生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
12
原文传递
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