扁浒苔PCR快速检测方法研究

扁浒苔(Ulva compressa)能够导致绿潮灾害,对其开展快速检测技术研究是预防和控制其危害的重要技术手段。根据石莼属不同种类核糖体基因转录间隔区域(ITS)的序列设计了一对检测扁浒苔的特异性引物,并对其反应条件和体系进行了优化。PCR特异性检测结果表明,供试扁浒苔均扩增出与预期大小相一致的330 bp产物,而对缘管浒苔(Ulva linza)、浒苔(U.prolifera)、曲浒苔(U.flexuosae)、孔石莼(U.pertusa)的检测结果全为阴性。PCR灵敏度试验表明,该PCR体系最低可以检测到10 pg的扁浒苔DNA模板。本快速检测方法为扁浒苔的早期识别与有效治理提供了科学依据,对相关扁浒苔产业和生态学等研究也具有一定参考意义。

人参PR13基因克隆及其蛋白的生物信息学分析

目的:预测分析PR13的结构及功能,方法:使用MEGA X,Expasy-ProtParam,ExPASy-ProtScale,SignaIP-5.0,TMHMM Servery 2.0,InterPro,STRING,SOPMA,Cell-PLoc 2.0及Discovery Studio 2019 Client软件进行分析。结果:结果表明:PR13分子量是8213.73 Da,且为含有信号肽的亲水性蛋白,无跨膜结构;在结构上,以α-螺旋(约38.67%)和不规则卷曲(约44.00%)为主,少量的β-折叠(6.67%)和延长链(10.67%),在系统进化树上与非人参的PR13不在同一分支上。经GO注释后,PR13是其他有机体细胞的清除器,能防御真菌及其他的生物的一种外泌体。结论:该生物信息学分析结果可为人参PR13蛋白与病原菌的互作及非生物胁迫的抗性机理和人参抗胁迫品种的选育和改良提供理论依据。

2010年-2011年山东近海石莼属绿潮藻的种类鉴定

山东近海近年来连续遭遇绿潮危害,绿潮种类组成是否发生变化?尚未有研究加以解决。2010年—2011年,对山东近海海域漂浮藻进行了调查和取样,选取采集的29株漂浮石莼属样品和2株固着石莼属样品,进行了形态学观察,并对其核糖体ITS、叶绿体rbcL基因和5S rDNA间隔序列进行了分子系统发育分析。结果表明,山东近海石莼属绿潮由浒苔U.prolifera、孔石莼U.pertusa和扁浒苔U.compressa共同构成,浒苔是优势绿潮藻种群,其次为孔石莼,扁浒苔发生很少。